PFRMAT DP TARGET T0294 METHOD HHpred1 METHOD Homology-based domain prediction by HMM-HMM comparison. METHOD The target is compared with SCOP (http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop) METHOD and Pfam (http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/) using HHsearch. METHOD ------------- MODEL 1 PARENT d1psda1 1 S - 0.00 2 R - 0.00 3 P - 0.00 4 V - 0.00 5 R - 0.00 6 L - 0.00 7 M - 0.00 8 K - 0.00 9 V - 0.00 10 F - 0.00 11 V - 0.00 12 T - 0.00 13 R - 0.00 14 R - 0.00 15 I - 0.00 16 P - 0.00 17 A - 0.00 18 E - 0.00 19 G - 0.00 20 R - 0.00 21 V - 0.00 22 A - 0.00 23 L - 0.00 24 A - 0.00 25 R - 0.00 26 A - 0.00 27 A - 0.00 28 D - 0.00 29 C - 0.00 30 E - 0.00 31 V - 0.00 32 E - 0.00 33 Q - 0.00 34 W - 0.00 35 D - 0.00 36 S - 0.00 37 D - 0.00 38 E - 0.00 39 P - 0.00 40 I - 0.00 41 P - 0.00 42 A - 0.00 43 K - 0.00 44 E - 0.00 45 L - 0.00 46 E - 0.00 47 R - 0.00 48 G - 0.00 49 V - 0.00 50 A - 0.00 51 G - 0.00 52 A - 0.00 53 H - 0.00 54 G - 0.00 55 L - 0.00 56 L - 0.00 57 C - 0.00 58 L - 0.00 59 L - 0.00 60 S - 0.00 61 D - 0.00 62 H - 0.00 63 V - 0.00 64 D - 0.00 65 K - 0.00 66 R - 0.00 67 I - 0.00 68 L - 0.00 69 D - 0.00 70 A - 0.00 71 A - 0.00 72 G - 0.00 73 A - 0.00 74 N - 0.00 75 L - 0.00 76 K - 0.00 77 V - 0.00 78 I - 0.00 79 S - 0.00 80 T - 0.00 81 M - 0.00 82 S - 0.00 83 V - 0.00 84 G - 0.00 85 I - 0.00 86 D - 0.00 87 H - 0.00 88 L - 0.00 89 A - 0.00 90 L - 0.00 91 D - 0.00 92 E - 0.00 93 I - 0.00 94 K - 0.00 95 K - 0.00 96 R - 0.00 97 G - 0.00 98 I - 0.00 99 R - 0.00 100 V - 0.00 101 G - 0.00 102 Y - 0.00 103 T - 0.00 104 P - 0.00 105 D - 0.00 106 V - 0.00 107 L 1 1.00 108 T 1 1.00 109 D 1 1.00 110 T 1 1.00 111 T 1 1.00 112 A 1 1.00 113 E 1 1.00 114 L 1 1.00 115 A 1 1.00 116 V 1 1.00 117 S 1 1.00 118 L 1 1.00 119 L 1 1.00 120 L 1 1.00 121 T 1 1.00 122 T 1 1.00 123 C 1 1.00 124 R 1 1.00 125 R 1 1.00 126 L 1 1.00 127 P 1 1.00 128 E 1 1.00 129 A 1 1.00 130 I 1 1.00 131 E 1 1.00 132 E 1 1.00 133 V 1 1.00 134 K 1 1.00 135 N 1 1.00 136 G 1 1.00 137 G 1 1.00 138 W 1 1.00 139 T 1 1.00 140 S 1 1.00 141 W 1 1.00 142 K 1 1.00 143 P 1 1.00 144 L 1 1.00 145 W 1 1.00 146 L 1 1.00 147 C 1 1.00 148 G 1 1.00 149 Y 1 1.00 150 G 1 1.00 151 L 1 1.00 152 T 1 1.00 153 Q 1 1.00 154 S 1 1.00 155 T 1 1.00 156 V 1 1.00 157 G 1 1.00 158 I 1 1.00 159 I 1 1.00 160 G 1 1.00 161 L 1 1.00 162 G 1 1.00 163 R 1 1.00 164 I 1 1.00 165 G 1 1.00 166 Q 1 1.00 167 A 1 1.00 168 I 1 1.00 169 A 1 1.00 170 R 1 1.00 171 R 1 1.00 172 L 1 1.00 173 K 1 1.00 174 P 1 1.00 175 F 1 1.00 176 G 1 1.00 177 V 1 1.00 178 Q 1 1.00 179 R 1 1.00 180 F 1 1.00 181 L 1 1.00 182 Y 1 1.00 183 T 1 1.00 184 G 1 1.00 185 R 1 1.00 186 Q 1 1.00 187 P 1 1.00 188 R 1 1.00 189 P 1 1.00 190 E 1 1.00 191 E 1 1.00 192 A 1 1.00 193 A 1 1.00 194 E 1 1.00 195 F 1 1.00 196 Q 1 1.00 197 A 1 1.00 198 E 1 1.00 199 F 1 1.00 200 V 1 1.00 201 S 1 1.00 202 T 1 1.00 203 P 1 1.00 204 E 1 1.00 205 L 1 1.00 206 A 1 1.00 207 A 1 1.00 208 Q 1 1.00 209 S 1 1.00 210 D 1 1.00 211 F 1 1.00 212 I 1 1.00 213 V 1 1.00 214 V 1 1.00 215 A 1 1.00 216 C 1 1.00 217 S 1 1.00 218 L 1 1.00 219 T 1 1.00 220 P 1 1.00 221 A 1 1.00 222 T 1 1.00 223 E 1 1.00 224 G 1 1.00 225 L 1 1.00 226 C 1 1.00 227 N 1 1.00 228 K 1 1.00 229 D 1 1.00 230 F 1 1.00 231 F 1 1.00 232 Q 1 1.00 233 K 1 1.00 234 M 1 1.00 235 K 1 1.00 236 E 1 1.00 237 T 1 1.00 238 A 1 1.00 239 V 1 1.00 240 F 1 1.00 241 I 1 1.00 242 N 1 1.00 243 I 1 1.00 244 S 1 1.00 245 R 1 1.00 246 G 1 1.00 247 D 1 1.00 248 V 1 1.00 249 V 1 1.00 250 N 1 1.00 251 Q 1 1.00 252 D 1 1.00 253 D 1 1.00 254 L 1 1.00 255 Y 1 1.00 256 Q 1 1.00 257 A 1 1.00 258 L 1 1.00 259 A 1 1.00 260 S 1 1.00 261 G 1 1.00 262 K 1 1.00 263 I 1 1.00 264 A 1 1.00 265 A 1 1.00 266 A 1 1.00 267 G 1 1.00 268 L 1 1.00 269 D 1 1.00 270 V 1 1.00 271 T 1 1.00 272 S 1 1.00 273 P 1 1.00 274 E 1 1.00 275 P 1 1.00 276 L 1 1.00 277 P 1 1.00 278 T 1 1.00 279 N 1 1.00 280 H 1 1.00 281 P 1 1.00 282 L 1 1.00 283 L 1 1.00 284 T 1 1.00 285 L 1 1.00 286 K 1 1.00 287 N 1 1.00 288 C 1 1.00 289 V 1 1.00 290 I 1 1.00 291 L 1 1.00 292 P 1 1.00 293 H 1 1.00 294 I 1 1.00 295 G 1 1.00 296 S 1 1.00 297 A 1 1.00 298 T 1 0.97 299 H 1 0.94 300 R 1 0.90 301 T 1 0.87 302 R 1 0.84 303 N 1 0.80 304 T 1 0.77 305 M 1 0.74 306 S 1 0.71 307 L 1 0.67 308 L 1 0.64 309 A 1 0.61 310 A 1 0.57 311 N 1 0.54 312 N 1 0.51 313 L 1 0.48 314 L 1 0.44 315 A 1 0.41 316 G 1 0.38 317 L 1 0.34 318 R 1 0.31 319 G 1 0.28 320 E 1 0.25 321 P 1 0.21 322 M 1 0.18 323 P 1 0.15 324 S 1 0.11 325 E 1 0.08 326 L 1 0.05 327 K 1 0.02 328 L - 0.00 END