PFRMAT DP TARGET T0297 AUTHOR ROBETTA-GINZU METHOD Domain Predictions by GINZU method, based on METHOD scanning for homologs with structures using PSI-BLAST METHOD and 3D-Jury-A1. This is followed by searches for METHOD sequence families with HMM-PFAM and then by PSI-BLAST METHOD multiple sequence clusters. ROBETTA model subsequently METHOD parsed with consensus variant of Taylor's method. METHOD METHOD REFERENCES: METHOD (1) Chivian D, et al. (2003) Proteins 53 Suppl 6:524-33 METHOD (2) Kim DE, et al. (2005) Proteins 61 Suppl 7:193-200 METHOD ------------- MODEL 2 REMARK PARENT 1vyhA_ REMARK PARSRC pdbblast REMARK SCORE 0.97 1 M 1 0.97 2 A 1 0.97 3 V 1 0.97 4 Q 1 0.97 5 L 1 0.97 6 L 1 0.97 7 E 1 0.97 8 N 1 0.97 9 W 1 0.97 10 L 1 0.97 11 L 1 0.97 12 K 1 0.97 13 E 1 0.97 14 Q 1 0.97 15 E 1 0.97 16 K 1 0.97 17 I 1 0.97 18 Q 1 0.97 19 T 1 0.97 20 K 1 0.97 21 Y 1 0.97 22 R 1 0.97 23 H 1 0.97 24 L 1 0.97 25 N 1 0.97 26 H 1 0.97 27 I 1 0.97 28 S 1 0.97 29 V 1 0.97 30 V 1 0.97 31 E 1 0.97 32 P 1 0.97 33 N 1 0.97 34 I 1 0.97 35 L 1 0.97 36 F 1 0.97 37 I 1 0.97 38 G 1 0.97 39 D 1 0.97 40 S 1 0.97 41 I 1 0.97 42 V 1 0.97 43 E 1 0.97 44 Y 1 0.97 45 Y 1 0.97 46 P 1 0.97 47 L 1 0.97 48 Q 1 0.97 49 E 1 0.97 50 L 1 0.97 51 F 1 0.97 52 G 1 0.97 53 T 1 0.97 54 S 1 0.97 55 K 1 0.97 56 T 1 0.97 57 I 1 0.97 58 V 1 0.97 59 N 1 0.97 60 R 1 0.97 61 G 1 0.97 62 I 1 0.97 63 R 1 0.97 64 G 1 0.97 65 Y 1 0.97 66 Q 1 0.97 67 T 1 0.97 68 G 1 0.97 69 L 1 0.97 70 L 1 0.97 71 L 1 0.97 72 E 1 0.97 73 N 1 0.97 74 L 1 0.97 75 D 1 0.97 76 A 1 0.97 77 H 1 0.97 78 L 1 0.97 79 Y 1 0.97 80 G 1 0.97 81 G 1 0.97 82 A 1 0.97 83 V 1 0.97 84 D 1 0.97 85 K 1 0.97 86 I 1 0.97 87 F 1 0.97 88 L 1 0.97 89 L 1 0.97 90 I 1 0.97 91 G 1 0.97 92 T 1 0.97 93 N 1 0.97 94 D 1 0.97 95 I 1 0.97 96 G 1 0.97 97 K 1 0.97 98 D 1 0.97 99 V 1 0.97 100 P 1 0.97 101 V 1 0.97 102 N 1 0.97 103 E 1 0.97 104 A 1 0.97 105 L 1 0.97 106 N 1 0.97 107 N 1 0.97 108 L 1 0.97 109 E 1 0.97 110 A 1 0.97 111 I 1 0.97 112 I 1 0.97 113 Q 1 0.97 114 S 1 0.97 115 V 1 0.97 116 A 1 0.97 117 R 1 0.97 118 D 1 0.97 119 Y 1 0.97 120 P 1 0.97 121 L 1 0.97 122 T 1 0.97 123 E 1 0.97 124 I 1 0.97 125 K 1 0.97 126 L 1 0.97 127 L 1 0.97 128 S 1 0.97 129 I 1 0.97 130 L 1 0.97 131 P 1 0.97 132 V 1 0.97 133 N 1 0.97 134 E 1 0.97 135 R 1 0.97 136 E 1 0.97 137 E 1 0.97 138 Y 1 0.97 139 Q 1 0.97 140 Q 1 0.97 141 A 1 0.97 142 V 1 0.97 143 Y 1 0.97 144 I 1 0.97 145 R 1 0.97 146 S 1 0.97 147 N 1 0.97 148 E 1 0.97 149 K 1 0.97 150 I 1 0.97 151 Q 1 0.97 152 N 1 0.97 153 W 1 0.97 154 N 1 0.97 155 Q 1 0.97 156 A 1 0.97 157 Y 1 0.97 158 Q 1 0.97 159 E 1 0.97 160 L 1 0.97 161 A 1 0.97 162 S 1 0.97 163 A 1 0.97 164 Y 1 0.97 165 M 1 0.97 166 Q 1 0.97 167 V 1 0.97 168 E 1 0.97 169 F 1 0.97 170 V 1 0.97 171 P 1 0.97 172 V 1 0.97 173 F 1 0.97 174 D 1 0.97 175 C 1 0.97 176 L 1 0.97 177 T 1 0.97 178 D 1 0.97 179 Q 1 0.97 180 A 1 0.97 181 G 1 0.97 182 Q 1 0.97 183 L 1 0.97 184 K 1 0.97 185 K 1 0.97 186 E 1 0.97 187 Y 1 0.97 188 T 1 0.97 189 T 1 0.97 190 D 1 0.97 191 G 1 0.97 192 L 1 0.97 193 H 1 0.97 194 L 1 0.97 195 S 1 0.97 196 I 1 0.97 197 A 1 0.97 198 G 1 0.97 199 Y 1 0.97 200 Q 1 0.97 201 A 1 0.97 202 L 1 0.97 203 S 1 0.97 204 K 1 0.97 205 S 1 0.97 206 L 1 0.97 207 K 1 0.97 208 D 1 0.97 209 Y 1 0.97 210 L 1 0.97 211 Y 1 0.97 END