PFRMAT RR TARGET T0320 REMARK PPhdr from servers@predictioncenter.org REMARK PPhdr resp MAIL REMARK PPhdr orig HTML REMARK PPhdr want unk REMARK REMARK REMARK REMARK Result of ProfCon prediction REMARK ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ REMARK REMARK Marco Punta, Burkhard Rost REMARK "Toward Good 2D Predictions in Proteins", submitted REMARK REMARK ________________________________________________________________________________ REMARK REMARK REMARK REMARK REMARK REMARK Number of predicted pairs is equal to 2*L, L protein length REMARK Reference: Punta and Rost, Bioinformatics. 2005;21(13):2960-8 METHOD Feed Forward Neural Network with Back Propagation METHOD ------------- MODEL 1 MQLSKAAEMCYEITNSYLHIDQKSQIIASTQEAIRLTRKY LLSEIFVRWSPLNGEISFSYNGGKDCQVLLLLYLSCLWEY FFIKAQNSQFDFEFQSFPMQRLPTVFIDQEETFPTLENFV LETSERYCLSLYESQRQSGASVNMADAFRDFIKIYPETEA IVIGIRHTDPFGEALKPIQRTDSNWPDFMRLQPLLHWDLT NIWSFLLYSNEPICGLYGKGFTSIGGINNSLPNPHLRKDS NNPALHFEWEIIHAFGKDAEGERSSAINTSPISVVDKERF SKYHDNYYPGWYLVDDTLERAGRIKN 58 105 0 8 0.95 124 131 0 8 0.95 206 212 0 8 0.95 60 66 0 8 0.94 57 105 0 8 0.94 55 101 0 8 0.94 57 103 0 8 0.94 57 104 0 8 0.94 58 104 0 8 0.94 206 213 0 8 0.94 60 68 0 8 0.93 56 102 0 8 0.93 59 68 0 8 0.93 62 68 0 8 0.93 56 103 0 8 0.93 45 68 0 8 0.93 57 102 0 8 0.92 55 102 0 8 0.92 59 105 0 8 0.92 60 67 0 8 0.92 42 72 0 8 0.92 55 103 0 8 0.92 59 106 0 8 0.91 59 67 0 8 0.91 124 130 0 8 0.91 45 70 0 8 0.91 56 104 0 8 0.91 49 56 0 8 0.91 61 67 0 8 0.91 123 129 0 8 0.91 58 106 0 8 0.91 42 76 0 8 0.90 59 107 0 8 0.90 45 69 0 8 0.90 45 67 0 8 0.90 59 104 0 8 0.90 45 72 0 8 0.90 62 109 0 8 0.89 58 107 0 8 0.89 54 103 0 8 0.89 20 26 0 8 0.89 61 68 0 8 0.89 207 213 0 8 0.88 131 160 0 8 0.88 194 202 0 8 0.88 61 109 0 8 0.88 56 105 0 8 0.88 42 73 0 8 0.88 46 58 0 8 0.88 45 58 0 8 0.88 45 73 0 8 0.88 6 45 0 8 0.87 46 72 0 8 0.87 14 27 0 8 0.87 131 161 0 8 0.87 104 160 0 8 0.87 167 173 0 8 0.87 42 70 0 8 0.87 41 72 0 8 0.87 45 76 0 8 0.87 3 44 0 8 0.87 161 189 0 8 0.87 58 70 0 8 0.87 56 101 0 8 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