PFRMAT RR TARGET T0359 REMARK Sequence separation of predicted contacts >= 6. REMARK J. Cheng and P. Baldi Bioinformatics 2005:21(suppl):i75-84 METHOD Augment contact map with beta-residue pairs METHOD ------------- MODEL 1 SMSETFDVELTKNVQGLGITIAGYIGDKKLEPSGIFVKSITKSSAVEHDG RIQIGDQIIAVDGTNLQGFTNQQAVEVLRHTGQTVLLTLMRRGETSV 3 90 0 8 0.107 3 91 0 8 0.101 3 92 0 8 0.130 4 90 0 8 0.154 4 91 0 8 0.162 4 92 0 8 0.133 5 21 0 8 0.134 5 22 0 8 0.332 5 23 0 8 0.387 5 24 0 8 0.315 5 25 0 8 0.161 5 40 0 8 0.108 5 87 0 8 0.133 5 88 0 8 0.215 5 89 0 8 0.241 5 90 0 8 0.240 5 91 0 8 0.153 5 92 0 8 0.116 6 20 0 8 0.131 6 21 0 8 0.355 6 22 0 8 0.593 6 23 0 8 0.611 6 24 0 8 0.400 6 25 0 8 0.132 6 37 0 8 0.104 6 38 0 8 0.101 6 86 0 8 0.101 6 87 0 8 0.107 6 88 0 8 0.186 6 89 0 8 0.192 6 90 0 8 0.198 6 91 0 8 0.157 7 20 0 8 0.232 7 21 0 8 0.508 7 22 0 8 0.645 7 23 0 8 0.494 7 24 0 8 0.173 7 57 0 8 0.111 7 88 0 8 0.105 8 19 0 8 0.314 8 20 0 8 0.533 8 21 0 8 0.759 8 22 0 8 0.731 8 23 0 8 0.363 8 35 0 8 0.118 8 36 0 8 0.138 8 37 0 8 0.161 8 38 0 8 0.125 8 56 0 8 0.102 8 57 0 8 0.123 8 58 0 8 0.150 8 59 0 8 0.139 8 85 0 8 0.142 8 86 0 8 0.159 8 87 0 8 0.199 8 88 0 8 0.164 8 89 0 8 0.138 9 17 0 8 0.144 9 18 0 8 0.279 9 19 0 8 0.434 9 20 0 8 0.683 9 21 0 8 0.719 9 22 0 8 0.397 9 37 0 8 0.106 9 86 0 8 0.117 10 16 0 8 0.148 10 17 0 8 0.503 10 18 0 8 0.648 10 19 0 8 0.829 10 20 0 8 0.754 10 21 0 8 0.594 10 22 0 8 0.148 10 35 0 8 0.130 10 36 0 8 0.132 10 37 0 8 0.130 10 58 0 8 0.119 10 59 0 8 0.101 10 85 0 8 0.140 10 86 0 8 0.131 10 87 0 8 0.137 10 88 0 8 0.116 10 89 0 8 0.106 11 17 0 8 0.807 11 18 0 8 0.727 11 19 0 8 0.776 11 20 0 8 0.452 11 21 0 8 0.163 11 85 0 8 0.106 12 18 0 8 0.731 12 19 0 8 0.426 12 20 0 8 0.112 12 46 0 8 0.100 13 19 0 8 0.242 13 20 0 8 0.138 13 45 0 8 0.109 16 40 0 8 0.100 16 41 0 8 0.116 17 37 0 8 0.103 17 38 0 8 0.122 17 39 0 8 0.189 17 40 0 8 0.238 17 41 0 8 0.213 17 89 0 8 0.132 17 90 0 8 0.109 18 36 0 8 0.121 18 37 0 8 0.190 18 38 0 8 0.229 18 39 0 8 0.234 18 40 0 8 0.237 18 41 0 8 0.177 18 57 0 8 0.141 18 58 0 8 0.140 18 87 0 8 0.108 18 88 0 8 0.114 18 89 0 8 0.113 19 35 0 8 0.164 19 36 0 8 0.239 19 37 0 8 0.353 19 38 0 8 0.302 19 39 0 8 0.245 19 40 0 8 0.236 19 41 0 8 0.122 19 56 0 8 0.215 19 57 0 8 0.230 19 58 0 8 0.203 19 59 0 8 0.210 19 60 0 8 0.105 19 61 0 8 0.115 19 85 0 8 0.131 19 86 0 8 0.150 19 87 0 8 0.186 19 88 0 8 0.190 19 89 0 8 0.173 19 90 0 8 0.127 20 35 0 8 0.204 20 36 0 8 0.317 20 37 0 8 0.344 20 38 0 8 0.318 20 39 0 8 0.201 20 40 0 8 0.138 20 57 0 8 0.162 20 58 0 8 0.128 20 59 0 8 0.155 20 85 0 8 0.124 20 86 0 8 0.162 20 87 0 8 0.159 20 88 0 8 0.167 20 89 0 8 0.138 21 30 0 8 0.120 21 33 0 8 0.127 21 34 0 8 0.160 21 35 0 8 0.363 21 36 0 8 0.396 21 37 0 8 0.386 21 38 0 8 0.241 21 39 0 8 0.131 21 40 0 8 0.142 21 57 0 8 0.106 21 58 0 8 0.180 21 59 0 8 0.234 21 60 0 8 0.150 21 61 0 8 0.168 21 85 0 8 0.174 21 86 0 8 0.176 21 87 0 8 0.216 21 88 0 8 0.180 21 89 0 8 0.159 22 28 0 8 0.139 22 29 0 8 0.164 22 30 0 8 0.338 22 31 0 8 0.163 22 32 0 8 0.140 22 33 0 8 0.260 22 34 0 8 0.276 22 35 0 8 0.360 22 36 0 8 0.306 22 37 0 8 0.266 22 38 0 8 0.136 22 57 0 8 0.101 22 58 0 8 0.137 22 59 0 8 0.157 22 60 0 8 0.162 22 61 0 8 0.162 22 85 0 8 0.140 22 86 0 8 0.134 22 87 0 8 0.140 22 88 0 8 0.113 22 89 0 8 0.105 23 29 0 8 0.301 23 30 0 8 0.435 23 31 0 8 0.263 23 32 0 8 0.346 23 33 0 8 0.469 23 34 0 8 0.278 23 35 0 8 0.188 23 36 0 8 0.175 23 37 0 8 0.135 24 30 0 8 0.496 24 31 0 8 0.276 24 32 0 8 0.365 24 33 0 8 0.426 24 34 0 8 0.329 24 35 0 8 0.132 24 36 0 8 0.131 24 37 0 8 0.103 25 31 0 8 0.200 25 32 0 8 0.275 25 33 0 8 0.229 25 34 0 8 0.109 25 35 0 8 0.102 26 32 0 8 0.249 26 33 0 8 0.164 29 35 0 8 0.115 30 36 0 8 0.189 34 90 0 8 0.124 35 57 0 8 0.109 35 58 0 8 0.137 35 59 0 8 0.156 35 61 0 8 0.180 35 85 0 8 0.110 35 86 0 8 0.113 35 87 0 8 0.168 35 88 0 8 0.167 35 89 0 8 0.179 35 90 0 8 0.158 36 55 0 8 0.254 36 56 0 8 0.110 36 57 0 8 0.136 36 58 0 8 0.177 36 59 0 8 0.191 36 60 0 8 0.139 36 61 0 8 0.189 36 85 0 8 0.132 36 86 0 8 0.142 36 87 0 8 0.202 36 88 0 8 0.207 36 89 0 8 0.188 36 90 0 8 0.116 37 54 0 8 0.107 37 55 0 8 0.222 37 56 0 8 0.210 37 57 0 8 0.150 37 58 0 8 0.259 37 59 0 8 0.268 37 60 0 8 0.176 37 61 0 8 0.197 37 85 0 8 0.196 37 86 0 8 0.217 37 87 0 8 0.271 37 88 0 8 0.249 37 89 0 8 0.203 37 90 0 8 0.104 38 57 0 8 0.176 38 58 0 8 0.239 38 59 0 8 0.205 38 60 0 8 0.145 38 61 0 8 0.126 38 85 0 8 0.158 38 86 0 8 0.183 38 87 0 8 0.184 38 88 0 8 0.171 38 89 0 8 0.120 39 45 0 8 0.130 39 46 0 8 0.190 39 47 0 8 0.168 39 57 0 8 0.137 39 58 0 8 0.165 39 59 0 8 0.144 39 60 0 8 0.199 39 85 0 8 0.113 39 86 0 8 0.131 39 87 0 8 0.106 40 46 0 8 0.337 40 47 0 8 0.123 40 56 0 8 0.123 40 57 0 8 0.202 40 58 0 8 0.234 40 59 0 8 0.171 40 61 0 8 0.165 40 85 0 8 0.174 40 86 0 8 0.139 40 87 0 8 0.138 40 88 0 8 0.102 41 47 0 8 0.115 41 52 0 8 0.116 41 56 0 8 0.158 41 57 0 8 0.141 41 58 0 8 0.117 43 53 0 8 0.193 44 50 0 8 0.101 44 52 0 8 0.161 44 53 0 8 0.196 44 54 0 8 0.390 44 56 0 8 0.158 45 51 0 8 0.252 45 52 0 8 0.428 45 53 0 8 0.347 45 54 0 8 0.234 45 55 0 8 0.156 45 56 0 8 0.151 46 52 0 8 0.676 46 53 0 8 0.304 46 54 0 8 0.187 46 56 0 8 0.132 47 53 0 8 0.240 50 56 0 8 0.153 50 57 0 8 0.109 51 57 0 8 0.120 52 58 0 8 0.227 52 59 0 8 0.161 55 71 0 8 0.143 57 66 0 8 0.171 57 67 0 8 0.287 57 84 0 8 0.404 57 87 0 8 0.123 57 88 0 8 0.136 57 89 0 8 0.160 57 90 0 8 0.159 58 65 0 8 0.194 58 66 0 8 0.509 58 67 0 8 0.466 58 68 0 8 0.158 58 85 0 8 0.267 58 86 0 8 0.181 58 87 0 8 0.230 58 88 0 8 0.215 58 89 0 8 0.193 58 90 0 8 0.103 59 65 0 8 0.598 59 66 0 8 0.789 59 67 0 8 0.616 59 68 0 8 0.197 59 69 0 8 0.195 59 84 0 8 0.106 59 85 0 8 0.258 59 86 0 8 0.250 59 87 0 8 0.310 59 88 0 8 0.261 59 89 0 8 0.164 60 66 0 8 0.720 60 67 0 8 0.169 60 84 0 8 0.118 60 85 0 8 0.162 60 86 0 8 0.238 60 87 0 8 0.249 60 88 0 8 0.240 60 89 0 8 0.117 61 67 0 8 0.153 61 69 0 8 0.137 61 85 0 8 0.229 61 86 0 8 0.213 61 87 0 8 0.290 61 88 0 8 0.310 61 89 0 8 0.244 61 90 0 8 0.170 62 86 0 8 0.158 62 87 0 8 0.161 62 88 0 8 0.236 62 89 0 8 0.241 62 90 0 8 0.234 62 91 0 8 0.120 63 86 0 8 0.105 63 87 0 8 0.117 63 88 0 8 0.174 63 89 0 8 0.172 63 90 0 8 0.206 63 91 0 8 0.175 64 88 0 8 0.127 64 89 0 8 0.148 64 90 0 8 0.172 64 91 0 8 0.185 65 89 0 8 0.127 65 90 0 8 0.125 65 91 0 8 0.129 66 74 0 8 0.190 66 87 0 8 0.133 66 88 0 8 0.131 66 89 0 8 0.133 66 90 0 8 0.146 66 91 0 8 0.138 67 88 0 8 0.109 67 89 0 8 0.103 67 90 0 8 0.112 69 75 0 8 0.127 75 85 0 8 0.285 77 85 0 8 0.163 78 84 0 8 0.389 78 85 0 8 0.472 78 86 0 8 0.124 79 85 0 8 0.249 89 97 0 8 0.171 90 96 0 8 0.132 90 97 0 8 0.204 91 97 0 8 0.138 END