
PFRMAT FRV1
REMARK ========================================================================
REMARK Threading results for the target T0014, compared against a monomer
REMARK database containing 56 single-domain monomers. The scores reported are based
REMARK on the MRF singleton-only score function of White, Muchnik and Smith,
REMARK the search algorithm of Lathrop and Smith, and the Bayesian recognition
REMARK method of Lathrop, Rogers, Smith and White.  The same applies to the alignments.
REMARK ========================================================================
AUTHOR 6711-5792-4778 R. H. Lathrop, R. G. Rogers Jr., T. F. Smith, J. V. White
AUTHOR 6711-5792-4778 rickl@uci.edu, {rogers|tsmith}@darwin.bu.edu, jvwhite@tasc.com
REMARK ========================================================================
SEQRES T0014 MKTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVD
SEQRES T0014 HFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTL
SEQRES T0014 NRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPS
SEQRES T0014 AEEMVSRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPV
SEQRES T0014 ITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKQASAPGQIAVNDLRSVLMILH
SEQRES T0014 NA
REMARK ========================================================================
TSCORE T0014 0 0.7615953 2HAD - 1
REMARK not-the-T-SCORE T0014 0 0.14841685 5TMN - 1
TSCORE T0014 0 0.042138062 1APA - 1
TSCORE T0014 0 0.034390487 1NAR - 1
TSCORE T0014 0 0.0044154017 1DHR - 1
TSCORE T0014 0 0.0027401936 1S01 - 1
TSCORE T0014 0 0.0015229806 1MAT - 1
TSCORE T0014 0 0.0012362676 5CPA - 1
TSCORE T0014 0 7.851527e-4 1BYH - 1
TSCORE T0014 0 6.3058645e-4 2CYP - 1
TSCORE T0014 0 3.545116e-4 1CDE - 1
TSCORE T0014 0 3.4113306e-4 2ACT - 1
TSCORE T0014 0 2.2183906e-4 1LEC - 1
TSCORE T0014 0 1.9824414e-4 2LZM - 1
TSCORE T0014 0 1.9770737e-4 1BAA - 1
TSCORE T0014 0 1.8190481e-4 4TGL - 1
TSCORE T0014 0 1.5773061e-4 3EST - 1
TSCORE T0014 0 7.9578686e-5 3ADK - 1
TSCORE T0014 0 7.535553e-5 1REC - 1
TSCORE T0014 0 4.421791e-5 2CA2 - 1
TSCORE T0014 0 4.344355e-5 3FXN - 1
TSCORE T0014 0 3.5466793e-5 1TIE - 1
TSCORE T0014 0 3.0581766e-5 8DFR - 1
TSCORE T0014 0 2.9897398e-5 1PKP - 1
TSCORE T0014 0 1.8697403e-5 2CPL - 1
TSCORE T0014 0 1.7481592e-5 1IFC - 1
TSCORE T0014 0 1.7446697e-5 1AEP - 1
TSCORE T0014 0 1.6603939e-5 4FGF - 1
TSCORE T0014 0 1.4069897e-5 1MBD - 1
TSCORE T0014 0 9.97397e-6 1F3G - 1
TSCORE T0014 0 7.589742e-6 2MCM - 1
TSCORE T0014 0 7.370992e-6 3CHY - 1
TSCORE T0014 0 6.2839824e-6 1BGC - 1
TSCORE T0014 0 5.350131e-6 7RSA - 1
TSCORE T0014 0 2.9425672e-6 256B A 1
TSCORE T0014 0 2.5418782e-6 1BP2 - 1
TSCORE T0014 0 2.4148045e-6 2SNS - 1
TSCORE T0014 0 1.801451e-6 1AAK - 1
TSCORE T0014 0 1.2314341e-6 2MHR - 1
TSCORE T0014 0 1.2140512e-6 1LIS - 1
TSCORE T0014 0 1.1895549e-6 9RNT - 1
TSCORE T0014 0 7.615301e-7 1RCB - 1
REMARK not-the-T-SCORE T0014 0 6.233614e-7 1CEW - 1
TSCORE T0014 0 2.3683374e-7 1YAT - 1
TSCORE T0014 0 2.0228374e-7 1HOE - 1
TSCORE T0014 0 1.9295551e-7 5CPV - 1
TSCORE T0014 0 1.3962154e-7 1ALC - 1
TSCORE T0014 0 1.3686551e-7 1PLC - 1
TSCORE T0014 0 1.2542623e-7 2HPR - 1
REMARK not-the-T-SCORE T0014 0 1.1476157e-7 9API - 1
TSCORE T0014 0 1.11373864e-7 1UBQ - 1
TSCORE T0014 0 7.365552e-8 5CYT R 1
TSCORE T0014 0 6.9184417e-8 1ABA - 1
TSCORE T0014 0 5.148398e-8 351C - 1
TSCORE T0014 0 3.745082e-8 5FD1 - 1
TSCORE T0014 0 0.0 2CPP - 1
REMARK ========================================================================
TALIGN T0014 0 2 6 2HAD - 1 21 25 0.021446628 1
TALIGN T0014 0 9 14 2HAD - 1 36 41 0.021446628 1
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TALIGN T0014 0 34 43 2HAD - 1 63 72 0.021446628 1
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TALIGN T0014 0 58 71 2HAD - 1 99 112 0.021446628 1
TALIGN T0014 0 77 81 2HAD - 1 118 122 0.021446628 1
TALIGN T0014 0 92 97 2HAD - 1 125 130 0.021446628 1
TALIGN T0014 0 100 106 2HAD - 1 141 147 0.021446628 1
TALIGN T0014 0 112 117 2HAD - 1 159 164 0.021446628 1
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TALIGN T0014 0 224 228 2HAD - 1 280 284 0.021446628 1
TALIGN T0014 0 237 248 2HAD - 1 294 305 0.021446628 1
REMARK ========================================================================
TALIGN T0014 0 2 6 2HAD - 1 21 25 0.019289277 2
TALIGN T0014 0 9 14 2HAD - 1 36 41 0.019289277 2
TALIGN T0014 0 18 23 2HAD - 1 49 54 0.019289277 2
TALIGN T0014 0 34 43 2HAD - 1 63 72 0.019289277 2
TALIGN T0014 0 49 53 2HAD - 1 76 80 0.019289277 2
TALIGN T0014 0 58 71 2HAD - 1 99 112 0.019289277 2
TALIGN T0014 0 77 81 2HAD - 1 118 122 0.019289277 2
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REMARK ========================================================================
TALIGN T0014 0 2 6 2HAD - 1 21 25 0.017211827 3
TALIGN T0014 0 9 14 2HAD - 1 36 41 0.017211827 3
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TALIGN T0014 0 34 43 2HAD - 1 63 72 0.017211827 3
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TALIGN T0014 0 237 248 2HAD - 1 294 305 0.017211827 3
REMARK ========================================================================
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TALIGN T0014 0 224 228 2HAD - 1 280 284 0.016652772 4
TALIGN T0014 0 237 248 2HAD - 1 294 305 0.016652772 4
REMARK ========================================================================
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REMARK ========================================================================
TALIGN T0014 0 2 6 2HAD - 1 21 25 0.013756847 7
TALIGN T0014 0 9 14 2HAD - 1 36 41 0.013756847 7
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STRSUB 1F3G - 1 123 130
STRSUB 1F3G - 1 136 141
STRSUB 1F3G - 1 148 152
STRSUB 1F3G - 1 154 156
STRSUB 1F3G - 1 163 167
REMARK ========================================================================
STRSUB 2MCM - 1 1 7
STRSUB 2MCM - 1 16 24
STRSUB 2MCM - 1 29 40
STRSUB 2MCM - 1 43 46
STRSUB 2MCM - 1 51 56
STRSUB 2MCM - 1 60 68
STRSUB 2MCM - 1 71 76
STRSUB 2MCM - 1 80 88
STRSUB 2MCM - 1 92 99
STRSUB 2MCM - 1 103 112
REMARK ========================================================================
STRSUB 3CHY - 1 7 11
STRSUB 3CHY - 1 15 26
STRSUB 3CHY - 1 32 36
STRSUB 3CHY - 1 39 46
STRSUB 3CHY - 1 53 57
STRSUB 3CHY - 1 65 73
STRSUB 3CHY - 1 82 87
STRSUB 3CHY - 1 92 99
STRSUB 3CHY - 1 106 108
STRSUB 3CHY - 1 113 125
REMARK ========================================================================
STRSUB 1BGC - 1 12 40
STRSUB 1BGC - 1 72 92
STRSUB 1BGC - 1 101 125
STRSUB 1BGC - 1 144 170
REMARK ========================================================================
STRSUB 7RSA - 1 3 13
STRSUB 7RSA - 1 24 34
STRSUB 7RSA - 1 41 47
STRSUB 7RSA - 1 50 58
STRSUB 7RSA - 1 61 64
STRSUB 7RSA - 1 71 75
STRSUB 7RSA - 1 79 87
STRSUB 7RSA - 1 96 103
STRSUB 7RSA - 1 106 112
STRSUB 7RSA - 1 115 124
REMARK ========================================================================
STRSUB 256B A 1 3 19
STRSUB 256B A 1 23 40
STRSUB 256B A 1 46 48
STRSUB 256B A 1 56 80
STRSUB 256B A 1 84 105
REMARK ========================================================================
STRSUB 1BP2 - 1 1 13
STRSUB 1BP2 - 1 39 65
STRSUB 1BP2 - 1 74 78
STRSUB 1BP2 - 1 81 85
STRSUB 1BP2 - 1 89 108
REMARK ========================================================================
STRSUB 2SNS - 1 12 19
STRSUB 2SNS - 1 21 27
STRSUB 2SNS - 1 30 35
STRSUB 2SNS - 1 55 67
STRSUB 2SNS - 1 71 75
STRSUB 2SNS - 1 91 95
STRSUB 2SNS - 1 99 106
STRSUB 2SNS - 1 122 134
REMARK ========================================================================
STRSUB 1AAK - 1 8 13
STRSUB 1AAK - 1 24 29
STRSUB 1AAK - 1 35 42
STRSUB 1AAK - 1 51 58
STRSUB 1AAK - 1 69 72
STRSUB 1AAK - 1 102 114
STRSUB 1AAK - 1 124 132
STRSUB 1AAK - 1 135 147
REMARK ========================================================================
STRSUB 2MHR - 1 19 37
STRSUB 2MHR - 1 41 64
STRSUB 2MHR - 1 71 84
STRSUB 2MHR - 1 93 108
REMARK ========================================================================
STRSUB 1LIS - 1 13 38
STRSUB 1LIS - 1 44 74
STRSUB 1LIS - 1 82 95
STRSUB 1LIS - 1 99 107
STRSUB 1LIS - 1 116 123
REMARK ========================================================================
STRSUB 9RNT - 1 4 6
STRSUB 9RNT - 1 9 11
STRSUB 9RNT - 1 14 29
STRSUB 9RNT - 1 39 42
STRSUB 9RNT - 1 55 62
STRSUB 9RNT - 1 76 81
STRSUB 9RNT - 1 85 91
STRSUB 9RNT - 1 100 103
REMARK ========================================================================
STRSUB 1RCB - 1 4 19
STRSUB 1RCB - 1 40 60
STRSUB 1RCB - 1 70 94
STRSUB 1RCB - 1 109 126
REMARK ========================================================================
REMARK not-the-S-TRSUB 1CEW - 1 19 33
REMARK not-the-S-TRSUB 1CEW - 1 41 54
REMARK not-the-S-TRSUB 1CEW - 1 58 69
REMARK not-the-S-TRSUB 1CEW - 1 78 85
REMARK not-the-S-TRSUB 1CEW - 1 92 102
REMARK not-the-S-TRSUB 1CEW - 1 107 115
REMARK ========================================================================
STRSUB 1YAT - 1 -4 -3
STRSUB 1YAT - 1 3 8
STRSUB 1YAT - 1 19 30
STRSUB 1YAT - 1 35 38
STRSUB 1YAT - 1 46 50
STRSUB 1YAT - 1 69 77
STRSUB 1YAT - 1 96 106
REMARK ========================================================================
STRSUB 1HOE - 1 11 16
STRSUB 1HOE - 1 20 26
STRSUB 1HOE - 1 30 37
STRSUB 1HOE - 1 41 48
STRSUB 1HOE - 1 52 57
STRSUB 1HOE - 1 67 73
REMARK ========================================================================
STRSUB 5CPV - 1 8 17
STRSUB 5CPV - 1 26 33
STRSUB 5CPV - 1 40 50
STRSUB 5CPV - 1 79 89
STRSUB 5CPV - 1 99 107
REMARK ========================================================================
STRSUB 1ALC - 1 5 11
STRSUB 1ALC - 1 23 34
STRSUB 1ALC - 1 40 43
STRSUB 1ALC - 1 47 50
STRSUB 1ALC - 1 76 82
STRSUB 1ALC - 1 86 99
REMARK ========================================================================
STRSUB 1PLC - 1 1 6
STRSUB 1PLC - 1 17 21
STRSUB 1PLC - 1 26 32
STRSUB 1PLC - 1 67 73
STRSUB 1PLC - 1 78 84
STRSUB 1PLC - 1 92 98
REMARK ========================================================================
STRSUB 2HPR - 1 4 7
STRSUB 2HPR - 1 16 26
STRSUB 2HPR - 1 32 37
STRSUB 2HPR - 1 40 43
STRSUB 2HPR - 1 60 66
STRSUB 2HPR - 1 70 84
REMARK ========================================================================
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 21 45
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 53 67
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 70 81
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 88 105
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 110 122
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 128 137
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 141 146
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 150 166
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 181 193
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 220 225
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 228 233
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 236 244
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 248 255
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 284 288
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 291 299
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 327 341
REMARK not-the-S-TRSUB 9API - 1 344 358
REMARK ========================================================================
STRSUB 1UBQ - 1 1 7
STRSUB 1UBQ - 1 11 17
STRSUB 1UBQ - 1 23 34
STRSUB 1UBQ - 1 40 45
STRSUB 1UBQ - 1 64 72
REMARK ========================================================================
STRSUB 5CYT R 1 2 14
STRSUB 5CYT R 1 49 55
STRSUB 5CYT R 1 60 67
STRSUB 5CYT R 1 70 75
STRSUB 5CYT R 1 87 102
REMARK ========================================================================
STRSUB 1ABA - 1 2 6
STRSUB 1ABA - 1 15 26
STRSUB 1ABA - 1 31 35
STRSUB 1ABA - 1 45 55
STRSUB 1ABA - 1 67 69
STRSUB 1ABA - 1 75 77
STRSUB 1ABA - 1 79 85
REMARK ========================================================================
STRSUB 351C - 1 3 9
STRSUB 351C - 1 27 33
STRSUB 351C - 1 40 49
STRSUB 351C - 1 68 80
REMARK ========================================================================
STRSUB 5FD1 - 1 2 4
STRSUB 5FD1 - 1 25 27
STRSUB 5FD1 - 1 32 34
STRSUB 5FD1 - 1 54 56
STRSUB 5FD1 - 1 66 77
REMARK ========================================================================
STRSUB 2CPP - 1 37 46
STRSUB 2CPP - 1 52 57
STRSUB 2CPP - 1 60 65
STRSUB 2CPP - 1 68 77
STRSUB 2CPP - 1 89 96
STRSUB 2CPP - 1 106 119
STRSUB 2CPP - 1 122 143
STRSUB 2CPP - 1 147 150
STRSUB 2CPP - 1 161 168
STRSUB 2CPP - 1 173 185
STRSUB 2CPP - 1 192 214
STRSUB 2CPP - 1 218 225
STRSUB 2CPP - 1 234 265
STRSUB 2CPP - 1 268 276
STRSUB 2CPP - 1 280 292
STRSUB 2CPP - 1 295 301
STRSUB 2CPP - 1 315 323
STRSUB 2CPP - 1 359 378
STRSUB 2CPP - 1 389 393
STRSUB 2CPP - 1 397 405
REMARK ========================================================================
REMARK END OF PREDICTION FILE FOR T0014.
REMARK ========================================================================

