
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  4
PARENT 2sqc_A
I   2    E   20
D   3    Y   21
L   4    L   22
S   5    L   23
K   6    S   24
T   7    C   25
V   8    Q   26
F   9    K   27
Y  10    D   28
T  11    E   29
S  12    G   30
I  13    Y   31
D  14    W   32
I  15    W   33
G  16    G   34
S  17    P   35
R  18    L   36
Y  19    L   37
I  20    S   38
K  21    N   39
G  22    V   40
L  23    T   41
V  24    M   42
L  25    E   43
G  26    A   44
K  27    E   45
E  31    R   60
W  32    M   61
E  33    E   62
A  34    K   63
L  35    I   64
A  36    R   65
F  37    R   66
K  41    L   69
S  42    H   70
R  43    E   71
G  44    Q   72
L  45    R   73
D  46    E   74
E  47    D   75
G  48    G   76
E  49    T   77
I  50    W   78
K  51    A   79
D  52    L   80
A  53    Y   81
I  54    P   82
A  55    G   83
F  56    G   84
K  57    P   85
E  58    P   86
S  59    D   87
V  60    L   88
N  61    D   89
T  62    T   90
L  63    T   91
L  64    I   92
K  65    E   93
E  66    A   94
L  67    Y   95
E  68    V   96
E  69    A   97
Q  70    L   98
L  71    K   99
Q  72    Y  100
K  73    I  101
S  74    G  102
L  75    M  103
R  76    S  104
S  77    R  105
S  82    E  108
V  86    Q  111
S  87    K  112
F  88    A  113
E  89    L  114
R  90    R  115
E  91    F  116
D  92    I  117
T  93    Q  118
V  94    S  119
I  95    Q  120
E  96    G  121
R  97    G  122
D  98    I  123
F  99    E  124
G 100    S  125
E 101    S  126
E 102    R  127
K 103    V  128
R 104    F  129
D 109    R  171
I 110    A  172
L 111    T  173
S 112    V  174
E 113    V  175
M 114    A  176
Q 115    L  177
S 116    S  178
E 117    I  179
A 118    V  180
L 119    M  181
E 120    S  182
K 121    R  183
L 122    Q  184
K 123    P  185
E 124    V  186
N 125    F  187
G 126    P  188
K 127    L  189
T 128    P  190
P 129    E  191
L 130    R  192
H 131    A  193
I 132    R  194
F 133    V  195
S 134    P  196
K 135    E  197
R 136    L  198
Y 137    Y  199
L 138    E  200
L 139    T  201
D 140    D  202
D 141    V  203
E 142    P  204
R 143    P  205
I 144    R  206
V 145    R  207
F 146    R  208
N 147    G  209
P 148    A  210
L 149    K  211
D 150    G  212
M 151    G  213
K 152    G  214
A 153    G  215
S 154    W  216
K 155    I  217
I 156    F  218
A 157    D  219
I 158    A  220
E 159    L  221
Y 160    D  222
V 164    Y  228
V 165    Q  229
P 166    K  230
L 167    L  231
K 168    S  232
V 169    V  233
Y 170    H  234
E 171    P  235
M 172    F  236
F 173    R  237
Y 174    R  238
N 175    A  239
F 176    A  240
L 177    E  241
Q 178    I  242
D 179    R  243
T 180    A  244
V 181    L  245
K 182    D  246
K 188    K  273
S 189    I  274
S 190    L  275
L 191    D  276
V 192    M  277
S 193    T  278
T 194    Q  279
A 195    H  280
E 196    P  281
G 197    A  282
T 201    K  285
P 202    G  286
E 203    W  287
K 204    E  288
D 205    G  289
R 206    L  290
G 207    E  291
V 208    L  292
V 209    Y  293
V 210    G  294
V 211    V  295
N 212    E  296
L 213    L  297
G 214    D  298
Y 215    Y  299
N 216    G  300
F 217    G  301
T 218    W  302
G 219    M  303
L 220    F  304
I 221    Q  305
A 222    A  306
Y 223    S  307
K 224    I  308
N 225    S  309
G 226    P  310
V 227    V  311
P 228    W  312
I 229    D  313
K 230    T  314
I 231    G  315
S 232    L  316
Y 233    A  317
V 234    V  318
P 235    L  319
V 236    A  320
G 237    L  321
M 238    R  322
K 239    A  323
H 240    A  324
V 241    G  325
I 242    L  326
K 243    P  327
D 244    A  328
V 245    D  329
S 246    H  330
A 247    D  331
V 248    R  332
L 249    L  333
D 250    V  334
T 251    K  335
S 252    A  336
F 253    G  337
E 254    E  338
E 255    W  339
S 256    L  340
E 257    L  341
R 258    D  342
L 259    R  343
I 260    Q  344
I 261    I  345
T 262    T  346
H 263    V  347
G 264    P  348
N 265    G  349
A 266    D  350
V 267    W  351
Y 268    A  352
N 269    V  353
D 270    K  354
L 271    R  355
K 272    P  356
E 273    N  357
E 274    L  358
E 275    K  359
I 276    P  360
Q 277    G  361
Y 278    G  362
R 279    F  363
G 280    A  364
L 281    F  365
D 282    Q  366
G 283    F  367
N 284    D  368
T 285    N  369
I 286    V  370
K 287    Y  371
T 288    Y  372
T 289    P  373
T 290    D  374
A 291    V  375
K 292    C  376
K 293    D  377
L 294    T  378
S 295    A  379
V 296    V  380
I 297    V  381
I 298    V  382
H 299    W  383
A 300    A  384
R 301    L  385
L 302    N  386
R 303    T  387
S 309    A  399
F 313    R  405
E 317    I  468
V 321    Y  474
E 322    L  475
E 323    K  476
G 324    R  477
E 325    E  478
I 326    Q  479
G 327    K  480
I 328    P  481
P 329    D  482
G 330    G  483
G 331    S  484
V 332    W  485
V 333    F  486
L 334    G  487
T 335    R  488
G 336    W  489
G 337    G  490
G 338    V  491
A 339    N  492
K 340    Y  493
I 341    L  494
P 342    Y  495
R 343    G  496
I 344    T  497
N 345    G  498
E 346    A  499
L 347    V  500
A 348    V  501
T 349    S  502
E 350    A  503
V 351    L  504
F 352    K  505
K 353    A  506
S 354    V  507
P 355    G  508
V 356    I  509
R 357    D  510
T 358    T  511
G 359    R  512
C 360    E  513
Y 361    P  514
A 362    Y  515
N 363    I  516
S 364    Q  517
D 365    K  518
R 366    A  519
P 367    L  520
S 368    D  521
I 369    W  522
D 373    A  546
E 374    G  547
V 375    K  548
A 376    G  549
N 377    A  550
D 378    S  551
P 379    T  552
S 380    P  553
F 381    S  554
A 382    Q  555
A 383    T  556
A 384    A  557
F 385    W  558
G 386    A  559
N 387    L  560
V 388    M  561
F 389    A  562
A 390    L  563
V 391    I  564
S 392    A  565
E 393    G  566
N 394    G  567
P 395    R  568
Y 396    A  569
E 397    E  570
E 398    S  571
T 399    E  572
P 400    A  573
E 404    R  576
K 408    Q  579
K 409    Y  580
I 410    L  581
F 411    V  582
R 412    E  583
L 413    T  584
F 414    Q  585
K 415    R  586
E 416    P  587
L 417    D  588
M 418    G  589
E 419    G  590
TER
END


