
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  2
PARENT 1dkg_D
REMARK V 8 G 2
F 9 K 3
Y 10 I 4
T 11 I 5
S 12 G 6
I 13 I 7
D 14 D 8
I 15 L 9
G 16 G 10
S 17 T 11
R 18 T 12
Y 19 N 13
I 20 S 14
K 21 C 15
V 24 V 16
L 25 A 17
G 26 I 18
K 27 M 19
R 28 D 20
D 29 G 21
Q 30 T 22
E 31 T 23
W 32 P 24
E 33 R 25
A 34 V 26
L 35 L 27
A 36 G 32
F 37 D 33
S 38 R 34
S 39 T 35
V 40 T 36
K 41 P 37
S 42 S 38
R 43 Q 52
G 44 P 53
L 45 A 54
D 46 K 55
E 47 R 56
G 48 Q 57
E 49 A 58
I 50 V 59
K 51 T 60
D 52 N 61
A 53 P 62
I 54 Q 63
A 55 N 64
F 56 T 65
K 57 L 66
E 58 F 67
S 59 A 68
V 60 I 69
N 61 K 70
T 62 R 71
L 63 L 72
L 64 I 73
K 65 G 74
E 66 R 75
L 67 R 76
E 68 F 77
E 69 Q 78
Q 70 D 79
L 71 E 80
Q 72 E 81
K 73 V 82
S 74 Q 83
R 76 R 84
S 77 D 85
D 78 V 86
F 79 S 87
V 80 I 88
I 81 M 89
S 82 P 90
F 83 F 91
S 84 K 92
S 85 I 93
V 86 I 94
S 87 A 95
F 88 A 96
E 89 D 97
R 90 N 98
E 91 G 99
D 92 D 100
T 93 A 101
V 94 W 102
I 95 V 103
E 96 E 104
R 97 V 105
D 98 G 107
F 99 Q 108
G 100 K 109
E 101 M 110
E 102 A 111
K 103 P 112
R 104 P 113
S 105 Q 114
I 106 I 115
T 107 S 116
L 108 A 117
D 109 E 118
I 110 V 119
L 111 L 120
S 112 K 121
E 113 K 122
M 114 M 123
Q 115 K 124
S 116 K 125
E 117 T 126
A 118 A 127
L 119 E 128
E 120 D 129
K 121 Y 130
L 122 L 131
K 123 G 132
E 124 E 133
N 125 P 134
I 158 V 135
E 159 T 136
Y 160 E 137
T 161 A 138
S 162 V 139
I 163 I 140
V 164 T 141
V 165 V 142
P 166 P 143
L 167 A 144
K 168 Y 145
V 169 F 146
Y 170 N 147
E 171 D 148
M 172 A 149
F 173 Q 150
Y 174 R 151
N 175 Q 152
F 176 A 153
L 177 T 154
Q 178 K 155
D 179 D 156
T 180 A 161
V 181 G 162
K 182 L 163
S 183 E 164
P 184 V 165
F 185 K 166
Q 186 R 167
L 187 I 168
K 188 I 169
S 189 N 170
S 190 E 171
L 191 P 172
V 192 T 173
S 193 A 174
T 194 A 175
A 195 A 176
E 196 L 177
G 197 A 178
V 198 Y 179
L 199 G 180
T 200 L 181
T 201 D 182
REMARK P 202 G 184
E 203 T 185
K 204 G 186
D 205 N 187
R 206 R 188
G 207 T 189
V 208 I 190
V 209 A 191
V 210 V 192
V 211 Y 193
N 212 D 194
L 213 L 195
G 214 G 196
Y 215 G 197
N 216 G 198
F 217 T 199
T 218 F 200
G 219 D 201
L 220 I 202
I 221 S 203
A 222 I 204
Y 223 I 205
K 224 E 206
N 225 I 207
REMARK G 226 G 212
REMARK V 227 E 213
P 228 K 214
I 229 T 215
K 230 F 216
I 231 N 222
S 232 G 223
Y 233 D 224
V 234 T 225
P 235 H 226
V 236 L 227
G 237 G 228
M 238 G 229
K 239 E 230
H 240 D 231
V 241 F 232
I 242 D 233
K 243 S 234
D 244 R 235
V 245 L 236
S 246 P 256
A 247 L 257
V 248 A 258
L 249 M 259
D 250 Q 260
T 251 R 261
S 252 L 262
F 253 K 263
E 254 E 264
E 255 A 265
S 256 A 266
E 257 E 267
R 258 K 268
L 259 A 269
I 260 K 270
I 261 I 271
T 262 E 272
H 263 L 273
G 264 S 274
N 265 S 275
N 269 A 276
D 270 Q 277
L 271 Q 278
K 272 T 279
E 273 D 280
E 274 V 281
E 275 N 282
I 276 L 283
Q 277 P 284
Y 278 Y 285
R 279 I 286
G 280 T 287
L 281 A 288
D 282 D 289
G 283 A 290
N 284 T 291
T 285 G 292
I 286 P 293
K 287 K 294
T 288 H 295
T 289 M 296
T 290 N 297
A 291 I 298
K 292 K 299
I 297 V 300
I 298 T 301
H 299 R 302
A 300 A 303
R 301 K 304
L 302 L 305
R 303 E 306
E 304 S 307
I 305 L 308
M 306 V 309
S 307 E 310
K 308 D 311
S 309 L 312
K 310 V 313
K 311 N 314
F 312 R 315
F 313 S 316
R 314 I 317
E 315 E 318
V 316 L 319
E 317 L 320
A 318 K 321
K 319 V 322
I 320 A 323
V 321 L 324
E 322 Q 325
E 323 D 326
G 324 L 329
E 325 S 330
I 326 V 331
G 327 S 332
I 328 D 333
P 329 I 334
G 330 D 335
G 331 D 336
V 332 V 337
V 333 I 338
L 334 L 339
T 335 V 340
G 336 G 341
G 337 G 342
G 338 Q 343
A 339 T 344
K 340 R 345
I 341 M 346
P 342 P 347
R 343 M 348
I 344 V 349
N 345 Q 350
E 346 K 351
L 347 K 352
A 348 V 353
T 349 A 354
E 350 E 355
V 351 F 356
F 352 F 357
K 353 G 358
S 354 K 359
D 365 E 360
R 366 P 361
P 367 R 362
S 368 K 363
I 369 D 364
I 370 V 365
N 371 N 366
A 372 P 367
D 373 D 368
E 374 E 369
V 375 A 370
A 376 V 371
S 380 A 372
F 381 I 373
A 382 G 374
A 383 A 375
A 384 A 376
F 385 V 377
G 386 G 379
N 387 G 380
V 388 V 381
F 389 L 382
TER
END

