
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  3
PARENT 1glf_Z
REMARK S 5 T 1
REMARK K 6 E 2
T 7 K 3
V 8 K 4
F 9 Y 5
Y 10 I 6
T 11 V 7
S 12 A 8
I 13 L 9
D 14 D 10
I 15 Q 11
G 16 G 12
S 17 T 13
R 18 T 14
Y 19 S 15
I 20 S 16
K 21 R 17
G 22 A 18
L 23 V 19
V 24 V 20
L 25 M 21
G 26 D 22
K 27 H 23
R 28 D 24
D 29 A 25
E 33 N 26
A 34 I 27
L 35 I 28
A 36 S 29
F 37 V 30
S 38 S 31
S 39 Q 32
V 40 R 33
K 41 E 34
S 42 F 35
R 43 E 36
G 44 Q 37
L 45 I 38
D 46 K 41
E 47 P 42
G 48 G 43
E 49 V 45
I 50 E 46
K 51 H 47
D 52 D 48
A 53 P 49
I 54 M 50
A 55 E 51
F 56 I 52
K 57 W 53
E 58 A 54
S 59 T 55
V 60 Q 56
N 61 S 57
T 62 S 58
L 63 T 59
L 64 L 60
K 65 V 61
E 66 E 62
L 67 V 63
E 68 L 64
E 69 A 65
Q 70 K 66
L 71 A 67
Q 72 D 68
K 73 I 69
S 74 S 70
L 75 S 71
R 76 D 72
S 77 Q 73
D 78 I 74
F 79 A 75
V 80 A 76
I 81 I 77
S 85 G 78
V 86 I 79
S 87 T 80
F 88 N 81
E 89 Q 82
R 90 R 83
E 91 E 84
D 92 T 85
T 93 T 86
V 94 I 87
I 95 V 88
E 96 W 89
R 97 E 90
D 98 K 91
F 99 E 92
G 100 T 93
E 101 G 94
E 102 K 95
K 103 P 96
R 104 I 97
S 105 R 106
I 106 R 107
T 107 T 108
L 108 A 109
D 109 E 110
I 110 I 111
L 111 C 112
S 112 E 113
E 113 H 114
M 114 L 115
Q 115 K 116
S 116 R 117
E 117 D 118
A 118 G 119
L 119 E 121
E 120 D 122
K 121 Y 123
L 122 I 124
K 123 R 125
E 124 S 126
N 125 N 127
G 126 T 128
K 127 G 129
T 128 L 130
P 129 V 131
L 130 I 132
H 131 D 133
I 132 G 138
F 133 T 139
S 134 K 140
K 135 V 141
R 136 K 142
Y 137 W 143
L 138 I 144
L 139 L 145
D 140 D 146
D 141 H 147
E 142 V 148
R 143 E 149
I 144 G 150
V 145 S 151
F 146 R 152
N 147 E 153
P 148 R 154
L 149 A 155
M 151 M 173
K 152 T 174
A 153 Q 175
S 154 G 176
K 155 R 177
I 156 V 178
A 157 H 179
I 158 V 180
E 159 T 181
Y 160 D 182
T 161 Y 183
S 162 V 206
I 163 L 207
V 164 D 208
V 165 I 209
P 166 P 210
L 167 R 211
K 168 E 212
V 169 M 213
Y 170 L 214
E 171 P 215
M 172 E 216
F 173 V 217
Y 174 R 218
N 175 N 228
F 176 I 229
L 177 G 230
Q 178 G 231
D 179 K 232
T 180 G 233
V 181 G 234
K 182 T 235
S 183 R 236
P 184 I 237
F 185 P 238
Q 186 I 239
L 187 S 240
K 188 G 241
S 189 I 242
S 190 A 243
L 191 G 244
V 192 D 245
S 193 Q 246
T 194 Q 247
A 195 A 248
E 196 A 249
G 197 L 250
V 198 F 251
L 199 G 252
T 200 Q 253
T 201 L 254
P 202 C 255
E 203 V 256
K 204 K 257
D 205 E 258
G 207 G 259
V 208 M 260
V 209 A 261
V 210 K 262
V 211 N 263
N 212 T 264
L 213 Y 265
G 214 G 266
Y 215 T 267
N 216 G 268
F 217 C 269
T 218 F 270
G 219 M 271
L 220 L 272
I 221 M 273
A 222 V 280
Y 223 K 281
K 224 S 282
N 225 E 283
G 226 N 284
V 227 G 285
P 228 L 286
I 229 L 287
K 230 T 288
I 231 T 289
S 232 G 304
Y 233 A 305
V 234 V 306
P 235 F 307
V 236 M 308
G 237 A 309
M 238 G 310
K 239 A 311
H 240 S 312
V 241 I 313
I 242 Q 314
K 243 M 320
D 244 K 321
V 245 L 322
S 246 I 323
A 247 N 324
V 248 D 325
L 249 A 326
D 250 Y 327
T 251 D 328
S 252 S 329
F 253 E 330
E 254 Y 331
E 255 F 332
S 256 A 333
E 257 T 334
R 258 K 335
L 259 V 336
I 260 Q 337
I 261 N 338
T 262 T 339
H 263 N 340
G 264 G 341
N 265 V 342
A 266 Y 343
V 267 V 344
Y 268 V 345
N 269 P 346
D 270 A 347
L 271 F 348
K 272 T 349
E 273 G 350
E 274 L 351
E 275 G 352
I 276 A 353
Q 277 P 354
Y 278 Y 355
R 279 W 356
G 280 D 357
L 281 P 358
D 282 Y 359
G 283 A 360
N 284 R 361
T 285 G 362
I 286 A 363
K 287 I 364
T 288 F 365
T 289 L 367
T 290 T 368
A 291 R 369
K 292 G 370
K 293 V 371
L 294 N 372
S 295 A 373
V 296 N 374
I 297 I 376
I 298 I 377
H 299 R 378
A 300 A 379
I 305 T 380
M 306 L 381
S 307 E 382
K 308 S 383
S 309 I 384
K 310 A 385
K 311 Y 386
F 312 Q 387
F 313 T 388
R 314 R 389
E 315 D 390
V 316 V 391
E 317 L 392
A 318 E 393
K 319 A 394
I 320 M 395
V 321 Q 396
E 322 A 397
E 323 D 398
G 324 S 399
E 325 G 400
I 326 I 401
G 327 R 402
I 328 L 403
G 330 H 404
G 331 A 405
V 332 L 406
V 333 R 407
L 334 V 408
T 335 D 409
G 336 G 410
G 337 G 411
G 338 A 412
A 339 V 413
K 340 A 414
I 341 N 415
P 342 N 416
R 343 F 417
I 344 L 418
N 345 M 419
E 346 Q 420
L 347 F 421
A 348 Q 422
T 349 S 423
E 350 D 424
V 351 I 425
F 352 L 426
K 353 G 427
S 354 T 428
P 355 R 429
V 356 V 430
R 357 E 431
T 358 R 432
G 359 P 433
C 360 E 434
Y 361 V 435
S 380 R 436
F 381 E 437
A 382 V 438
A 383 T 439
A 384 A 440
F 385 L 441
G 386 G 442
N 387 A 443
V 388 A 444
F 389 Y 445
A 390 L 446
V 391 A 447
S 392 G 448
E 393 L 449
N 394 A 450
P 395 V 451
Y 396 Q 455
E 397 N 456
E 398 L 457
T 399 D 458
P 400 E 459
V 401 L 460
K 402 Q 461
S 403 E 462
E 404 K 463
N 405 A 464
P 406 V 465
L 407 I 466
K 408 E 467
K 409 R 468
I 410 E 469
F 411 F 470
R 412 R 471
TER
END

