
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 7770-2312-5826
REMARK GROUP NAME: SHESTOPALOV. EXPERT GROUP.
REMARK GROUP LEADER: Shestopalov Boris V. TEAM: NO.
REMARK E-mail: shest@mail.cytspb.rssi.ru
METHOD Secondary structures predicted by DOUBLET CODE METHOD
METHOD (see SHESTOPALOV, ab initio secondary structure category)
METHOD and also various information from protein data bases are used.
METHOD Here Yale structural alignment (Werner Krebs and Mark Gerstein,
METHOD http://bioinfo.mbb.yale.edu/align/server.cgi) has been useful. 
MODEL  1
PARENT 2pec
A 26 A 1
D 27 D 3
C 28 T 4
S 29 G 5
S 30 A 9
L 32 T 10
T 33 A 11
S 34 G 12
G 35 G 13 
I 36 V 15
S 37 T 16
T 38 Y 50
K 39 P 51
R 40 L 52
I 41 V 53
Y 42 I 54
Y 43 T 55
V 44 Y 56
A 45 T 57
P 46 G 58
N 47 N 59
G 48 E 60
N 49 D 61
S 62 S 62
F 63 L 63
S 64 I 64
A 65 N 65
A 66 A 66
M 67 A 67
A 68 A 68
A 69 A 69
V 70 I 71
E 74 R 80
L 75 V 82
I 76 E 83
L 77 I 84
L 78 K 85
K 79 T 88
P 80 K 89
G 81 G 90
T 82 I 91
Y 83 T 92
T 84 I 93
I 85 I 94
P 86 G 95
Y 87 A 96
T 88 S 100
Q 89 A 101
G 90 N 102
K 91 F 103
G 92 G 104
T 94 I 105
I 95 W 106
T 96 I 107
F 97 K 108
K 102 K 109
G 104 S 110
A 105 S 111
P 106 D 112
I 107 V 113
Y 108 V 114
V 109 V 115
A 110 Q 116
N 113 N 117
C 114 M 118
F 119 R 119
D 120 I 120
F 121 G 121
S 122 Y 122
F 123 L 123
P 124 P 124
D 125 G 125
W 128 G 126
V 129 A 127
Q 130 G 130 
A 131 D 131
S 132 M 132
Y 133 I 133
G 134 R 134
F 135 V 135
Y 136 D 136
V 137 D 137
T 138 S 138
G 139 P 139
D 140 N 140
Y 141 V 141
W 142 W 142
Y 143 V 143
F 144 D 144
K 145 H 145
G 146 N 146
V 147 E 147
E 148 L 148
V 149 F 149
T 150 A 150
R 151 A 151
A 152 D 156
G 153 G 157
Y 154 F 165
Q 155 E 166
G 156 S 167
A 157 A 168
Y 158 V 169
V 159 D 170
I 160 I 171
G 161 K 172
S 162 G 173
H 163 A 174
N 164 S 175
F 166 N 176 
E 167 T 177
N 168 V 178
T 169 T 179
A 170 V 180
F 171 S 181
H 172 Y 182
G 178 N 183
L 179 Y 184
E 180 I 185
I 181 H 186
N 182 G 187
Y 187 V 188
N 188 K 190
T 189 V 191
V 190 L 193
I 191 D 194
N 192 G 195
S 193 S 196
D 194 S 197
A 195 S 198
G 218 S 199 
P 219 D 200
G 220 T 201
N 221 G 202
R 222 R 203
F 223 N 204
V 224 I 205
G 225 T 206
C 226 Y 207
R 227 H 208
A 228 H 209
W 229 N 210
G 235 Y 211
F 236 Y 212
D 237 N 213
L 238 D 214
F 239 V 215
D 240 N 216
S 241 A 217
P 242 R 218
Q 243 L 219
K 244 P 220
V 245 L 221
V 246 Q 222
I 247 R 223
E 248 G 224
N 249 G 225
S 250 L 226
W 251 H 228
A 252 A 229
F 253 Y 230
N 255 N 231
G 256 N 232
I 257 L 233
N 258 Y 234
Y 259 T 235
N 261 N 236
F 265 I 237
A 266 T 238
G 269 G 239
N 270 S 240
G 271 G 241
F 272 L 242
K 273 N 243
L 274 V 244
A 279 R 245
V 280 Q 246
G 281 N 247
N 282 G 248
H 283 Q 249
R 284 A 250
I 285 L 251
T 286 I 252
R 287 E 253
S 288 N 254
V 289 W 256
A 290 F 257
F 291 E 258
V 307 K 259
T 308 A 260
V 309 I 261
I 310 N 262
N 311 P 263
N 312 V 264
T 313 T 265
S 314 S 266
Y 315 Y 268
K 316 K 271
N 317 N 272
G 318 G 274
I 319 T 275
N 320 W 276
Y 321 V 277
G 322 L 278
F 323 K 279
Q 331 G 280
K 332 N 281
H 333 N 282
Y 334 I 283
F 335 T 284
R 336 K 285
N 337 P 286
N 338 T 291
V 339 Y 292
S 340 S 293
L 341 I 294
S 342 T 295
A 343 W 296
S 344 T 297
V 345 A 298
T 346 D 299
V 347 T 300
S 366 K 301
D 367 P 302
F 368 Y 303
V 369 V 304
S 370 N 305
L 371 A 306
D 372 D 307
T 373 S 308
S 374 T 314
L 375 F 315
A 376 C 329
T 377 V 330
V 378 K 331
S 379 D 332
R 380 K 333
D 381 L 334
N 382 P 335
D 383 G 336
G 384 G 341
T 385 K 342
L 386 L 344
P 387 A 345
E 388 T 346
T 389 L 347
S 390 T 348
L 391 S 349
TER
END

