
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=4.09 
REMARK CONFIDENCE: GUESS     (50% confidence [ ZSCORE>=3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hs1dbga
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and environment-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  1
PARENT 1dbg_A
S  55     Q    26
S  56     V    27
F  57     V    28
N  58     A    29
A  59     S    30
P  60     N    31
M  61     E    32
S  62     T    33
F  63     L    34
S  64     Y    35
A  65     Q    36
A  66     V    37
M  67     V    38
A  68     K    39
A  69     E    40
V  70     V    41
N  71     K    42
P  72     P    43
G  73     G    44
E  74     G    45
L  75     L    46
I  76     V    47
L  77     Q    48
L  78     I    49
K  79     A    50
P  80     D    51
G  81     G    52
T  82     T    53
Y  83     Y    54
T  84     K    55
G  92     D    56
N  93     V    57
T  94     Q    58
I  95     L    59
T  96     I    60
F  97     V    61
N  98     S    62
K  99     N    63
S 100     S    64
G 101     G    65
K 102     K    66
D 103     S    67
G 104     G    68
A 105     L    69
P 106     P    70
I 107     I    71
Y 108     T    72
V 109     I    73
A 110     K    74
A 111     A    75
A 112     L    76
N 113     N    77
C 114     P    78
G 115     G    79
R 116     K    80
A 117     V    81
V 118     F    82
F 119     F    83
D 120     T    84
P 124     G    85
D 125     D    86
S 126     A    87
Q 127     K    88
W 128     V    89
V 129     E    90
Q 130     L    91
A 131     R    92
S 132     G    93
Y 133     E    94
G 134     H    95
F 135     L    96
Y 136     I    97
V 137     L    98
T 138     E    99
G 139     G   100
D 140     I   101
Y 141     W   102
W 142     F   103
Y 143     K   104
F 144     D   105
K 145     G   106
G 146     N   107
V 147     R   108
E 148     A   109
V 149     I   110
T 150     Q   111
R 151     A   112
A 152     W   113
G 153     K   114
Y 154     S   115
Q 155     H   116
G 156     G   117
A 157     V   121
Y 158     A   122
V 159     I   123
I 160     Y   124
G 161     G   125
S 162     S   126
H 163     Y   127
N 164     N   128
T 165     R   129
F 166     I   130
E 167     T   131
N 168     A   132
T 169     C   133
A 170     V   134
F 171     F   135
H 172     Q   158
H 173     H   159
N 174     C   160
R 175     R   161
N 176     I   162
T 177     D   163
G 178     H   164
L 179     C   165
E 180     S   166
I 181     F   167
N 182     T   168
N 183     D   169
G 184     K   170
G 185     I   171
S 186     T   172
Y 187     F   173
N 188     D   174
T 189     Q   175
V 190     V   176
I 191     I   177
N 192     N   178
S 193     L   179
R 197     N   180
N 198     N   181
Y 199     T   182
D 200     A   183
P 201     R   184
K 202     A   185
K 203     I   186
N 204     K   187
G 205     D   188
S 206     G   189
M 207     S   190
A 208     V   191
D 209     G   192
G 210     G   193
F 211     F   205
G 212     S   206
P 213     N   207
K 214     P   208
Q 215     Q   209
K 216     K   210
Q 217     P   211
G 218     G   212
P 219     Q   252
G 220     E   253
N 221     N   254
R 222     V   255
F 223     Y   256
V 224     Y   257
G 225     G   258
C 226     N   259
A 228     T   260
W 229     Y   261
E 230     L   262
N 231     N   263
S 232     C   264
D 233     Q   265
D 234     G   266
G 235     T   267
F 236     M   268
D 237     N   269
L 238     F   270
F 239     R   271
D 240     H   272
S 241     G   273
P 242     D   274
Q 243     H   275
K 244     Q   276
V 245     V   277
V 246     A   278
I 247     I   279
E 248     N   280
N 249     N   281
S 250     F   282
W 251     Y   283
A 252     I   284
F 253     G   285
R 254     N   286
N 255     D   287
G 256     G   294
I 257     M   295
N 258     F   296
Y 259     V   297
W 260     W   298
N 261     G   299
D 262     S   300
S 263     R   301
A 264     H   302
F 265     V   303
A 266     I   304
G 267     A   305
G 269     C   306
N 270     N   307
G 271     Y   308
F 272     F   309
K 273     E   310
L 274     L   311
G 275     R   318
G 276     G   319
N 277     N   320
Q 278     A   321
A 279     A   322
V 280     L   323
G 281     Y   324
N 282     E   333
H 283     H   334
R 284     A   335
I 285     L   336
T 286     A   337
R 287     F   338
S 288     D   339
V 289     M   340
A 290     L   341
F 291     I   342
G 292     A   343
N 293     N   344
V 294     R   364
S 295     K   365
K 296     E   366
G 297     Y   367
F 298     C   368
D 299     A   369
Q 300     A   370
N 301     N   371
N 302     E   376
N 303     T   377
A 304     P   378
G 305     H   379
G 306     Q   380
V 307     L   381
T 308     M   382
V 309     L   383
I 310     K   384
N 311     G   385
N 312     N   386
T 313     L   387
S 314     F   388
Y 315     F   389
K 316     K   390
N 317     D   391
G 318     K   392
I 319     P   393
N 320     Y   394
Y 321     V   395
G 322     Y   396
F 323     F   399
G 324     K   400
S 325     D   401
N 326     D   402
V 327     Y   403
Q 328     F   404
S 329     I   405
G 330     A   406
Q 331     G   407
K 332     K   408
H 333     N   409
Y 334     S   410
F 335     W   411
R 336     T   412
N 337     G   413
N 338     N   414
V 339     V   415
S 340     A   416
L 341     L   417
S 342     G   418
A 343     V   419
S 344     E   420
V 345     K   421
T 346     G   422
V 347     I   423
S 348     P   424
N 349     N   426
A 350     I   427
D 351     S   428
A 352     A   429
K 353     N   430
S 354     R   431
N 355     S   432
S 356     A   433
W 357     Y   434
D 358     K   435
T 359     P   436
G 360     V   437
P 361     K   438
A 362     I   439
A 363     K   440
S 364     D   441
A 365     I   442
S 366     Q   443
D 367     P   444
F 368     I   445
V 369     E   446
S 370     G   447
L 371     I   448
D 372     A   449
T 373     L   450
S 374     D   451
L 375     L   452
A 376     A   454
T 377     L   455
V 378     I   456
S 379     S   457
R 380     K   458
D 381     G   459
N 382     I   460
D 383     T   461
G 384     G   462
T 385     K   463
L 386     P   464
P 387     L   465
E 388     S   466
T 389     W   467
S 390     D   468
L 391     E   469
F 392     V   470
R 393     R   471
L 394     P   472
S 395     Y   473
A 396     W   474
N 397     L   475
S 398     K   476
K 399     E   477
L 400     M   478
I 401     P   479
N 402     G   480
A 403     T   481
G 404     Y   482
T 405     A   483
K 406     L   484
E 407     T   485
S 408     A   486
N 409     R   487
I 410     L   488
S 411     S   489
Y 412     A   490
S 413     D   491
G 414     R   492
S 415     A   493
A 416     A   494
P 417     K   495
D 418     F   496
L 419     K   497
G 420     A   498
A 421     V   499
F 422     I   500
E 423     K   501
R 424     R   502
N 425     N   503
TER
END

