
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=3.53 
REMARK CONFIDENCE: GUESS     (50% confidence [ ZSCORE>=3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: ghf28
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and environment-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  2
PARENT 1rmg
A  26     S     5
D  27     V     6
C  28     G     7
S  29     P     8
S  30     L     9
D  31     T    10
L  32     S    11
T  33     A    12
S  34     S    13
G  35     T    14
I  36     K    15
S  37     G    16
T  38     A    17
K  39     T    18
R  40     K    19
I  41     T    20
Y  42     C    21
Y  43     N    22
V  44     I    23
A  45     L    24
P  46     S    25
N  47     Y    26
G  48     G    27
N  49     A    28
S  50     V    29
S  51     A    30
N  52     D    31
N  53     N    32
G  54     S    33
S  55     T    34
N  58     D    35
A  59     V    36
P  60     G    37
M  61     P    38
S  62     A    39
F  63     I    40
S  64     T    41
A  65     S    42
A  66     A    43
M  67     W    44
A  68     A    45
A  69     A    46
V  70     C    47
N  71     K    48
P  72     S    49
G  73     G    50
E  74     G    51
L  75     L    52
I  76     V    53
L  77     Y    54
L  78     I    55
K  79     P    56
P  80     S    57
G  81     G    58
T  84     N    59
I  85     Y    60
P  86     A    61
Y  87     L    62
T  88     N    63
Q  89     T    64
G  90     G    71
K  91     S    72
G  92     A    73
N  93     T    74
T  94     A    75
I  95     I    76
T  96     Q    77
F  97     L    78
N  98     D    79
S 100     R    84
G 101     T    85
K 102     G    86
D 103     T    87
G 104     A    88
V 118     I    93
F 119     A    94
D 120     V    95
F 121     T    96
S 122     D    97
F 123     T    98
P 124     T    99
D 125     D   100
S 126     F   101
Q 127     E   102
W 128     L   103
V 129     F   104
Q 130     S   105
A 131     S   106
S 132     T   107
Y 133     S   108
G 134     K   109
F 135     G   110
Y 136     A   111
V 137     V   112
T 138     Q   113
G 139     G   114
K 145     F   115
G 146     G   116
V 147     Y   117
E 148     V   118
V 149     Y   119
T 150     H   120
R 151     A   121
A 152     E   122
A 170     G   123
F 171     T   124
H 172     Y   125
H 173     G   126
N 174     A   127
R 175     R   128
N 176     I   129
T 177     L   130
G 178     R   131
L 179     L   132
E 180     T   133
I 181     D   134
N 182     V   135
N 183     T   136
G 184     H   137
G 185     F   138
S 186     S   139
Y 187     V   140
N 188     H   141
T 189     D   142
V 190     I   143
I 191     I   144
N 192     L   145
S 193     V   146
D 194     D   147
A 195     A   148
Y 196     P   149
R 197     A   150
N 198     F   151
Y 199     H   152
D 200     F   153
P 201     T   154
K 202     M   155
K 203     D   156
N 204     T   157
G 205     C   158
S 206     S   159
M 207     D   160
A 208     G   161
D 209     E   162
G 210     V   163
F 211     Y   164
G 212     N   165
P 213     M   166
K 214     A   167
Q 215     I   168
K 216     R   169
Q 217     G   170
G 218     G   171
P 219     N   172
N 221     E   173
R 222     G   174
F 223     L   176
V 224     D   177
G 225     G   178
C 226     I   179
R 227     D   180
A 228     V   181
W 229     W   182
N 231     G   183
S 232     S   184
D 233     N   185
D 234     I   186
G 235     W   187
F 236     V   188
D 237     E   192
L 238     V   193
F 239     T   194
D 240     N   195
S 241     K   196
P 242     D   197
Q 243     E   198
K 244     C   199
V 245     V   200
V 246     T   201
I 247     V   202
E 248     K   203
N 249     S   204
N 255     P   205
G 256     A   206
I 257     N   207
N 258     N   208
Y 259     I   209
W 260     L   210
N 261     V   211
D 262     E   212
S 263     S   213
A 264     I   214
F 265     Y   215
A 266     C   216
G 267     N   217
N 268     W   218
G 269     S   219
N 270     G   220
G 271     G   221
F 272     C   222
K 273     A   223
L 274     M   224
G 275     G   225
G 276     S   226
N 277     A   229
Q 278     D   230
A 279     T   231
V 280     D   232
G 281     V   233
N 282     T   234
H 283     D   235
R 284     I   236
I 285     V   237
T 286     Y   238
R 287     R   239
S 288     N   240
V 289     V   241
A 290     Y   242
F 291     T   243
G 292     W   244
N 293     S   245
V 294     S   246
S 295     N   247
K 296     Q   248
G 297     M   249
F 298     Y   250
D 299     M   251
Q 300     I   252
N 301     K   253
N 302     S   254
N 303     N   255
A 304     G   256
G 306     G   257
V 307     S   258
T 308     G   259
V 309     T   260
I 310     V   261
N 311     S   262
N 312     N   263
T 313     V   264
S 314     L   265
Y 315     L   266
K 316     E   267
N 317     H   272
G 318     G   273
I 319     N   274
N 320     A   275
Y 321     Y   276
G 322     S   277
F 323     L   278
G 324     D   279
S 325     I   280
N 326     D   281
V 327     G   282
Q 328     Y   283
S 329     W   284
G 330     S   285
Q 331     S   286
K 332     M   287
H 333     T   288
Y 334     A   289
F 335     V   290
R 336     A   291
N 337     G   292
N 338     D   293
V 339     G   294
S 340     V   295
L 341     Q   296
S 342     L   297
A 343     N   298
S 344     N   299
V 345     I   300
T 346     T   301
V 347     V   302
S 348     K   303
N 349     N   304
A 350     W   305
D 351     K   306
A 352     G   307
K 353     T   308
S 354     E   309
N 355     A   310
S 356     N   311
W 357     G   312
D 358     A   313
T 359     T   314
G 360     R   315
P 361     P   316
A 362     P   317
A 363     I   318
S 364     R   319
A 365     V   320
S 366     V   321
D 367     T   329
F 368     D   330
V 369     L   331
S 370     T   332
L 371     L   333
D 372     E   334
T 373     D   335
S 374     I   336
L 375     A   337
A 376     I   338
T 377     W   339
V 378     T   340
S 379     E   341
R 380     S   342
D 381     G   343
N 382     S   344
D 383     S   345
G 384     E   346
T 385     L   347
L 386     Y   348
P 387     L   349
E 388     C   350
T 389     R   351
S 390     S   352
L 391     A   353
F 392     Y   354
R 393     G   355
L 394     L   360
S 395     K   361
A 396     D   362
N 397     S   363
S 398     S   364
K 399     S   365
L 400     H   366
I 401     T   367
N 402     S   368
A 403     Y   369
G 404     T   370
T 405     T   371
K 406     T   372
E 407     S   373
S 408     T   374
N 409     G   381
I 410     Y   382
S 411     S   383
Y 412     A   384
S 413     T   385
G 414     T   386
S 415     M   387
A 416     A   388
P 417     A   389
D 418     D   390
L 419     L   391
G 420     A   392
A 421     A   394
F 422     F   395
E 423     G   396
R 424     L   397
N 425     T   398
TER
END

