
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=2.60 
REMARK CONFIDENCE: UNCERTAIN (less than 50% confidence [ ZSCORE<3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hsd1tyu
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and environment-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  5
PARENT 1tyu
A  26     Q   134
D  27     D   135
C  28     A   136
S  29     A   137
S  30     S   138
D  31     A   139
L  32     A   140
T  33     V   141
S  34     D   142
G  35     G   143
I  36     L   144
S  37     L   145
T  38     I   146
K  39     D   147
R  40     R   148
I  41     D   149
Y  42     Y   150
Y  43     N   151
V  44     F   152
A  45     Y   153
P  46     G   154
N  47     G   155
G  48     E   156
N  49     T   157
S  50     V   158
S  51     D   159
N  52     F   160
N  53     G   161
G  54     G   162
S  55     K   163
S  56     T   166
F  57     I   167
N  58     E   168
A  59     C   169
P  60     K   170
M  61     A   171
S  62     K   172
F  63     F   173
S  64     N   178
A  65     L   179
A  66     I   180
M  67     F   181
A  68     T   182
A  69     K   183
V  70     L   184
N  71     G   185
P  72     K   186
G  73     G   187
E  74     S   188
L  75     R   189
I  76     I   190
L  77     V   203
L  78     I   204
K  79     K   205
P  80     P   206
G  81     W   207
T  82     T   208
Y  83     D   209
T  84     D   210
I  85     N   211
P  86     Q   212
Y  87     W   213
T  88     L   214
Q  89     T   215
G  90     D   216
K  91     A   217
G  92     A   218
N  93     A   219
T  94     V   220
I  95     V   221
T  96     T   223
F  97     L   224
N  98     K   225
K  99     Q   226
S 100     S   227
G 101     K   228
K 102     T   229
D 103     D   230
G 104     G   231
A 105     Y   232
P 106     Q   233
I 107     P   234
Y 108     T   235
V 109     V   236
A 110     S   237
A 111     D   238
A 112     Y   239
N 113     V   240
C 114     K   241
G 115     F   242
R 116     P   243
A 117     G   244
V 118     I   245
F 119     E   246
D 120     T   247
F 121     L   248
S 122     L   249
F 123     P   250
P 124     P   251
D 125     N   252
S 126     A   253
Q 127     K   254
W 128     G   255
V 129     Q   256
Q 130     N   257
A 131     I   258
S 132     T   259
Y 133     S   260
G 134     T   261
F 135     L   262
Y 136     E   263
V 137     I   264
T 138     R   265
G 139     E   266
F 144     C   267
K 145     I   268
G 146     G   269
V 147     V   270
E 148     E   271
V 149     V   272
T 150     H   273
R 151     R   274
A 152     A   275
G 153     S   276
Y 154     M   279
Q 155     A   280
G 156     G   281
A 157     F   282
Y 158     L   283
V 159     F   284
I 160     R   285
G 161     G   286
S 162     C   287
H 163     H   288
N 164     F   289
T 165     T   307
F 166     F   308
E 167     E   309
N 168     N   310
T 169     L   311
A 170     S   312
F 171     G   313
H 172     D   314
H 173     W   315
N 174     G   316
R 175     K   317
N 176     G   318
T 177     N   319
G 178     Y   320
L 179     V   321
E 180     I   322
N 182     G   323
N 183     G   324
G 184     R   325
G 185     T   326
S 186     S   327
Y 187     Y   328
N 188     G   329
T 189     S   330
V 190     V   331
I 191     S   332
N 192     S   333
S 193     A   334
D 194     Q   335
A 195     F   336
Y 196     L   337
R 197     R   338
N 198     N   339
Y 199     N   340
D 200     G   341
P 201     G   342
K 202     F   343
K 203     E   344
N 204     R   345
G 205     D   346
S 206     G   347
M 207     G   348
A 208     V   349
D 209     I   350
G 210     G   351
F 211     F   352
G 212     G   361
P 213     V   362
K 214     K   363
Q 215     T   364
K 216     W   365
Q 217     Q   366
G 218     G   367
P 219     T   368
G 220     N   378
N 221     L   379
R 222     Q   380
F 223     F   381
V 224     R   382
G 225     D   383
C 226     S   384
R 227     V   385
A 228     V   386
W 229     I   387
E 230     Y   388
N 231     P   389
S 232     V   390
D 233     W   391
D 234     D   392
G 235     G   393
F 236     F   394
D 237     D   395
L 238     L   396
F 239     G   397
D 240     D   411
S 241     Y   412
P 242     P   413
Q 243     I   414
K 244     T   415
V 245     Q   416
V 246     Y   417
I 247     P   418
E 248     L   419
N 249     H   420
S 250     Q   421
W 251     L   422
A 252     P   423
F 253     L   424
R 254     N   425
N 255     H   426
G 256     L   427
I 257     I   428
N 258     D   429
N 261     N   430
D 262     L   431
S 263     L   432
A 264     V   433
F 265     R   434
A 266     G   435
G 267     A   436
N 268     L   437
G 269     G   438
N 270     V   439
G 271     G   440
F 272     F   441
K 273     G   442
L 274     M   443
G 275     D   444
G 276     G   445
N 277     K   446
Q 278     G   447
A 279     M   448
V 280     Y   449
G 281     V   450
N 282     S   451
H 283     N   452
I 285     I   453
T 286     T   454
R 287     V   455
S 288     E   456
V 289     D   457
A 290     C   458
F 291     A   459
G 292     G   460
N 293     S   461
V 294     G   462
S 295     A   463
K 296     Y   464
G 297     L   465
F 298     L   466
D 299     T   467
Q 300     H   468
N 301     E   469
N 302     S   470
N 303     V   471
A 304     F   472
G 305     T   473
G 306     N   474
V 307     I   475
T 308     A   476
V 309     I   477
I 310     I   478
N 311     D   479
N 312     T   480
T 313     N   481
S 314     T   482
Y 315     K   483
K 316     D   484
N 317     F   485
G 318     Q   486
I 319     A   487
N 320     N   488
Y 321     Q   489
G 322     I   490
F 323     Y   491
G 324     I   492
S 325     S   493
N 326     G   494
V 327     A   495
Q 328     C   496
S 329     R   497
G 330     V   498
Q 331     N   499
K 332     G   500
H 333     L   501
Y 334     R   502
F 335     L   503
R 336     I   504
N 337     G   505
N 338     I   506
V 339     R   507
S 340     S   513
L 341     L   514
S 342     T   515
A 343     I   516
S 344     D   517
V 345     A   518
T 346     P   519
V 347     N   520
S 348     S   521
N 349     T   522
A 350     V   523
D 351     S   524
A 352     G   525
K 353     I   526
S 354     T   527
N 355     G   528
S 356     M   529
W 357     V   530
D 358     D   531
T 359     P   532
G 360     S   533
P 361     R   534
A 362     I   535
A 363     N   536
S 364     V   537
A 365     A   538
S 366     N   539
D 367     L   540
F 368     A   541
D 372     E   542
T 373     E   543
S 374     G   544
L 375     L   545
A 376     G   546
T 377     N   547
V 378     I   548
S 379     R   549
R 380     A   550
D 381     N   551
N 382     S   552
D 383     F   553
G 384     G   554
T 385     Y   555
L 386     D   556
P 387     S   557
E 388     A   558
T 389     A   559
S 390     I   560
L 391     K   561
F 392     L   562
R 393     R   563
L 394     I   564
S 395     H   565
A 396     K   566
N 397     L   567
S 398     S   568
K 399     K   569
L 400     T   570
I 401     L   571
N 402     D   572
A 403     S   573
G 404     G   574
T 405     A   575
K 406     L   576
E 407     Y   577
S 408     S   578
N 409     H   579
I 410     I   580
S 411     A   595
Y 412     I   596
S 413     S   597
G 414     G   598
S 415     S   599
A 416     T   600
P 417     P   601
D 418     D   602
L 419     A   603
G 420     V   604
A 421     S   605
F 422     L   606
E 423     K   607
R 424     V   608
N 425     N   609
TER
END

