
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 3995-5176-6362
METHOD Chandonia & Cohen, mostly unpublished.
METHOD Uses a combination of PSI-BLAST scoring matrix
METHOD and Pred2ary secondary structure prediction.
METHOD Pred2ary page is http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/pred2ary/
METHOD The potential is documented in the paper by
METHOD Schwartz et al which is referenced on
METHOD my research page: http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/research.html
MODEL 1
PARENT 1bhe
A 26 S 1
D 27 D 2
C 28 S 3
S 29 R 4
S 30 D 21
D 31 S 22
L 32 S 23
T 33 T 24
S 34 A 25
G 35 T 26
I 36 S 27
S 37 T 28
T 38 I 29
K 39 Q 30
R 40 K 31
I 41 A 32
Y 42 L 33
Y 43 N 34
V 44 N 35
A 45 C 36
P 46 D 37
N 47 Q 38
G 48 G 39
N 49 K 40
S 50 A 41
S 51 V 42
N 52 S 45
N 53 A 46
G 54 G 47
S 55 S 48
S 56 T 49
F 57 S 50
S 62 V 51
F 63 F 52
S 64 L 53
A 65 S 54
A 66 G 55
M 67 P 56
A 68 L 57
A 69 S 58
V 70 L 59
N 71 P 60
P 72 S 61
G 73 G 62
E 74 V 63
L 75 S 64
I 76 L 65
L 77 L 66
L 78 I 67
K 79 D 68
P 80 K 69
G 81 G 70
T 82 V 71
Y 83 T 72
T 84 L 73
I 85 R 74
P 86 A 75
Y 87 V 76
T 88 N 77
Q 89 N 78
G 90 A 79
K 91 K 80
G 92 S 81
N 93 F 82
T 94 E 83
I 95 N 84
T 96 A 85
F 97 P 86
N 98 S 87
K 99 S 88
S 100 C 89
G 101 G 90
K 102 V 91
D 103 V 92
G 104 D 93
N 113 K 94
C 114 N 95
G 115 G 96
R 116 K 97
A 117 G 98
V 118 C 99
F 119 D 100
D 120 A 101
F 121 F 102
D 125 I 103
S 126 T 104
Q 127 A 105
W 128 V 106
V 129 S 107
Q 130 T 108
A 131 T 109
S 132 N 110
Y 133 S 111
G 134 G 112
F 135 I 113
Y 136 Y 114
V 137 G 115
T 138 P 116
G 139 G 117
D 140 T 118
Y 141 I 119
W 142 D 120
Y 143 G 121
F 144 Q 122
K 145 G 123
G 146 G 124
V 147 V 125
E 148 K 126
V 149 L 127
T 150 Q 128
R 151 D 129
A 152 K 130
G 153 K 131
Y 154 V 132
Q 155 S 133
G 156 A 141
A 157 K 142
Y 158 V 143
V 159 K 144
I 160 K 145
G 161 L 146
S 162 K 147
H 163 Q 148
N 164 N 149
T 165 T 150
F 166 P 151
E 167 R 152
N 168 L 153
T 169 I 154
A 170 Q 155
F 171 I 156
H 172 N 157
H 173 K 158
N 174 S 159
R 175 K 160
N 176 N 161
T 177 F 162
T 189 T 163
V 190 L 164
I 191 Y 165
N 192 N 166
S 193 V 167
D 194 S 168
A 195 L 169
Y 196 I 170
R 197 N 171
N 198 S 172
Y 199 P 173
D 200 N 174
P 201 F 175
K 202 H 176
K 203 V 177
N 204 V 178
G 205 F 179
S 206 S 180
M 207 D 181
A 208 G 182
D 209 D 183
G 210 G 184
F 211 K 193
G 212 T 194
P 213 P 195
K 214 S 196
Q 215 T 197
K 216 A 198
Q 217 R 199
G 218 N 200
P 219 T 201
G 220 D 202
N 221 G 203
R 222 I 204
F 223 D 205
V 224 P 206
G 225 M 207
C 226 S 208
R 227 S 209
A 228 K 210
W 229 N 211
E 230 I 212
N 231 T 213
S 232 I 214
D 233 A 215
D 234 Y 216
G 235 S 217
F 236 N 218
D 237 I 219
L 238 A 220
F 239 T 221
D 240 G 222
S 241 D 223
P 242 D 224
Q 243 N 225
K 244 V 226
V 245 A 227
V 246 I 228
I 247 K 229
E 248 A 230
N 249 Y 231
S 250 K 232
W 251 G 233
A 252 R 234
F 253 A 235
R 254 E 236
N 255 T 237
I 257 R 238
N 258 N 239
Y 259 I 240
W 260 S 241
N 261 I 242
D 262 L 243
S 263 H 244
A 264 N 245
F 265 D 246
A 266 F 247
G 267 G 248
N 268 T 249
G 269 G 250
N 270 H 251
G 271 G 252
F 272 M 253
K 273 S 254
L 274 I 255
G 275 G 256
G 276 S 257
N 277 E 258
Q 278 T 259
A 279 M 260
V 280 G 261
G 281 Y 263
N 282 N 264
H 283 V 265
R 284 T 266
I 285 V 267
T 286 D 268
R 287 D 269
S 288 L 270
V 289 K 271
A 290 M 272
F 291 N 273
G 292 G 274
V 294 T 275
S 295 T 276
K 296 N 277
G 297 G 278
F 298 L 279
D 299 R 280
Q 300 I 281
N 301 K 282
N 302 S 283
N 303 D 284
A 304 K 285
G 305 S 286
G 306 A 287
V 307 A 288
T 308 G 289
V 309 V 290
I 310 V 291
N 311 N 292
N 312 G 293
T 313 V 294
S 314 R 295
Y 315 Y 296
K 316 S 297
N 317 N 298
G 318 M 301
I 319 K 302
N 320 N 303
Y 321 V 304
G 322 A 305
F 323 K 306
G 324 P 307
S 325 I 308
N 326 V 309
V 327 I 310
Q 328 D 311
S 329 T 312
G 330 V 313
Q 331 Y 314
K 332 E 315
H 333 K 316
Y 334 K 317
F 335 E 318
R 336 G 319
N 337 S 320
N 338 N 321
V 339 V 322
S 340 P 323
L 341 D 324
S 342 W 325
A 343 S 326
S 344 D 327
V 345 I 328
T 346 T 329
V 347 F 330
S 348 K 331
N 349 D 332
A 350 V 333
D 351 T 334
A 352 S 335
K 353 E 336
A 362 T 337
A 363 K 338
S 364 G 339
A 365 V 340
S 366 V 341
D 367 V 342
F 368 L 343
V 369 N 344
S 370 G 345
L 371 E 346
D 372 N 347
T 373 A 348
S 374 K 349
L 375 K 350
A 376 P 351
T 377 I 352
V 378 E 353
S 379 V 354
R 380 T 355
D 381 M 356
N 382 K 357
D 383 N 358
G 384 V 359
T 385 K 360
L 386 L 361
P 387 T 362
E 388 S 363
T 389 D 364
S 390 S 365
L 391 T 366
F 392 W 367
R 393 Q 368
L 394 I 369
S 395 K 370
A 396 N 371
N 397 V 372
S 398 N 373
K 399 V 374
L 400 K 375
I 401 K 376
TER
END

