
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  1
PARENT 3bta_A
I 36 I 746
S 37 N 747
T 38 Y 748
K 39 Q 749
R 40 Y 750
I 41 N 751
Y 42 Q 752
Y 43 Y 753
V 44 T 754
A 45 E 755
P 46 E 756
N 47 E 757
G 48 K 758
N 49 N 759
S 50 N 760
S 51 I 761
N 52 N 762
N 53 N 764
G 54 I 765
S 55 D 766
S 56 D 767
F 57 L 768
N 58 S 769
A 59 S 770
P 60 K 771
M 61 L 772
S 62 N 773
F 63 E 774
S 64 S 775
A 65 I 776
A 66 N 777
M 67 K 778
A 68 A 779
A 69 M 780
V 70 I 781
N 71 N 782
P 72 I 783
G 73 N 784
E 74 K 785
L 75 F 786
I 76 L 787
L 77 N 788
L 78 Q 789
K 79 C 790
P 80 S 791
G 81 V 792
T 82 S 793
Y 83 Y 794
T 84 L 795
I 85 M 796
P 86 N 797
Y 87 S 798
T 88 M 799
Q 89 Y 802
G 90 G 803
K 91 V 804
G 92 K 805
N 93 R 806
T 94 L 807
I 95 E 808
T 96 D 809
F 97 F 810
N 98 D 811
K 99 A 812
S 100 S 813
G 101 L 814
K 102 K 815
D 103 D 816
G 104 A 817
A 105 K 820
P 106 Y 821
I 107 I 822
Y 108 Y 823
V 109 D 824
A 110 N 825
A 111 R 826
A 112 G 827
N 113 T 828
C 114 L 829
G 115 I 830
R 116 G 831
A 117 Q 832
V 118 V 833
F 119 D 834
D 120 R 835
F 121 L 836
S 122 K 837
F 123 D 838
P 124 K 839
D 125 V 840
S 126 N 841
Q 127 N 842
W 128 T 843
V 129 L 844
Q 130 S 845
A 131 T 846
S 132 D 847
Y 133 I 848
G 134 P 849
F 135 F 850
Y 136 Q 851
V 137 L 852
T 138 S 853
G 139 K 854
D 140 Y 855
Y 141 V 856
W 142 D 857
Y 143 N 858
F 144 Q 859
K 145 R 860
G 146 L 861
V 147 L 862
E 148 S 863
V 149 T 864
T 150 F 865
R 151 T 866
A 152 E 867
G 153 Y 868
Y 154 I 869
Q 155 K 870
G 156 N 871
A 157 I 872
Y 158 I 873
V 159 N 874
I 160 T 875
G 161 S 876
S 162 I 877
H 163 L 878
N 164 N 879
T 165 L 880
F 166 R 881
E 167 Y 882
N 168 E 883
T 169 S 884
A 170 N 885
F 171 H 886
H 172 L 887
H 173 I 888
N 174 D 889
R 175 L 890
N 176 S 891
T 177 R 892
G 178 Y 893
L 179 A 894
E 180 S 895
I 181 K 896
N 182 I 897
N 183 N 898
G 184 I 899
G 185 G 900
S 186 S 901
Y 187 K 902
N 188 V 903
T 189 N 904
V 190 F 905
I 191 D 906
N 192 P 907
S 193 I 908
D 194 D 909
A 195 K 910
Y 196 N 911
R 197 Q 912
N 198 I 913
Y 199 Q 914
D 200 L 915
P 201 F 916
K 202 N 917
K 203 L 918
N 204 E 919
G 205 S 920
S 206 S 921
M 207 K 922
A 208 I 923
D 209 E 924
G 210 V 925
F 211 I 926
G 212 L 927
P 213 K 928
K 214 N 929
Q 215 A 930
K 216 I 931
Q 217 V 932
G 218 Y 933
P 219 N 934
G 220 S 935
N 221 M 936
R 222 Y 937
F 223 E 938
V 224 N 939
G 225 F 940
C 226 S 941
R 227 T 942
A 228 S 943
W 229 F 944
E 230 W 945
N 231 I 946
S 232 R 947
D 233 I 948
D 234 P 949
G 235 K 950
F 236 Y 951
D 237 F 952
L 238 N 953
F 239 S 954
D 240 I 955
S 241 S 956
P 242 L 957
Q 243 N 958
K 244 N 959
V 245 E 960
V 246 Y 961
I 247 T 962
E 248 I 963
N 249 I 964
S 250 N 965
W 251 C 966
A 252 M 967
F 253 E 968
R 254 N 969
N 255 N 970
G 256 S 971
I 257 G 972
W 260 W 973
N 261 K 974
D 262 V 975
S 263 S 976
A 264 L 977
F 265 N 978
A 266 Y 979
G 267 G 980
N 268 E 981
G 269 I 982
N 270 I 983
G 271 W 984
F 272 T 985
K 273 L 986
L 274 Q 987
G 275 D 988
G 276 T 989
N 277 Q 990
Q 278 E 991
A 279 I 992
V 280 K 993
G 281 Q 994
N 282 R 995
H 283 V 996
R 284 V 997
I 285 F 998
T 286 K 999
R 287 Y 1000
S 288 S 1001
V 289 Q 1002
A 290 M 1003
F 291 I 1004
G 292 N 1005
N 293 I 1006
V 294 S 1007
S 295 D 1008
K 296 Y 1009
G 297 I 1010
F 298 N 1011
D 299 R 1012
Q 300 W 1013
N 301 I 1014
N 302 F 1015
N 303 V 1016
A 304 T 1017
G 305 I 1018
G 306 T 1019
V 307 N 1020
T 308 N 1021
V 309 R 1022
I 310 L 1023
N 311 N 1024
N 312 N 1025
T 313 K 1027
S 314 I 1028
Y 315 Y 1029
K 316 I 1030
N 317 N 1031
G 318 G 1032
I 319 R 1033
N 320 L 1034
Y 321 I 1035
G 322 D 1036
F 323 Q 1037
G 324 K 1038
S 325 P 1039
N 326 I 1040
V 327 S 1041
Q 328 N 1042
S 329 L 1043
G 330 G 1044
Q 331 N 1045
K 332 I 1046
H 333 H 1047
Y 334 A 1048
F 335 S 1049
R 336 N 1050
N 337 N 1051
N 338 I 1052
V 339 M 1053
S 340 F 1054
L 341 K 1055
S 342 L 1056
A 343 D 1057
S 344 G 1058
V 345 C 1059
T 346 R 1060
V 347 D 1061
S 348 T 1062
N 349 H 1063
A 350 R 1064
D 351 Y 1065
A 352 I 1066
K 353 W 1067
A 363 I 1068
S 364 K 1069
A 365 Y 1070
S 366 F 1071
D 367 N 1072
F 368 L 1073
V 369 F 1074
S 370 D 1075
L 371 K 1076
D 372 E 1077
T 373 L 1078
S 374 N 1079
L 375 E 1080
A 376 K 1081
T 377 E 1082
V 378 I 1083
S 379 K 1084
R 380 D 1085
D 381 L 1086
N 382 Y 1087
D 383 D 1088
G 384 N 1089
T 385 Q 1090
L 386 S 1091
P 387 N 1092
E 388 S 1093
T 389 G 1094
S 390 I 1095
L 391 L 1096
F 392 K 1097
R 393 D 1098
L 394 F 1099
S 395 W 1100
A 396 G 1101
N 397 D 1102
S 398 Y 1103
K 399 L 1104
L 400 Q 1105
I 401 Y 1106
N 402 D 1107
A 403 K 1108
G 404 P 1109
T 405 Y 1110
K 406 Y 1111
E 407 M 1112
S 408 L 1113
N 409 N 1114
I 410 L 1115
S 411 Y 1116
Y 412 D 1117
S 413 P 1118
G 414 N 1119
S 415 K 1120
A 416 Y 1121
P 417 V 1122
D 418 D 1123
L 419 V 1124
G 420 N 1125
A 421 N 1126
TER
END

