
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 2650-8406-4261
REMARK Target Was Recognized by Good DDP Score
REMARK DDP Alignments tend to be better, so we will go with that
REMARK The DDP was used as a prior with nominal (1/3) sequence information included
REMARK Higher Gap Penalties of 1.6 and .3 were used
METHOD This pairwise alignment was produced using the DDP Method
METHOD Fold Choice was validated by H3P2
MODEL 1
PARENT 1dbg_A
S 55 Q 26
S 56 V 27
F 57 V 28
N 58 A 29
A 59 S 30
P 60 N 31
M 61 E 32
S 62 T 33
F 63 L 34
S 64 Y 35
A 65 Q 36
A 66 V 37
M 67 V 38
A 68 K 39
A 69 E 40
V 70 V 41
N 71 K 42
P 72 P 43
G 73 G 44
E 74 G 45
L 75 L 46
I 76 V 47
L 77 Q 48
L 78 I 49
K 79 A 50
P 80 D 51
G 81 G 52
T 82 T 53
Y 83 Y 54
T 84 D 56
I 85 V 57
T 94 Q 58
I 95 L 59
T 96 I 60
F 97 V 61
N 98 S 62
K 99 N 63
S 100 S 64
G 101 G 65
K 102 K 66
D 103 S 67
G 104 G 68
A 105 L 69
P 106 P 70
I 107 I 71
Y 108 T 72
V 109 I 73
A 110 K 74
A 111 A 75
A 112 L 76
N 113 N 77
C 114 P 78
G 115 G 79
R 116 K 80
A 117 V 81
V 118 F 82
F 119 F 83
D 120 D 86
F 121 A 87
S 122 K 88
F 123 V 89
P 124 E 90
V 129 L 91
Q 130 R 92
A 131 G 93
S 132 E 94
Y 133 H 95
F 135 L 96
Y 136 I 97
V 137 L 98
T 138 E 99
G 139 G 100
Y 141 I 101
W 142 W 102
F 144 F 103
K 145 K 104
G 146 N 107
V 147 R 108
E 148 A 109
V 149 I 110
T 150 Q 111
R 151 A 112
A 152 W 113
G 153 K 114
Y 154 S 115
Q 155 H 116
G 156 G 117
A 157 P 118
Y 158 G 119
V 159 L 120
I 160 V 121
G 161 G 125
S 162 S 126
H 163 Y 127
N 164 N 128
T 165 R 129
F 166 I 130
E 167 T 131
N 168 A 132
T 169 C 133
A 170 V 134
F 171 F 135
H 172 D 136
H 173 D 139
N 174 E 140
R 175 A 141
N 176 N 142
T 177 S 143
G 178 A 144
L 179 I 146
E 180 T 147
I 181 T 148
N 182 E 152
N 183 D 153
G 184 G 154
G 185 K 155
S 186 S 166
Y 187 F 167
N 188 T 168
T 189 D 169
V 190 K 170
I 191 I 171
N 192 T 172
S 193 F 173
D 194 D 174
A 195 Q 175
Y 196 V 176
R 197 I 177
N 198 N 178
Y 199 L 179
D 200 N 180
K 202 N 181
K 203 T 182
N 204 A 183
G 205 R 184
S 206 A 185
M 207 I 186
A 208 K 187
D 209 D 188
G 210 G 189
F 211 V 191
G 212 G 192
G 218 G 193
P 219 P 194
G 220 G 195
N 221 H 198
R 222 R 199
F 223 F 204
V 224 F 205
G 225 G 217
C 226 I 218
R 227 R 219
A 228 G 221
W 229 Y 222
E 230 Y 223
N 231 R 224
S 232 N 225
D 233 D 226
D 234 I 227
G 235 G 228
F 236 V 232
D 237 D 233
L 238 L 236
F 239 F 237
D 240 D 241
S 241 S 242
P 242 E 243
Q 243 A 244
K 244 E 245
V 245 I 246
V 246 I 247
I 247 S 251
E 248 Q 252
N 249 E 253
S 250 T 260
W 251 Y 261
A 252 L 262
F 253 F 270
R 254 R 271
N 255 H 272
G 256 G 273
I 257 I 279
N 258 N 281
Y 259 F 282
W 260 Y 283
N 261 N 286
D 262 D 287
S 263 Q 288
A 264 R 289
F 265 F 290
G 267 G 291
N 268 Y 292
G 269 G 293
N 270 G 294
G 271 M 295
F 272 F 296
L 274 V 297
G 275 W 298
G 276 G 299
N 277 S 300
Q 278 R 301
A 279 V 303
V 280 I 304
G 281 A 305
N 282 N 307
H 283 Y 308
R 284 E 310
I 285 L 311
T 286 S 312
R 287 E 313
S 288 N 320
V 289 A 321
A 290 A 322
F 291 L 323
G 292 Y 324
V 294 L 325
S 295 N 326
K 296 P 327
G 297 G 328
F 298 A 329
D 299 M 330
Q 300 A 331
N 301 S 332
N 302 E 333
N 303 H 334
A 304 A 335
G 305 L 336
G 306 A 337
V 307 F 338
T 308 D 339
V 309 M 340
I 310 I 342
N 311 A 343
N 312 N 344
T 313 N 345
S 314 A 346
Y 315 F 347
K 316 I 348
N 317 N 349
I 319 V 350
N 320 N 351
Y 321 Y 353
G 322 A 354
F 323 I 355
G 324 H 356
S 325 F 357
N 326 N 358
V 327 L 360
Q 328 D 361
S 329 E 362
G 330 R 363
Q 331 R 364
K 332 K 365
H 333 E 366
Y 334 Y 367
F 335 F 375
R 336 E 376
N 337 H 379
N 338 Q 380
V 339 L 381
S 340 M 382
L 341 L 383
S 342 K 384
A 343 G 385
S 344 L 387
V 345 F 388
T 346 F 389
V 347 K 390
S 348 D 391
N 349 K 392
A 350 P 393
D 351 D 402
A 352 A 406
K 353 G 407
S 354 K 408
N 355 N 409
S 356 S 410
W 357 W 411
T 359 T 412
G 360 G 413
P 361 N 414
A 362 V 415
A 363 A 416
S 364 L 417
A 365 G 418
S 366 V 419
D 367 E 420
F 368 K 421
V 369 I 423
S 370 P 424
L 371 V 425
D 372 N 426
T 373 I 427
S 374 S 428
A 376 A 429
T 377 N 430
V 378 R 431
S 379 S 432
R 380 A 433
D 381 Y 434
N 382 K 435
D 383 P 436
G 384 V 437
T 385 K 438
L 386 I 439
P 387 K 440
E 388 D 441
T 389 I 442
S 390 Q 443
L 391 P 444
F 392 I 445
R 393 E 446
L 394 L 450
S 395 D 451
A 396 L 452
N 397 N 453
S 398 A 454
L 400 L 455
I 401 I 456
N 402 S 457
A 403 K 458
G 404 G 459
T 405 I 460
K 406 T 461
E 407 G 462
S 408 K 463
N 409 P 464
I 410 L 465
S 411 S 466
Y 412 W 467
S 413 D 468
G 414 E 469
S 415 V 470
A 416 R 471
P 417 P 472
D 418 E 477
L 419 M 478
G 420 G 480
A 421 T 481
F 422 Y 482
E 423 D 491
R 424 R 492
N 425 H 506
TER
END



