
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1DBG_A
REMARK DATE	2000-01-11
REMARK SCORE	?
S 55 Q 26
S 56 V 27
F 57 V 28
N 58 A 29
A 59 S 30
P 60 N 31
M 61 E 32
S 62 T 33
F 63 L 34
S 64 Y 35
A 65 Q 36
A 66 V 37
M 67 V 38
A 68 K 39
A 69 E 40
V 70 V 41
N 71 K 42
P 72 P 43
G 73 G 44
E 74 G 45
L 75 L 46
I 76 V 47
L 77 Q 48
L 78 I 49
K 79 A 50
P 80 D 51
G 81 G 52
T 82 T 53
Y 83 Y 54
T 84 K 55
I 85 D 56
P 86 V 57
Y 87 Q 58
T 88 L 59
Q 89 I 60
G 90 V 61
K 91 S 62
G 92 N 63
N 93 S 64
T 94 G 65
I 95 K 66
T 96 S 67
F 97 G 68
N 98 L 69
K 99 P 70
S 100 I 71
G 101 T 72
K 102 I 73
D 103 K 74
G 104 A 75
A 105 L 76
P 106 N 77
I 107 P 78
Y 108 G 79
V 109 K 80
A 110 V 81
A 111 F 82
A 112 F 83
N 113 T 84
C 114 G 85
G 115 D 86
R 116 A 87
A 117 K 88
V 118 V 89
F 119 E 90
D 120 L 91
F 121 R 92
S 122 G 93
F 123 E 94
P 124 H 95
D 125 L 96
S 126 I 97
Q 127 L 98
W 128 E 99
V 129 G 100
Q 130 I 101
A 131 W 102
S 132 F 103
Y 133 K 104
G 134 D 105
F 135 G 106
Y 136 N 107
V 137 R 108
T 138 A 109
G 139 I 110
D 140 Q 111
Y 141 A 112
W 142 W 113
Y 143 K 114
F 144 S 115
K 145 H 116
G 146 G 117
V 147 P 118
E 148 G 119
V 149 L 120
T 150 V 121
R 151 A 122
A 152 I 123
G 153 G 125
Y 154 S 126
Q 155 Y 127
G 156 N 128
A 157 R 129
Y 158 I 130
V 159 T 131
I 160 A 132
G 161 C 133
S 162 V 134
H 163 F 135
N 164 D 136
T 165 C 137
F 166 F 138
E 167 D 139
N 168 E 140
T 169 A 141
A 170 N 142
F 171 S 143
H 172 A 144
H 173 Y 145
N 174 I 146
R 175 T 147
N 176 T 148
T 177 S 149
G 178 L 150
L 179 D 153
E 180 G 154
I 181 K 155
N 182 V 156
N 183 P 157
G 184 Q 158
G 185 H 159
S 186 C 160
Y 187 R 161
N 188 I 162
T 189 D 163
V 190 H 164
I 191 C 165
N 192 S 166
S 193 F 167
D 194 T 168
A 195 D 169
Y 196 K 170
R 197 I 171
N 198 T 172
Y 199 F 173
D 200 D 174
P 201 Q 175
K 202 V 176
K 203 I 177
N 204 N 178
G 205 L 179
S 206 N 180
M 207 N 181
A 208 T 182
D 209 A 183
G 210 R 184
F 211 A 185
G 212 D 188
P 213 G 189
K 214 S 190
Q 215 V 191
K 216 G 192
Q 217 G 193
G 218 P 194
P 219 G 195
G 220 C 203
N 221 F 204
R 222 F 205
F 223 S 206
V 224 N 207
G 225 P 208
C 226 Q 209
R 227 K 210
A 228 P 211
W 229 G 212
E 230 N 213
N 231 A 214
S 232 G 215
D 233 G 216
D 234 G 217
G 235 I 218
F 236 R 219
D 237 I 220
L 238 G 221
F 239 Y 222
D 240 Y 223
S 241 R 224
P 242 N 225
Q 243 D 226
K 244 I 227
V 245 G 228
V 246 R 229
I 247 C 230
E 248 L 231
N 249 V 232
S 250 D 233
W 251 S 234
A 252 N 235
F 253 L 236
R 254 F 237
N 255 M 238
G 256 R 239
I 257 Q 240
N 258 S 242
Y 259 E 243
W 260 A 244
N 261 E 245
D 262 I 246
S 263 I 247
A 264 T 248
F 265 S 249
A 266 K 250
G 267 S 251
N 268 Q 252
G 269 E 253
N 270 N 254
G 271 V 255
F 272 Y 256
K 273 Y 257
L 274 G 258
G 275 N 259
G 276 T 260
N 277 Y 261
Q 278 L 262
A 279 N 263
V 280 C 264
G 281 Q 265
N 282 G 266
H 283 T 267
R 284 M 268
I 285 N 269
T 286 G 273
R 287 D 274
S 288 H 275
V 289 Q 276
A 290 V 277
F 291 A 278
G 292 I 279
N 293 N 280
V 294 N 281
S 295 F 282
K 296 Y 283
G 297 I 284
F 298 G 285
D 299 N 286
Q 300 D 287
N 301 Q 288
N 302 R 289
N 303 F 290
A 304 G 291
G 305 Y 292
G 306 G 293
V 307 G 294
T 308 M 295
V 309 F 296
I 310 V 297
N 311 W 298
N 312 G 299
T 313 S 300
S 314 R 301
Y 315 H 302
K 316 V 303
N 317 I 304
G 318 A 305
I 319 C 306
N 320 N 307
Y 321 Y 308
G 322 F 309
F 323 E 310
G 324 L 311
S 325 S 312
N 326 E 313
V 327 T 314
Q 328 I 315
S 329 K 316
G 330 S 317
Q 331 R 318
K 332 G 319
H 333 N 320
Y 334 A 321
F 335 A 322
R 336 L 323
N 337 Y 324
N 338 L 325
V 339 N 326
S 340 P 327
L 341 G 328
S 342 A 329
A 343 M 330
S 344 A 331
V 345 S 332
T 346 E 333
V 347 H 334
S 348 A 335
N 349 L 336
A 350 A 337
D 351 F 338
A 352 D 339
K 353 M 340
S 354 L 341
N 355 I 342
S 356 A 343
W 357 N 344
D 358 N 345
T 359 A 346
G 360 F 347
P 361 I 348
A 362 N 349
A 363 V 350
S 364 N 351
A 365 G 352
S 366 Y 353
D 367 A 354
F 368 I 355
V 369 H 356
S 370 F 357
L 371 N 358
D 372 P 359
T 373 L 360
TER
END

