
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  1
PARENT 1kit
A  26    D   48
D  27    N   49
C  28    T   50
S  29    N   51
S  30    N   52
D  31    G   53
L  32    S   54
T  33    G   55
S  34    V   56
G  35    L   57
I  36    T   58
S  37    N   59
T  38    A   60
K  39    D   61
R  40    G   62
I  41    M   63
Y  42    P   64
Y  43    A   65
V  44    W   66
A  45    L   67
P  46    V   68
N  47    Q   69
G  48    G   70
N  49    I   71
S  50    G   72
S  51    G   73
N  52    R   74
N  53    A   75
G  54    Q   76
S  55    W   77
S  56    T   78
F  57    Y   79
N  58    S   80
A  59    L   81
P  60    S   82
M  61    T   83
A  65    A   89
A  66    S   90
M  67    S   91
A  68    F   92
A  69    G   93
V  70    W   94
N  71    R   95
P  72    M   96
G  73    T   97
E  74    T   98
L  75    E   99
I  76    M  100
L  77    K  101
L  78    V  102
K  79    L  103
P  80    S  104
G  81    G  105
T  82    G  106
Y  83    M  107
T  84    I  108
I  85    T  109
P  86    N  110
Y  87    Y  111
T  88    Y  112
Q  89    A  113
G  90    N  114
K  91    G  115
G  92    T  116
N  93    Q  117
T  94    R  118
I  95    V  119
T  96    L  120
F  97    P  121
N  98    I  122
K  99    I  123
S 100    S  124
G 101    L  125
K 102    D  126
D 103    S  127
G 104    S  128
A 105    G  129
P 106    N  130
I 107    L  131
Y 108    V  132
V 109    V  133
A 110    E  134
A 111    F  135
A 112    E  136
N 113    G  137
C 114    Q  138
G 115    T  139
R 116    G  140
A 117    R  141
V 118    T  142
F 119    V  143
F 123    T  146
P 124    G  147
D 125    T  148
S 126    A  149
Q 127    A  150
W 128    T  151
V 129    E  152
Q 130    Y  153
A 131    H  154
S 132    K  155
Y 133    F  156
G 134    E  157
F 135    L  158
Y 136    V  159
V 137    F  160
T 138    L  161
G 139    P  162
D 140    G  163
Y 141    S  164
W 142    N  165
Y 143    P  166
F 144    S  167
K 145    A  168
G 146    S  169
V 147    F  170
E 148    Y  171
V 149    F  172
T 150    D  173
R 151    G  174
A 152    K  175
G 153    L  176
Y 154    I  177
Q 155    R  178
G 156    D  179
A 157    N  180
Y 158    I  181
V 159    Q  182
I 160    P  183
G 161    T  184
S 162    A  185
H 163    S  186
N 164    K  187
T 165    Q  188
F 166    N  189
E 167    M  190
N 168    I  191
T 169    V  192
A 170    W  193
F 171    G  194
H 172    N  195
H 173    G  196
N 174    S  197
R 175    S  198
N 176    N  199
T 177    T  200
G 178    D  201
L 179    G  202
E 180    V  203
I 181    A  204
N 182    A  205
N 183    Y  206
G 184    R  207
G 185    D  208
S 186    I  209
Y 187    K  210
N 188    F  211
T 189    E  212
V 190    I  213
I 191    Q  214
N 192    G  215
S 193    D  216
D 194    V  217
A 195    I  218
Y 196    F  219
R 197    R  220
N 198    G  221
N 204    L  254
G 205    S  255
S 206    N  256
M 207    T  257
A 208    N  258
D 209    D  259
G 210    I  260
F 211    I  261
G 212    T  262
P 213    R  263
K 214    T  264
Q 215    S  265
K 216    R  266
Q 217    D  267
G 218    G  268
P 219    G  269
G 220    I  270
N 221    T  271
R 222    W  272
F 223    D  273
V 224    T  274
G 225    E  275
C 226    L  276
R 227    N  277
A 228    L  278
W 229    T  279
E 230    E  280
N 231    Q  281
S 232    I  282
D 233    N  283
D 234    V  284
G 235    S  285
F 236    D  286
D 237    E  287
L 238    F  288
F 239    D  289
D 240    F  290
S 241    S  291
P 242    D  292
Q 243    P  293
K 244    R  294
V 245    P  295
V 246    I  296
I 247    Y  297
E 248    D  298
N 249    P  299
F 253    A  338
R 254    S  339
N 255    G  340
G 256    N  341
I 257    W  342
N 258    Q  343
Y 259    A  344
W 260    P  345
N 261    I  346
D 262    D  347
S 263    V  348
A 264    T  349
F 265    D  350
A 266    Q  351
G 267    V  352
N 268    K  353
G 269    E  354
N 270    R  355
G 271    S  356
F 272    F  357
K 273    Q  358
L 274    I  359
G 275    A  360
G 276    G  361
N 277    W  362
Q 278    G  363
A 279    G  364
V 280    S  365
G 281    E  366
N 282    L  367
H 283    Y  368
R 284    R  369
I 285    R  370
T 286    N  371
R 287    T  372
S 288    S  373
V 289    L  374
A 290    N  375
F 291    S  376
G 292    Q  377
N 293    Q  378
V 294    D  379
S 295    W  380
K 296    Q  381
G 297    S  382
F 298    N  383
D 299    A  384
Q 300    K  385
N 301    I  386
N 302    R  387
N 303    I  388
A 304    V  389
G 305    D  390
G 306    G  391
V 307    A  392
T 308    A  393
V 309    N  394
I 310    Q  395
N 311    I  396
N 312    Q  397
T 313    V  398
S 314    A  399
Y 315    D  400
K 316    G  401
N 317    S  402
G 318    R  403
I 319    K  404
N 320    Y  405
Y 321    V  406
G 322    V  407
F 323    T  408
G 324    L  409
S 325    S  410
N 326    I  411
V 327    D  412
Q 328    E  413
S 329    S  414
G 330    G  415
Q 331    G  416
K 332    L  417
H 333    V  418
Y 334    A  419
F 335    N  420
R 336    L  421
N 337    N  422
N 338    G  423
V 339    V  424
S 340    S  425
L 341    A  426
S 342    P  427
A 343    I  428
S 348    A  467
N 349    G  468
A 350    E  469
D 351    V  470
A 352    S  471
K 353    Q  472
S 354    E  473
N 355    N  474
S 356    N  475
W 357    I  476
D 358    Q  477
T 359    F  478
G 360    G  479
P 361    N  480
A 362    A  481
A 363    D  482
S 364    A  483
A 365    Q  484
S 366    I  485
D 372    S  608
T 373    S  609
S 374    S  610
L 375    I  611
A 376    L  612
T 377    E  613
V 378    T  614
S 379    L  615
R 380    E  616
D 381    P  617
N 382    S  618
D 383    E  619
G 384    A  620
T 385    D  621
L 386    M  622
P 387    V  623
E 388    E  624
T 389    L  625
S 390    Q  626
L 394    V  725
S 395    T  726
A 396    W  727
N 397    K  728
S 398    G  729
K 399    P  730
L 400    I  731
I 401    Q  732
N 402    L  733
A 403    V  734
G 404    N  735
T 405    G  736
K 406    A  737
E 407    S  738
S 408    A  739
N 409    Y  740
I 410    S  741
S 411    D  742
Y 412    I  743
S 413    Y  744
G 414    Q  745
S 415    L  746
A 416    D  747
P 417    S  748
D 418    E  749
F 422    K  773
E 423    Q  774
R 424    K  775
N 425    L  776
TER
END


