
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  2
PARENT 1bgm_N
A  26    D  224
D  27    F  225
C  28    H  226
S  29    V  227
S  30    A  228
D  31    T  229
L  32    R  230
T  33    F  231
S  34    N  232
G  35    D  233
I  36    D  234
S  37    F  235
T  38    S  236
K  39    R  237
R  40    A  238
I  41    V  239
Y  42    L  240
Y  43    E  241
V  44    A  242
A  45    E  243
P  46    V  244
N  47    Q  245
G  48    M  246
N  49    C  247
S  50    G  248
S  51    E  249
N  52    L  250
N  53    R  251
G  54    D  252
S  55    Y  253
S  56    L  254
F  57    R  255
N  58    V  256
A  59    T  257
P  60    V  258
M  61    S  259
S  62    L  260
F  63    W  261
S  64    Q  262
A  65    G  263
A  66    E  264
M  67    T  265
A  68    Q  266
A  69    V  267
V  70    A  268
N  71    S  269
P  72    G  270
G  73    T  271
E  74    A  272
L  75    P  273
I  76    F  274
L  77    G  275
L  78    G  276
K  79    E  277
P  80    I  278
G  81    I  279
T  82    D  280
Y  83    E  281
T  84    R  282
I  85    G  283
P  86    G  284
Y  87    Y  285
T  88    A  286
Q  89    D  287
G  90    R  288
K  91    V  289
G  92    T  290
N  93    L  291
T  94    R  292
I  95    L  293
T  96    N  294
F  97    V  295
N  98    E  296
K  99    N  297
S 100    P  298
G 101    K  299
K 102    L  300
D 103    W  301
G 104    S  302
A 105    A  303
P 106    E  304
A 112    I  337
N 113    E  338
C 114    N  339
G 115    G  340
R 116    L  341
A 117    L  342
V 118    L  343
F 119    L  344
D 120    N  345
F 121    G  346
S 122    K  347
F 123    P  348
P 124    L  349
D 125    L  350
S 126    I  351
Q 127    R  352
W 128    G  353
V 129    V  354
Q 130    N  355
A 131    R  356
S 132    H  357
Y 133    E  358
G 134    H  359
F 135    H  360
Y 136    P  361
V 137    L  362
T 138    H  363
G 139    G  364
D 140    Q  365
Y 141    V  366
W 142    M  367
Y 143    D  368
F 144    E  369
K 145    Q  370
V 149    V  373
G 153    L  397
A 157    T  400
S 162    Q  445
F 166    I  475
E 167    K  476
N 168    S  477
T 169    V  478
A 170    D  479
F 171    P  480
H 172    S  481
H 173    R  482
N 174    P  483
R 175    V  484
N 176    Q  485
T 177    Y  486
G 178    E  487
L 179    G  488
E 180    G  489
I 181    G  490
N 182    A  491
N 183    D  492
G 184    T  493
G 185    T  494
S 186    A  495
Y 187    T  496
N 188    D  497
T 189    I  498
V 190    I  499
I 191    C  500
N 192    P  501
S 193    M  502
D 194    Y  503
A 195    A  504
Y 196    R  505
R 197    V  506
N 198    D  507
Y 199    E  508
D 200    D  509
P 201    Q  510
K 202    P  511
K 203    F  512
N 204    P  513
G 205    A  514
S 206    V  515
M 207    P  516
A 208    K  517
D 209    W  518
G 210    S  519
F 211    I  520
G 212    K  521
P 213    K  522
K 214    W  523
Q 215    L  524
K 216    S  525
Q 217    L  526
G 218    P  527
P 219    G  528
G 220    E  529
N 221    T  530
R 222    R  531
F 223    P  532
V 224    L  533
G 225    I  534
C 226    L  535
R 227    C  536
A 228    E  537
W 229    Y  538
E 230    A  539
N 231    H  540
S 232    A  541
D 233    M  542
D 234    G  543
G 235    N  544
F 236    S  545
D 237    L  546
L 238    G  547
F 239    G  548
D 240    F  549
S 241    A  550
V 245    H  622
S 250    Q  628
W 251    F  629
A 252    R  630
F 253    L  631
R 254    S  632
N 255    G  633
G 256    Q  634
I 257    T  635
N 258    I  636
Y 259    E  637
W 260    V  638
N 261    T  639
D 262    S  640
S 263    E  641
A 264    Y  642
F 265    L  643
A 266    F  644
G 267    R  645
N 268    H  646
G 269    S  647
N 270    D  648
G 271    N  649
F 272    E  650
K 273    L  651
L 274    L  652
G 275    H  653
G 276    W  654
N 277    M  655
Q 278    V  656
A 279    A  657
V 280    L  658
G 281    D  659
N 282    G  660
H 283    K  661
R 284    P  662
I 285    L  663
T 286    A  664
R 287    S  665
S 288    G  666
V 289    E  667
A 290    V  668
F 291    P  669
G 292    L  670
N 293    D  671
V 294    V  672
S 295    A  673
K 296    P  674
G 297    Q  675
F 298    G  676
D 299    K  677
Q 300    Q  678
N 301    L  679
N 302    I  680
N 303    E  681
A 304    L  682
G 305    P  683
G 306    E  684
V 307    L  685
T 308    P  686
V 309    Q  687
I 310    P  688
N 311    E  689
N 312    S  690
T 313    A  691
N 317    E  724
G 318    N  725
I 319    L  726
N 320    S  727
Y 321    V  728
G 322    T  729
F 323    L  730
G 324    P  731
S 325    A  732
N 326    A  733
V 327    S  734
Q 328    H  735
S 329    A  736
G 330    I  737
Q 331    P  738
K 332    H  739
H 333    L  740
Y 334    T  741
F 335    T  742
R 336    S  743
N 337    E  744
N 338    M  745
S 344    L  823
V 345    Q  824
T 346    C  825
V 347    T  826
S 348    A  827
N 349    D  828
A 350    T  829
D 351    L  830
A 352    A  831
K 353    D  832
S 354    A  833
N 355    V  834
S 356    L  835
W 357    I  836
D 358    T  837
T 359    T  838
G 360    A  839
P 361    H  840
A 362    A  841
A 363    W  842
S 364    Q  843
A 365    H  844
S 366    Q  845
D 367    G  846
F 368    K  847
D 372    S  874
T 373    D  875
S 374    T  876
L 375    P  877
A 376    H  878
T 377    P  879
V 378    A  880
S 379    R  881
R 380    I  882
D 381    G  883
N 382    L  884
D 383    N  885
G 384    C  886
T 385    Q  887
L 386    L  888
P 387    A  889
E 388    Q  890
T 389    V  891
S 390    A  892
L 394    H  949
S 395    Q  950
A 396    W  951
N 397    R  952
S 398    G  953
K 399    D  954
L 400    F  955
I 401    Q  956
N 402    F  957
A 403    N  958
G 404    I  959
T 405    S  960
K 406    R  961
E 407    Y  962
S 408    S  963
N 409    Q  964
S 413    T  970
G 414    S  971
S 415    H  972
A 416    R  973
P 417    H  974
D 418    L  975
L 419    L  976
G 420    H  977
A 421    A  978
F 422    E  979
E 423    E  980
R 424    G  981
N 425    T  982
TER
END


