
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  3
PARENT 1f13_A
D  27    R    5
C  28    T    6
S  29    A    7
S  30    F    8
D  31    G    9
L  32    G   10
T  33    R   11
S  34    R   12
G  35    A   13
I  36    V   14
S  37    P   15
T  38    P   16
K  39    N   17
R  40    N   18
I  41    S   19
Y  42    N   20
Y  43    A   21
V  44    A   22
A  45    E   23
P  46    D   24
N  47    D   25
G  48    L   26
N  49    P   27
S  50    T   28
S  51    V   29
N  52    E   30
N  53    L   31
G  54    Q   32
S  55    G   33
S  56    V   34
F  57    V   35
N  58    P   36
S  62    L   41
F  63    Q   42
S  64    E   43
A  65    F   44
V  70    R   95
N  71    R   96
P  72    D   97
G  73    L   98
E  74    F   99
L  75    R  100
I  76    V  101
L  77    E  102
L  78    Y  103
K  79    V  104
P  80    I  105
G  81    G  106
T  82    R  107
Y  83    Y  108
T  84    P  109
I  85    Q  110
P  86    E  111
Y  87    N  112
T  88    K  113
Q  89    G  114
G  90    T  115
K  91    Y  116
G  92    I  117
N  93    P  118
T  94    V  119
I  95    P  120
T  96    I  121
F  97    V  122
N  98    S  123
K  99    E  124
S 100    L  125
G 101    Q  126
K 102    S  127
D 103    G  128
G 104    K  129
A 105    W  130
P 106    G  131
I 107    A  132
Y 108    K  133
V 109    I  134
A 110    V  135
A 111    M  136
A 112    R  137
N 113    E  138
C 114    D  139
G 115    R  140
R 116    S  141
A 117    V  142
V 118    R  143
F 119    L  144
D 120    S  145
F 121    I  146
S 122    Q  147
F 123    S  148
P 124    S  149
D 125    P  150
S 126    K  151
Q 127    C  152
W 128    I  153
V 129    V  154
Q 130    G  155
A 131    K  156
S 132    F  157
Y 133    R  158
G 134    M  159
F 135    Y  160
Y 136    V  161
V 137    A  162
T 138    V  163
G 139    W  164
D 140    T  165
Y 141    P  166
W 142    Y  167
Y 143    G  168
F 144    V  169
K 145    L  170
G 146    R  171
V 147    T  172
E 148    S  173
V 149    R  174
T 150    N  175
R 151    P  176
A 152    E  177
G 153    T  178
Y 154    D  179
Q 155    T  180
G 156    Y  181
A 157    I  182
Y 158    L  183
V 159    F  184
I 160    N  185
G 161    P  186
S 162    W  187
H 163    C  188
N 168    E  200
T 169    R  201
A 170    E  202
F 171    E  203
H 172    Y  204
H 173    V  205
N 174    L  206
R 175    N  207
N 176    D  208
T 177    I  209
G 178    G  210
L 179    V  211
E 180    I  212
I 181    F  213
N 182    Y  214
N 183    G  215
G 184    E  216
G 185    V  217
S 186    N  218
Y 187    D  219
N 188    I  220
T 189    K  221
V 190    T  222
I 191    R  223
N 192    S  224
S 193    W  225
D 194    S  226
A 195    Y  227
Y 196    G  228
R 197    Q  229
N 198    F  230
Y 199    E  231
D 200    D  232
P 201    G  233
G 205    L  239
G 210    R  260
Q 215    P  383
K 216    D  384
Q 217    L  385
G 218    P  386
P 219    V  387
G 220    G  388
N 221    F  389
R 227    H  419
A 228    G  420
W 229    H  421
E 230    V  422
N 231    C  423
S 232    F  424
D 233    Q  425
D 234    F  426
G 235    D  427
F 236    A  428
D 237    P  429
L 238    F  430
F 239    V  431
D 240    F  432
S 241    A  433
P 242    E  434
Q 243    V  435
K 244    N  436
V 245    S  437
V 246    D  438
I 247    L  439
E 248    I  440
N 249    Y  441
S 250    I  442
W 251    T  443
A 252    A  444
F 253    K  445
R 254    K  446
N 255    D  447
G 256    G  448
I 257    T  449
N 258    H  450
Y 259    V  451
W 260    V  452
N 261    E  453
D 262    N  454
S 263    V  455
A 264    D  456
F 265    A  457
A 266    T  458
G 267    H  459
N 268    I  460
G 269    G  461
N 270    K  462
G 271    L  463
F 272    I  464
K 273    V  465
L 274    T  466
G 275    K  467
G 276    Q  468
N 277    I  469
Q 278    G  470
A 279    G  471
V 280    D  472
G 281    G  473
R 287    D  476
S 288    I  477
V 289    T  478
A 290    D  479
F 291    T  480
G 292    Y  481
N 293    K  482
V 294    F  483
S 295    Q  484
K 296    E  485
G 297    G  486
F 298    Q  487
D 299    E  488
N 303    L  494
V 307    Y  500
T 308    G  501
V 309    A  502
I 310    K  503
N 311    K  504
N 312    P  505
T 313    L  506
S 314    N  507
Y 315    T  508
K 316    E  509
N 317    G  510
G 318    V  511
I 319    M  512
N 320    K  513
Y 321    S  514
G 322    R  515
F 323    S  516
G 324    N  517
S 325    V  518
N 326    D  519
V 327    M  520
Q 328    D  521
S 329    F  522
G 330    E  523
Q 331    V  524
K 332    E  525
H 333    N  526
Y 334    A  527
F 335    V  528
R 336    L  529
N 337    G  530
N 338    K  531
V 339    D  532
S 340    F  533
L 341    K  534
S 342    L  535
A 343    S  536
S 348    T  572
N 349    F  573
A 350    D  574
D 351    V  575
A 352    T  576
K 353    L  577
S 354    E  578
N 355    P  579
S 356    L  580
W 357    S  581
D 358    F  582
T 359    K  583
G 360    K  584
P 361    E  585
A 362    A  586
A 363    V  587
S 364    L  588
A 365    I  589
S 366    Q  590
L 371    E  593
D 372    Y  594
T 373    M  595
S 374    G  596
L 375    Q  597
A 376    L  598
T 377    L  599
V 378    E  600
S 379    Q  601
R 380    A  602
D 381    S  603
N 382    L  604
D 383    H  605
G 384    F  606
T 385    F  607
L 386    V  608
P 387    T  609
E 388    A  610
T 389    R  611
S 390    I  612
L 391    N  613
F 392    E  614
R 393    T  615
L 394    R  616
S 395    D  617
A 396    V  618
N 397    L  619
S 398    A  620
K 399    K  621
L 400    Q  622
I 401    K  623
N 402    S  624
A 403    T  625
G 404    V  626
T 405    L  627
K 406    T  628
E 407    I  629
S 408    P  630
N 409    E  631
I 410    I  632
S 411    I  633
Y 412    I  634
S 413    K  635
G 414    V  636
S 415    R  637
A 416    G  638
P 417    T  639
D 418    Q  640
L 419    V  641
G 420    V  642
A 421    G  643
F 422    S  644
E 423    D  645
R 424    M  646
N 425    T  647
TER
END


