
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  4
PARENT 1igt_D
A  26    L   18
D  27    K   19
C  28    L   20
S  29    S   21
S  30    C   22
D  31    A   23
L  32    T   24
T  33    S   25
S  34    G   26
G  35    F   27
I  36    T   28
S  37    F   29
T  38    S   30
K  39    D   31
R  40    Y   32
I  41    Y   33
Y  42    M   34
Y  43    Y   35
V  44    W   36
A  45    V   37
P  46    R   38
N  47    Q   39
G  48    T   40
N  49    P   41
S  50    E   42
S  51    K   43
N  52    R   44
N  53    L   45
G  54    E   46
S  55    W   47
S  56    V   48
F  57    A   49
N  58    Y   50
A  59    I   51
P  60    S   52
M  61    N   52A
S  62    G   53
F  63    G   54
S  64    G   55
A  68    S   70
A  69    R   71
V  70    D   72
N  71    N   73
P  72    A   74
G  73    K   75
E  74    N   76
L  75    T   77
I  76    L   78
L  77    Y   79
L  78    L   80
K  79    Q   81
P  80    M   82
G  81    S   82A
T  82    R   82B
Y  83    L   82C
T  84    K   83
I  85    S   84
P  86    E   85
Y  87    D   86
T  88    T   87
Q  89    A   88
G  90    M   89
K  91    Y   90
G  92    Y   91
N  93    C   92
T  94    A   93
I  95    R   94
T  96    H   95
F  97    G   96
N  98    G   97
K  99    Y  100H
S 100    Y  100I
G 101    A  100J
K 102    M  100K
D 103    D  101
G 104    Y  102
A 105    W  103
P 106    G  104
I 107    Q  105
Y 108    G  106
V 109    T  107
A 110    T  108
A 111    V  109
A 112    T  110
N 113    V  111
C 114    S  112
G 115    S  113
R 116    A  114
A 117    K  115
V 118    T  116
F 119    T  117
D 120    A  118
F 121    P  119
S 122    S  120
F 123    V  121
P 124    Y  122
D 125    P  123
S 126    L  124
Q 127    A  125
W 128    P  126
V 129    V  127
Q 130    C  128
A 131    G  129
S 132    D  130
Y 133    T  133
G 134    T  134
F 135    G  135
Y 136    S  136
V 137    S  137
T 138    V  138
G 139    T  139
D 140    L  140
Y 141    G  141
W 142    C  142
Y 143    L  143
F 144    V  144
K 145    K  145
G 146    G  146
V 147    Y  147
E 148    F  148
V 149    P  149
T 150    E  150
R 151    P  151
A 152    V  152
G 153    T  153
Y 154    L  154
Q 155    T  156
G 156    W  157
A 157    N  162
Y 158    S  163
V 159    G  164
I 160    S  165
G 161    L  166
S 162    S  167
H 163    S  168
N 164    G  169
T 165    V  171
F 166    H  172
E 167    T  173
N 168    F  174
T 169    P  175
A 170    A  176
F 171    V  177
H 172    L  178
H 173    Q  179
N 174    S  180
R 175    D  183
N 176    L  184
T 177    Y  185
G 178    T  186
L 179    L  187
E 180    S  188
I 181    S  189
N 182    S  190
N 183    V  191
G 184    T  192
G 185    V  193
S 186    T  194
Y 187    S  195
N 188    S  196
T 189    T  198
V 190    W  199
I 191    P  200
Y 196    D  220
R 197    K  221
N 198    K  222
Y 199    I  223
D 200    E  226
P 201    P  227
K 202    R  228
K 203    G  229
N 204    P  230
G 205    T  231
S 206    I  232
M 207    K  235
A 208    P  236
D 209    C  237
G 210    P  238
F 211    P  239
G 212    C  240
P 213    K  241
K 214    C  242
Q 215    P  243
K 216    A  244
Q 217    P  245
G 218    N  246
P 219    L  247
G 220    L  248
N 221    G  249
R 222    G  250
F 223    P  251
V 224    S  252
G 225    V  253
C 226    F  254
R 227    I  255
A 228    F  256
W 229    P  257
E 230    P  258
N 231    K  259
S 232    I  260
F 236    I  266
D 237    S  267
L 238    L  268
F 239    S  269
D 240    P  270
S 241    I  271
P 242    V  272
Q 243    T  273
K 244    C  274
V 245    V  275
V 246    V  276
I 247    V  277
E 248    D  278
N 249    V  279
S 250    S  280
W 251    E  281
A 252    D  282
F 253    D  283
R 254    P  284
N 255    D  285
G 256    V  286
I 257    Q  287
N 258    I  288
Y 259    S  289
W 260    W  290
N 261    F  291
D 262    V  292
S 263    N  295
A 264    N  296
F 265    V  299
A 266    E  300
G 267    V  301
N 268    H  302
G 269    T  303
N 270    A  304
G 271    Q  305
F 272    T  306
K 273    Q  307
L 274    T  308
G 275    H  309
G 276    R  310
N 277    E  311
Q 278    D  312
A 279    Y  313
V 280    N  314
G 281    S  317
N 282    T  318
H 283    L  319
R 284    R  320
I 285    V  321
T 286    V  322
R 287    S  323
S 288    A  324
V 289    L  325
A 290    P  326
F 291    I  327
G 292    Q  328
N 293    H  329
G 297    G  335
F 298    K  336
D 299    E  337
Q 300    F  338
N 301    K  339
N 302    C  340
N 303    K  341
A 304    V  342
G 305    N  343
G 306    N  344
V 307    K  345
T 308    D  346
V 309    L  347
I 310    P  348
N 311    A  349
N 312    P  350
T 313    I  351
S 314    E  352
Y 315    R  353
K 316    T  354
N 317    I  355
G 318    S  357
I 319    K  358
N 320    P  359
Y 321    K  360
G 322    G  361
F 323    S  363
G 324    V  364
S 325    R  365
N 326    A  366
V 327    P  367
Q 328    Q  368
S 329    V  369
G 330    Y  370
Q 331    V  371
K 332    L  372
H 333    P  373
Y 334    P  374
F 335    P  375
R 336    E  377
N 337    E  378
N 338    E  379
V 339    M  381
S 340    T  382
L 341    K  383
S 342    K  384
T 346    T  387
V 347    L  388
S 348    T  389
N 349    C  390
A 350    M  391
D 351    V  392
A 352    T  393
K 353    D  394
S 354    F  395
N 355    M  396
S 356    P  397
W 357    E  398
D 358    D  399
T 359    I  400
G 360    Y  401
P 361    V  402
A 362    E  405
A 363    W  406
S 364    T  407
A 365    N  408
S 366    N  410
D 367    G  411
L 371    E  416
D 372    L  417
T 373    N  418
S 374    Y  419
L 375    K  420
A 376    N  421
T 377    T  422
V 378    E  423
S 379    P  424
R 380    V  425
D 381    L  426
N 382    D  427
D 383    S  428
G 384    D  430
T 385    G  433
L 386    S  434
P 387    Y  435
E 388    F  436
T 389    M  437
S 390    Y  438
L 391    S  439
F 392    K  440
R 393    L  441
L 394    R  442
S 395    V  443
A 396    E  444
N 397    K  445
S 398    K  446
N 402    V  449
A 403    E  450
G 404    R  451
T 405    N  452
K 406    S  453
E 407    Y  454
S 408    S  455
N 409    C  456
I 410    S  457
S 411    V  458
Y 412    V  459
S 413    H  460
G 414    E  461
S 415    G  462
A 416    L  463
P 417    H  464
D 418    N  465
L 419    H  466
G 420    H  467
A 421    T  468
F 422    T  469
E 423    K  470
R 424    S  471
N 425    F  472
TER
END


