
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  5
PARENT 1dyu_A
A  26    D   11
S  30    F   17
D  31    G   18
L  32    A   19
T  33    D   20
S  34    V   21
G  35    Q   22
I  36    W   23
S  37    D   24
T  38    D   25
K  39    Y   26
R  40    A   27
I  41    Q   28
Y  42    L   29
Y  43    F   30
V  44    T   31
A  45    L   32
P  46    I   33
N  47    K   34
G  48    D   35
N  49    G   36
S  50    A   37
S  51    Y   38
N  52    V   39
N  53    K   40
G  54    V   41
S  55    K   42
S  56    P   43
F  57    G   44
N  58    A   45
A  59    Q   46
P  60    T   47
M  61    A   48
S  62    I   49
F  63    V   50
S  64    N   51
A  65    G   52
A  66    Q   53
N  71    A   56
P  72    L   57
G  73    Q   58
E  74    V   59
L  75    P   60
I  76    V   61
L  77    V   62
L  78    M   63
K  79    K   64
P  80    D   65
G  81    N   66
T  82    K   67
Y  83    A   68
T  84    W   69
I  85    V   70
P  86    S   71
Y  87    D   72
T  88    T   73
Q  89    F   74
N  93    D   77
F  97    Q   80
N  98    S   81
K  99    G   82
S 100    L   83
G 101    D   84
K 102    Q   85
D 103    T   86
G 104    F   87
A 105    Q   88
P 106    V   89
I 107    E   90
Y 108    K   91
V 109    R   92
A 110    P   93
A 111    H   94
A 112    P   95
N 113    L   96
C 114    N   97
G 115    A   98
R 116    L   99
A 117    T  100
V 118    A  101
P 124    A  113
Q 130    D  116
A 131    F  117
S 132    K  118
Y 133    P  119
G 134    N  120
F 135    T  121
Y 136    R  122
V 137    F  123
T 138    T  124
G 139    E  125
D 140    I  126
Y 141    S  127
W 142    L  128
Y 143    L  129
F 144    P  130
K 145    P  131
G 146    D  132
V 147    K  133
E 148    E  134
A 152    V  146
G 153    D  147
Y 154    Q  148
Q 155    P  149
G 156    R  150
A 157    K  151
Y 158    A  152
V 159    D  153
I 160    V  154
G 161    I  155
S 162    M  156
H 163    L  157
N 164    D  158
T 165    G  159
F 166    K  160
E 167    H  161
N 168    I  162
T 169    I  163
A 170    E  164
F 171    A  165
H 172    V  166
H 173    V  167
N 174    D  168
R 175    L  169
N 176    Q  170
T 177    N  171
G 178    N  172
L 179    K  173
E 180    L  174
I 181    L  175
N 182    S  176
N 183    W  177
G 184    Q  178
G 185    P  179
S 186    I  180
Y 187    K  181
N 188    D  182
T 189    A  183
V 190    H  184
I 191    G  185
N 192    M  186
S 193    V  187
D 194    L  188
Y 199    S  194
K 203    N  197
M 207    A  206
A 208    A  207
D 209    A  208
G 210    V  209
K 214    K  218
Q 215    K  219
K 216    V  220
Q 217    I  221
G 218    T  222
P 219    T  223
G 220    P  224
N 221    L  225
R 222    T  226
F 223    V  227
V 224    G  228
G 225    Y  229
C 226    F  230
R 227    D  231
A 228    G  232
W 229    K  233
E 230    D  234
N 231    G  235
S 232    L  236
D 233    K  237
D 234    Q  238
G 235    D  239
F 239    Q  272
D 240    K  273
S 241    K  274
P 242    I  275
Q 243    V  276
K 244    K  277
V 245    I  278
V 246    E  279
I 247    E  280
E 248    G  281
N 249    P  282
S 250    V  283
W 251    V  284
A 252    P  285
F 253    V  286
R 254    P  287
N 255    M  288
G 256    T  289
I 257    A  290
N 258    R  291
Y 259    P  292
W 260    F  293
N 261    D  294
D 262    G  295
S 263    R  296
A 264    D  297
F 265    R  298
A 266    V  299
G 267    A  300
N 268    P  301
G 269    A  302
N 270    V  303
G 271    K  304
F 272    P  305
K 273    M  306
L 274    Q  307
G 275    I  308
G 276    I  309
N 277    E  310
Q 278    P  311
A 279    E  312
V 280    G  313
G 281    K  314
N 282    N  315
H 283    Y  316
R 284    T  317
V 289    N  410
A 290    E  411
F 291    T  412
G 292    I  413
N 293    A  414
V 294    D  415
S 295    Y  416
K 296    T  417
G 297    G  418
F 298    V  419
D 299    P  420
Q 300    M  421
N 301    E  422
N 302    I  423
N 303    P  424
A 304    R  425
G 305    A  426
G 306    I  427
V 307    A  428
T 308    V  429
V 309    F  430
I 310    E  431
N 311    R  432
N 312    Y  433
T 313    A  434
S 314    G  435
Y 315    P  436
K 316    E  437
N 317    Y  438
G 318    K  439
I 319    H  440
N 320    Q  441
Y 321    E  442
G 322    M  443
F 323    G  444
G 324    Q  445
S 325    P  446
N 326    N  447
V 327    V  448
Q 328    S  449
S 329    T  450
G 330    E  451
Q 331    R  452
K 332    R  453
H 333    E  454
Y 334    L  455
F 335    V  456
R 336    V  457
N 337    R  458
N 338    W  459
V 339    I  460
S 340    S  461
L 341    T  462
S 342    V  463
A 343    G  464
S 344    N  465
V 345    X  466
T 346    D  467
V 347    Y  468
S 348    I  469
N 349    F  470
A 350    D  471
D 351    W  472
A 352    I  473
K 353    F  474
S 354    H  475
N 355    E  476
S 356    N  477
W 357    G  478
D 358    T  479
A 365    P  548
S 366    V  549
D 367    V  550
F 368    K  551
V 369    P  552
S 370    N  553
L 371    T  554
D 372    A  555
T 373    G  556
S 374    G  557
L 375    P  558
A 376    R  559
T 377    T  560
V 378    S  561
S 379    T  562
R 380    M  563
D 381    Q  564
N 382    V  565
D 383    N  566
G 384    Q  567
T 385    Y  568
L 386    N  569
P 387    I  570
E 388    G  571
T 389    N  572
S 390    E  573
L 391    Q  574
F 392    D  575
R 393    A  576
L 394    A  577
S 395    Q  578
A 396    K  579
N 397    F  580
S 398    D  581
K 399    P  582
L 400    G  583
I 401    T  584
N 402    I  585
A 403    R  586
G 404    L  587
T 405    L  588
K 406    S  589
E 407    N  590
S 408    P  591
N 409    N  592
I 410    K  593
S 411    E  594
Y 412    N  595
S 413    R  596
G 414    M  597
S 415    G  598
A 416    N  599
P 417    P  600
D 418    V  601
L 419    S  602
G 420    Y  603
A 421    Q  604
F 422    I  605
E 423    I  606
R 424    P  607
N 425    Y  608
TER
END





