
PFRMAT AL
TARGET T0101
AUTHOR 1956-6867-1656
METHOD COMPASS
METHOD  K.Nishikawa and Y.Matsuo:
METHOD  Protein Eng., Vol.6, pp.811-820 (1993)
METHOD  Y.Matsuo and K.Nishikawa:
METHOD  Protein Sci., Vol.3, pp.2055-2063 (1994)
METHOD  Y.Matsuo and K.Nishikawa:
METHOD  Proteins Struct. Funct. Genet., Vol.23, pp.370-375(1995)
METHOD  The structural library for the threading contains 1692 protein
METHOD  chains, which were selected from PDB at July 11, 2000
METHOD  by using the system for PDB-REPRDB: a database of representative
METHOD  protein chains from the PDB at the PAPIA WWW server
METHOD  (http://www.rwcp.or.jp/papia/).
METHOD  All selected protein chains are of < 30 identity with one another.
MODEL  1
PARENT 1BN8_A
A 26 G 4
D 27 H 5
C 28 Q 6
S 29 T 7
S 30 L 8
D 31 G 9
L 32 S 10
T 33 N 11
S 34 D 12
G 35 G 13
I 36 W 14
S 37 G 15
T 38 A 16
K 39 Y 17
R 40 S 18
I 41 T 19
Y 42 G 20
Y 43 T 21
V 44 T 22
A 45 G 23
P 46 G 24
N 47 S 25
G 48 K 26
N 49 A 27
S 50 S 28
S 51 S 29
N 52 S 30
N 53 N 31
G 54 V 32
S 55 Y 33
S 56 T 34
F 57 V 35
N 58 S 36
A 59 N 37
P 60 R 38
M 61 N 39
S 62 Q 40
F 63 L 41
S 64 V 42
A 65 S 43
A 66 A 44
M 67 L 45
A 68 G 46
A 69 K 47
V 70 N 50
N 71 T 51
P 72 T 52
G 73 P 53
E 74 K 54
L 75 I 55
I 76 I 56
L 77 Y 57
L 78 I 58
K 79 K 59
P 80 G 60
G 81 T 61
T 82 I 62
Y 83 D 63
T 84 M 64
I 85 N 65
P 86 V 66
Y 87 D 67
T 88 D 68
Q 89 N 69
G 90 L 70
K 91 K 71
G 92 P 72
N 93 L 73
T 94 G 74
I 95 L 75
T 96 N 76
F 97 D 77
N 98 Y 78
K 99 K 79
S 100 D 80
G 101 P 81
K 102 E 82
D 103 Y 83
G 104 D 84
A 105 L 85
P 106 D 86
I 107 K 87
Y 108 Y 88
V 109 L 89
A 110 K 90
A 111 A 91
A 112 Y 92
N 113 D 93
C 114 P 94
G 115 T 96
R 116 W 97
A 117 G 98
V 118 K 99
F 119 K 100
D 120 E 101
F 121 P 102
S 122 S 103
F 123 G 104
P 124 T 105
D 125 Q 106
S 126 E 107
Q 127 E 108
W 128 A 109
V 129 R 110
Q 130 A 111
A 131 R 112
S 132 S 113
Y 133 Q 114
G 134 K 115
F 135 N 116
Y 136 Q 117
V 137 K 118
T 138 A 119
G 139 R 120
D 140 V 121
Y 141 M 122
W 142 V 123
Y 143 D 124
F 144 I 125
K 145 P 126
G 146 N 128
V 147 T 129
E 148 T 130
V 149 I 131
T 150 V 132
R 151 G 133
A 152 S 134
G 153 G 135
Y 154 T 136
Q 155 N 137
G 156 A 138
Y 158 K 139
V 159 V 140
I 160 V 141
G 161 G 142
S 162 G 143
H 163 N 144
N 164 F 145
T 165 Q 146
F 166 I 147
E 167 K 148
N 168 S 149
T 169 D 150
A 170 N 151
F 171 V 152
H 172 I 153
H 173 I 154
N 174 R 155
G 178 N 156
L 179 I 157
E 180 E 158
I 181 F 159
N 182 Q 160
N 183 D 161
G 184 A 162
G 185 Y 163
S 186 D 164
Y 187 Y 165
N 188 F 166
T 189 P 167
V 190 Q 168
I 191 W 169
N 192 D 170
S 193 P 171
D 194 T 172
A 195 D 173
Y 196 G 174
R 197 S 175
N 198 S 176
Y 199 G 177
D 200 N 178
P 201 W 179
K 202 N 180
K 203 S 181
N 204 Q 182
G 205 Y 183
S 206 D 184
M 207 N 185
A 208 I 186
D 209 T 187
G 210 I 188
F 211 N 189
G 212 G 190
G 218 G 191
P 219 T 192
G 220 H 193
N 221 I 194
R 222 W 195
F 223 I 196
V 224 D 197
G 225 H 198
C 226 C 199
A 228 T 200
W 229 F 201
E 230 N 202
N 231 D 203
S 232 G 204
D 233 S 205
D 234 R 206
G 235 P 207
F 236 D 208
D 237 S 209
Q 243 T 210
K 244 S 211
V 245 P 212
V 246 K 213
I 247 Y 214
E 248 Y 215
N 249 G 216
S 250 R 217
W 251 K 218
A 252 Y 219
F 253 Q 220
R 254 H 221
I 257 H 222
N 258 D 223
Y 259 G 224
W 260 Q 225
S 263 T 226
A 264 D 227
F 265 A 228
A 266 S 229
G 267 N 230
N 268 G 231
G 269 A 232
N 270 N 233
G 271 Y 234
F 272 I 235
K 273 T 236
L 274 M 237
G 275 S 238
G 276 Y 239
N 277 N 240
A 279 Y 241
V 280 Y 242
G 281 H 243
N 282 D 244
H 283 H 245
R 284 D 246
I 285 K 247
T 286 S 248
V 289 S 249
A 290 I 250
F 291 F 251
G 292 G 252
N 293 S 253
V 294 S 254
S 295 D 255
K 296 S 256
G 297 K 257
D 299 T 258
Q 300 S 259
N 301 D 260
N 302 D 261
N 303 G 262
A 304 K 263
G 305 L 264
G 306 K 265
V 307 I 266
T 308 T 267
V 309 L 268
I 310 H 269
N 312 H 270
T 313 N 271
S 314 R 272
Y 315 Y 273
K 316 K 274
G 318 N 275
I 319 I 276
N 320 V 277
Y 321 Q 278
G 322 R 279
F 323 A 280
G 324 P 281
V 327 R 282
Q 328 V 283
S 329 R 284
G 330 F 285
Q 331 G 286
H 333 Q 287
Y 334 V 288
F 335 H 289
R 336 V 290
N 337 Y 291
N 338 N 292
V 339 N 293
S 340 Y 294
L 341 Y 295
S 342 E 296
A 343 G 297
S 344 S 298
V 345 T 299
T 346 S 300
V 347 S 301
S 348 S 302
N 349 S 303
A 350 Y 304
D 351 P 305
A 352 F 306
K 353 S 307
S 354 Y 308
N 355 A 309
S 356 W 310
W 357 G 311
D 358 G 313
T 359 K 314
G 360 S 315
P 361 S 316
A 362 K 317
A 363 I 318
S 364 Y 319
A 365 A 320
S 366 Q 321
D 367 N 322
F 368 N 323
V 369 I 325
S 370 D 326
L 371 V 327
D 372 P 328
T 373 L 330
S 374 S 331
L 375 A 332
A 376 A 333
T 377 K 334
V 378 T 335
S 379 I 336
R 380 S 337
D 381 V 338
N 382 F 339
D 383 S 340
G 384 G 341
T 385 G 342
L 386 T 343
P 387 A 344
T 389 L 345
S 390 Y 346
L 391 D 347
F 392 S 348
R 393 G 349
L 394 T 350
S 395 L 351
A 396 L 352
N 397 N 353
S 398 G 354
K 399 T 355
L 400 Q 356
I 401 I 357
N 402 N 358
A 403 A 359
G 404 S 360
T 405 A 361
K 406 A 362
E 407 N 363
S 408 G 364
N 409 L 365
I 410 S 366
S 411 S 367
Y 412 S 368
S 413 V 369
G 414 G 370
S 415 W 371
A 416 T 372
P 417 P 373
D 418 S 374
L 419 L 375
G 420 H 376
A 421 G 377
F 422 S 378
E 423 I 379
R 424 D 380
N 425 A 381
TER
END


