
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=4.35 
REMARK CONFIDENCE: GUESS     (50% confidence [ ZSCORE>=3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hsd1dosa
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and structure-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  3
PARENT 1dos_A
S   1     S     1
K   2     K     2
I   3     I     3
V   4     F     4
K   5     D     5
I   6     F     6
I   7     V     7
G   8     K     8
R   9     P     9
E  10     G    10
I  11     V    11
I  12     I    12
D  13     T    13
S  14     G    14
R  15     D    15
G  16     D    16
N  17     V    17
P  18     Q    18
T  19     K    19
V  20     V    20
A  22     F    21
E  23     Q    22
V  24     V    23
H  25     A    24
L  26     K    25
E  27     E    26
G  28     N    27
G  29     N    28
F  30     F    29
A  35     A    30
A  36     L    31
P  37     P    32
S  38     A    33
G  39     V    34
A  40     N    35
S  41     C    36
T  42     V    37
G  43     G    38
G  60     T    39
K  61     D    40
G  62     S    41
V  63     I    42
T  64     N    43
K  65     A    44
A  66     V    45
V  67     L    46
A  68     E    47
A  69     T    48
V  70     A    49
N  71     A    50
G  72     K    51
P  73     V    52
I  74     K    53
A  75     A    54
Q  76     P    55
A  77     V    56
L  78     I    57
I  79     V    58
G  80     Q    59
K  81     F    60
D  82     S    61
A  83     N    62
K  84     G    63
D  85     G    64
Q  86     A    65
A  87     S    66
G  88     F    67
I  89     I    68
D  90     A    69
K  91     G    70
I  92     K    71
M  93     G    72
I  94     V    73
D  95     K    74
L  96     S    75
D  97     D    76
G  98     V    77
T  99     P    78
E 100     Q    79
N 101     G    80
K 102     A    81
S 103     A    82
K 104     I    83
F 105     L    84
G 106     G    85
A 107     A    86
N 108     I    87
A 109     S    88
S 114     G    89
L 115     A    90
A 116     H    91
N 117     H    92
A 118     V    93
K 119     H    94
A 120     Q    95
A 121     M    96
A 122     A    97
A 123     E    98
A 124     H    99
K 125     Y   100
G 126     G   101
M 127     V   102
P 128     P   103
L 129     V   104
Y 130     I   105
E 131     L   106
H 132     H   107
I 133     T   108
A 134     D   109
E 135     H   110
L 136     C   111
N 137     A   112
P 140     K   113
G 141     K   114
K 142     L   115
Y 143     L   116
S 144     P   117
M 145     W   118
P 146     I   119
V 147     D   120
P 148     G   121
M 149     L   122
M 150     L   123
N 151     D   124
I 152     A   125
I 153     G   126
N 154     E   127
G 155     K   128
G 156     H   129
E 157     F   130
H 158     A   131
A 159     A   132
D 160     T   133
N 161     G   134
N 162     K   135
V 163     P   136
D 164     L   137
I 165     F   138
Q 166     S   139
E 167     S   140
F 168     H   141
M 169     M   142
I 170     I   143
P 172     D   144
V 173     L   145
G 174     S   146
A 175     E   147
K 176     E   148
T 177     S   149
V 178     L   150
K 179     Q   151
E 180     E   152
A 181     N   153
I 182     I   154
R 183     E   155
M 184     I   156
G 185     C   157
S 186     S   158
E 187     K   159
V 188     Y   160
F 189     L   161
H 190     E   162
H 191     R   163
L 192     M   164
A 193     S   165
K 194     K   166
V 195     I   167
L 196     M   169
K 197     T   170
A 198     L   171
K 199     E   172
G 200     I   173
M 201     E   174
N 202     L   175
T 203     G   176
A 204     C   177
V 205     T   178
G 206     G   179
D 207     G   180
E 208     E   181
G 209     E   182
G 210     D   183
Y 211     G   184
A 212     V   185
P 213     D   186
N 214     N   187
L 215     S   188
G 216     H   189
S 217     M   190
N 218     D   191
A 219     A   192
E 220     S   193
A 221     A   194
L 222     L   195
A 223     Y   196
V 224     T   197
I 225     Q   198
A 226     P   199
E 227     E   200
A 228     D   201
V 229     V   202
K 230     D   203
A 231     Y   204
A 232     A   205
G 233     Y   206
Y 234     T   207
E 235     E   208
L 236     L   209
G 237     S   210
D 239     K   211
I 240     I   212
T 241     S   213
L 242     P   214
A 243     R   215
M 244     F   216
D 245     T   217
C 246     I   218
A 247     A   219
A 248     A   220
S 249     S   221
E 250     F   222
F 251     G   223
Y 252     N   224
K 253     V   225
D 254     H   226
G 255     G   227
K 256     V   228
Y 257     Y   229
V 258     K   230
E 262     A   231
G 263     G   232
N 264     N   233
K 265     V   234
A 266     V   235
F 267     L   236
T 268     T   237
S 269     P   238
E 270     T   239
E 271     I   240
F 272     L   241
T 273     R   242
H 274     D   243
F 275     S   244
L 276     Q   245
E 277     E   246
E 278     Y   247
L 279     V   248
T 280     S   249
K 281     K   250
Q 282     K   251
Y 283     H   252
P 284     N   253
I 285     L   254
L 307     P   255
G 308     H   256
D 309     N   257
K 310     S   258
I 311     L   259
Q 312     N   260
L 313     F   261
V 314     V   262
G 315     F   263
D 316     H   264
D 317     G   265
L 318     G   266
F 319     S   267
V 320     G   268
T 321     S   269
N 322     T   270
T 323     A   271
K 324     Q   272
I 325     E   273
L 326     I   274
K 327     K   275
E 328     D   276
G 329     S   277
I 330     V   278
E 331     S   279
K 332     Y   280
G 333     G   281
L 339     V   282
I 340     V   283
K 341     K   284
F 342     M   285
N 343     N   286
Q 344     I   287
I 345     D   288
G 346     T   289
S 347     D   290
L 348     T   291
T 349     Q   292
E 350     W   293
T 351     A   294
L 352     T   295
A 353     W   296
A 354     E   297
I 355     G   298
K 356     V   299
M 357     L   300
A 358     N   301
K 359     Y   302
D 360     Y   303
A 361     K   304
G 362     A   305
Y 363     N   306
T 364     E   307
A 365     A   308
V 366     Y   309
I 367     L   310
S 368     Q   311
H 369     G   312
R 370     Q   313
S 371     L   314
G 372     G   315
E 373     N   316
T 374     P   317
E 375     K   318
G 385     G   319
T 386     E   320
A 387     D   321
A 388     Q   322
G 389     P   323
Q 390     N   324
I 391     K   325
K 392     K   326
T 393     Y   327
G 394     Y   328
S 395     D   329
M 396     P   330
S 397     R   331
R 398     V   332
S 399     W   333
D 400     L   334
R 401     R   335
V 402     A   336
A 403     G   337
K 404     Q   338
Y 405     T   339
N 406     S   340
Q 407     M   341
L 408     I   342
I 409     A   343
R 410     R   344
I 411     L   345
E 412     E   346
E 413     K   347
A 414     A   348
L 415     F   349
G 416     Q   350
E 417     E   351
K 418     L   352
A 419     N   353
P 420     A   354
Y 421     I   355
N 422     D   356
G 423     V   357
R 424     L   358
TER
END

