
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=3.45 
REMARK CONFIDENCE: UNCERTAIN (less than 50% confidence [ ZSCORE<3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hsd1fgja
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and structure-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  5
PARENT 1fgj_A
S   1     S     3
K   2     T     4
I   3     V     5
V   4     P     6
K   5     D     7
I   6     E     8
I   7     T     9
G   8     Y    10
R   9     D    11
E  10     A    12
I  11     L    13
I  12     K    14
D  13     L    15
S  14     D    16
R  15     R    17
G  16     G    18
N  17     K    19
P  18     A    20
T  19     T    21
V  20     P    22
E  21     K    23
A  22     E    24
E  23     T    25
V  24     Y    26
H  25     E    27
L  26     A    28
E  27     L    29
G  28     V    30
G  29     K    31
F  30     R    32
V  31     Y    33
G  32     K    34
M  33     D    35
A  34     P    36
A  35     A    37
A  36     H    38
P  37     G    39
S  38     A    40
G  39     G    41
A  40     K    42
S  41     G    43
T  42     T    44
G  43     M    45
S  44     G    46
R  45     D    47
E  46     Y    48
A  47     A    53
L  48     I    54
E  49     S    55
L  50     I    56
R  51     Y    57
D  52     M    58
G  53     D    59
D  54     P    60
K  55     N    61
S  56     T    62
R  57     F    63
F  58     Y    64
L  59     K    65
G  60     P    66
K  61     P    67
G  62     V    68
V  63     S    69
T  64     P    70
K  65     K    71
A  66     E    72
V  67     V    73
A  68     A    74
A  69     E    75
V  70     R    76
N  71     K    77
G  72     D    78
P  73     C    79
I  74     V    80
A  75     E    81
Q  76     C    82
A  77     H    83
L  78     S    84
I  79     D    85
G  80     E    86
K  81     T    87
D  82     P    88
A  83     V    89
K  84     W    90
D  85     V    91
Q  86     R    92
A  87     A    93
G  88     W    94
I  89     K    95
D  90     R    96
K  91     S    97
I  92     T    98
M  93     H    99
I  94     A   100
D  95     N   101
L  96     L   102
D  97     D   103
G  98     K   104
T  99     I   105
E 100     R   106
N 101     N   107
K 102     L   108
S 103     K   109
K 104     S   110
F 105     D   111
G 106     D   112
A 107     P   113
N 108     L   114
A 109     Y   115
I 110     Y   116
L 111     K   117
A 112     K   118
V 113     G   119
S 114     K   120
L 115     L   121
A 116     E   122
N 117     E   123
A 118     V   124
K 119     E   125
A 120     N   126
A 121     N   127
A 122     L   128
A 123     R   129
A 124     S   130
K 125     M   131
G 126     G   132
M 127     K   133
P 128     L   134
L 129     I   146
Y 130     D   147
E 131     C   148
H 132     H   149
I 133     V   150
A 134     D   151
E 135     V   152
L 136     N   153
N 137     K   154
G 138     K   155
T 139     D   156
P 140     K   157
G 141     A   158
K 142     D   159
Y 143     H   160
S 144     T   161
M 145     K   162
P 146     D   163
V 147     I   164
P 148     R   165
M 149     M   166
M 150     P   167
N 151     T   168
I 152     A   169
I 153     D   170
N 154     T   171
G 155     C   172
G 156     G   173
E 157     T   174
H 158     C   175
A 159     H   176
D 160     L   177
N 161     R   178
N 162     E   179
V 163     F   180
D 164     A   181
I 165     E   182
Q 166     R   183
E 167     E   184
F 168     T   189
M 169     M   190
I 170     V   191
Q 171     W   192
P 172     P   193
V 173     N   194
G 174     G   195
A 175     S   203
K 176     H   204
T 177     A   205
V 178     L   206
K 179     D   207
E 180     Y   208
A 181     T   209
I 182     A   210
R 183     N   211
M 184     I   212
G 185     E   213
S 186     T   214
E 187     T   215
V 188     V   216
F 189     W   217
H 190     A   218
H 191     T   219
L 192     M   220
A 193     P   221
K 194     Q   222
V 195     R   223
L 196     E   224
K 197     V   225
A 198     A   226
K 199     E   227
G 200     G   228
M 201     C   229
N 202     T   230
T 203     M   231
A 204     C   232
V 205     H   233
G 206     T   234
D 207     N   235
E 208     Q   236
G 209     N   237
G 210     K   238
Y 211     C   239
A 212     D   240
P 213     N   241
N 214     C   242
L 215     H   243
G 216     T   244
S 217     R   245
N 218     H   246
A 219     E   247
E 220     F   248
A 221     S   249
L 222     A   250
A 223     A   251
V 224     E   252
I 225     S   253
A 226     R   254
E 227     K   255
A 228     P   256
V 229     E   257
K 230     A   258
A 231     C   259
A 232     A   260
G 233     T   261
Y 234     C   262
E 235     H   263
L 236     S   264
G 237     G   265
K 238     V   266
D 239     D   267
I 240     H   268
T 241     N   269
L 242     N   270
A 243     W   271
M 244     E   272
D 245     A   273
C 246     Y   274
A 247     T   275
A 248     M   276
S 249     S   277
E 250     K   278
F 251     H   279
Y 252     G   280
K 253     K   281
D 254     L   282
G 255     A   283
K 256     E   284
Y 257     M   285
V 258     N   286
L 259     R   287
A 260     D   288
G 261     K   289
E 262     W   290
G 263     N   291
N 264     W   292
K 265     E   293
A 266     V   294
F 267     R   295
T 268     L   296
S 269     K   297
E 270     D   298
E 271     A   299
F 272     F   300
T 273     S   301
H 274     E   320
F 275     Y   321
L 276     T   322
E 277     H   323
E 278     N   324
L 279     I   325
T 280     T   326
K 281     R   327
Q 282     K   328
Y 283     Y   334
P 284     P   335
I 285     F   336
V 286     V   337
S 287     N   343
I 288     I   344
E 289     T   345
D 290     S   346
G 291     D   347
L 292     W   348
D 293     S   349
E 294     E   350
S 295     A   351
D 296     R   352
W 297     L   353
D 298     D   354
G 299     S   355
F 300     W   356
A 301     V   357
Y 302     L   358
Q 303     T   359
T 304     C   360
K 305     T   361
V 306     Q   362
L 307     C   363
G 308     H   364
D 309     S   365
I 311     E   366
Q 312     R   367
L 313     F   368
V 314     A   369
G 315     R   370
D 316     S   371
D 317     Y   372
L 318     L   373
F 319     D   374
V 320     L   375
T 321     M   376
N 322     D   377
T 323     K   378
K 324     G   379
I 325     T   380
L 326     L   381
K 327     E   382
E 328     G   383
G 329     L   384
I 330     A   385
E 331     K   386
K 332     Y   387
G 333     Q   388
I 334     E   389
A 335     A   390
N 336     N   391
S 337     A   392
I 338     I   393
L 339     V   394
I 340     H   395
K 341     K   396
F 342     M   397
N 343     Y   398
Q 344     E   399
I 345     D   400
G 346     G   401
S 347     T   402
L 348     L   403
T 349     T   404
E 350     G   405
T 351     Q   406
L 352     I   423
A 353     F   424
A 354     T   425
I 355     Q   426
K 356     L   427
M 357     F   428
A 358     W   429
K 359     S   430
D 360     K   431
A 361     G   432
G 362     N   433
Y 363     N   434
T 364     P   435
A 365     A   436
V 366     S   437
I 367     L   438
S 368     E   439
H 369     L   440
R 370     K   441
S 371     V   442
G 372     L   443
E 373     E   444
T 374     M   445
E 375     G   446
D 376     E   447
A 377     N   448
T 378     N   449
I 379     L   450
A 380     A   451
D 381     K   452
L 382     M   453
A 383     H   454
V 384     V   455
G 385     G   456
T 386     L   457
A 387     A   458
Q 390     H   459
I 391     V   460
K 392     N   461
T 393     P   462
G 394     G   463
S 395     G   464
M 396     W   465
S 397     T   466
R 398     Y   467
S 399     T   468
D 400     E   469
R 401     G   470
V 402     W   471
A 403     G   472
K 404     P   473
Y 405     M   474
N 406     N   475
Q 407     R   476
L 408     Y   478
I 409     V   479
R 410     E   480
I 411     I   481
E 412     Q   482
E 413     D   483
A 414     E   484
L 415     Y   485
G 416     T   486
E 417     K   487
K 418     M   488
A 419     Q   489
P 420     E   490
Y 421     L   491
N 422     S   492
G 423     A   493
R 424     L   494
K 425     Q   495
E 426     A   496
I 427     R   497
K 428     V   498
G 429     N   499
TER
END

