
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 3995-5176-6362
METHOD Chandonia & Cohen, mostly unpublished.
METHOD Uses a combination of PSI-BLAST scoring matrix
METHOD and Pred2ary secondary structure prediction.
METHOD Pred2ary page is http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/pred2ary/
METHOD The potential is documented in the paper by
METHOD Schwartz et al which is referenced on
METHOD my research page: http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/research.html
MODEL 1
PARENT 1one_A
S 1 S 142
K 142 P 143
Y 143 Y 144
S 144 V 145
M 145 L 146
P 146 P 147
V 147 V 148
P 148 P 149
M 149 F 150
M 150 L 151
N 151 N 152
I 152 V 153
I 153 L 154
N 154 N 155
G 155 G 156
G 156 G 157
E 157 S 158
H 158 H 159
A 159 A 160
D 160 G 161
N 161 G 162
N 162 A 163
V 163 L 164
D 164 A 165
I 165 L 166
Q 166 Q 167
E 167 E 168
F 168 F 169
M 169 M 170
I 170 I 171
Q 171 A 172
P 172 P 173
V 173 T 174
G 174 G 175
A 175 A 176
K 176 K 177
T 177 T 178
V 178 F 179
K 179 A 180
E 180 E 181
A 181 A 182
I 182 L 183
R 183 R 184
M 184 I 185
G 185 G 186
S 186 S 187
E 187 E 188
V 188 V 189
F 189 Y 190
H 190 H 191
H 191 N 192
L 192 L 193
A 193 K 194
K 194 S 195
V 195 L 196
L 196 T 197
K 197 K 198
A 198 K 199
K 199 R 200
G 200 Y 201
M 201 G 202
N 202 A 205
T 203 G 206
A 204 N 207
V 205 V 208
G 206 G 209
D 207 D 210
E 208 E 211
G 209 G 212
G 210 G 213
Y 211 V 214
A 212 A 215
P 213 P 216
N 214 N 217
L 215 I 218
G 216 Q 219
S 217 T 220
N 218 A 221
A 219 E 222
E 220 E 223
A 221 A 224
L 222 L 225
A 223 D 226
V 224 L 227
I 225 I 228
A 226 V 229
E 227 D 230
A 228 A 231
V 229 I 232
K 230 K 233
A 231 A 234
A 232 A 235
G 233 G 236
Y 234 H 237
E 235 D 238
G 237 G 239
D 239 K 240
I 240 V 241
T 241 K 242
L 242 I 243
A 243 G 244
M 244 L 245
D 245 D 246
C 246 C 247
A 247 A 248
A 248 S 249
S 249 S 250
E 250 E 251
F 251 F 252
Y 252 F 253
K 253 K 254
D 254 D 255
G 255 G 256
K 256 K 257
Y 257 Y 258
V 258 D 259
L 259 L 260
A 260 D 261
G 261 F 262
E 262 D 268
G 263 K 269
N 264 S 270
K 265 K 271
A 266 W 272
F 267 L 273
T 268 T 274
S 269 G 275
E 270 P 276
E 271 Q 277
F 272 L 278
T 273 A 279
H 274 D 280
F 275 L 281
L 276 Y 282
E 277 H 283
E 278 S 284
L 279 L 285
T 280 M 286
K 281 K 287
Q 282 R 288
Y 283 Y 289
P 284 P 290
I 285 I 291
V 286 V 292
S 287 S 293
I 288 I 294
E 289 E 295
D 290 D 296
G 291 P 297
L 292 F 298
D 293 A 299
E 294 E 300
S 295 D 301
D 296 D 302
W 297 W 303
D 298 E 304
G 299 A 305
F 300 W 306
A 301 S 307
Y 302 H 308
Q 303 F 309
T 304 F 310
K 305 K 311
V 306 T 312
L 307 A 313
G 308 G 314
I 311 I 315
Q 312 Q 316
L 313 I 317
V 314 V 318
G 315 A 319
D 316 D 320
D 317 D 321
L 318 L 322
F 319 T 323
V 320 V 324
T 321 T 325
N 322 N 326
T 323 P 327
K 324 K 328
I 325 R 329
L 326 I 330
K 327 A 331
E 328 T 332
G 329 A 333
I 330 I 334
E 331 E 335
K 332 K 336
G 333 K 337
I 334 A 338
A 335 A 339
N 336 D 340
S 337 A 341
I 338 L 342
L 339 L 343
I 340 L 344
K 341 K 345
F 342 V 346
N 343 N 347
Q 344 Q 348
I 345 I 349
G 346 G 350
S 347 T 351
L 348 L 352
T 349 S 353
E 350 E 354
T 351 S 355
L 352 I 356
A 353 K 357
A 354 A 358
I 355 A 359
K 356 Q 360
M 357 D 361
A 358 S 362
K 359 F 363
D 360 A 364
A 361 A 365
G 362 G 366
Y 363 W 367
T 364 G 368
A 365 V 369
V 366 M 370
I 367 V 371
S 368 S 372
H 369 H 373
R 370 R 374
S 371 S 375
G 372 G 376
E 373 E 377
T 374 T 378
E 375 E 379
D 376 D 380
A 377 T 381
T 378 F 382
I 379 I 383
A 380 A 384
D 381 D 385
L 382 L 386
A 383 V 387
V 384 V 388
G 385 G 389
T 386 L 390
A 387 R 391
A 388 T 392
G 389 G 393
Q 390 Q 394
I 391 I 395
K 392 K 396
T 393 T 397
G 394 G 398
S 395 A 399
M 396 P 400
S 397 A 401
R 398 R 402
S 399 S 403
D 400 E 404
R 401 R 405
V 402 L 406
A 403 A 407
K 404 K 408
Y 405 L 409
N 406 N 410
Q 407 Q 411
L 408 L 412
I 409 L 413
R 410 R 414
I 411 I 415
E 412 E 416
E 413 E 417
A 414 E 418
L 415 L 419
G 416 G 420
E 417 D 421
K 418 N 422
A 419 A 423
P 420 V 424
Y 421 F 425
N 422 A 426
G 423 G 427
R 424 E 428
K 425 N 429
E 426 F 430
I 427 H 431
K 428 H 432
G 429 G 433
Q 430 K 435
A 431 L 436
TER
END

