
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  2
PARENT 1PDY
REMARK DATE	1995-11-15
REMARK SCORE	 0.0	722	219/437 (50%)
I 3 I 2
V 4 T 3
K 5 K 4
I 6 V 5
I 7 F 6
G 8 A 7
R 9 R 8
E 10 T 9
I 11 I 10
I 12 F 11
D 13 D 12
S 14 S 13
R 15 R 14
G 16 G 15
N 17 N 16
P 18 P 17
T 19 T 18
V 20 V 19
E 21 E 20
A 22 V 21
E 23 D 22
V 24 L 23
H 25 Y 24
L 26 T 25
E 27 S 26
G 28 K 27
G 29 G 28
F 30 L 29
V 31 F 30
M 33 R 31
A 34 A 32
A 35 A 33
A 36 V 34
P 37 P 35
S 38 S 36
G 39 G 37
A 40 A 38
S 41 S 39
T 42 T 40
G 43 G 41
S 44 V 42
R 45 H 43
E 46 E 44
A 47 A 45
L 48 L 46
E 49 E 47
L 50 M 48
R 51 R 49
D 52 D 50
G 53 G 51
D 54 D 52
K 55 K 53
S 56 S 54
R 57 K 55
F 58 Y 56
L 59 H 57
G 60 G 58
K 61 K 59
G 62 S 60
V 63 V 61
T 64 F 62
K 65 N 63
A 66 A 64
V 67 V 65
A 68 K 66
A 69 N 67
V 70 V 68
N 71 N 69
G 72 D 70
P 73 V 71
I 74 I 72
A 75 V 73
Q 76 P 74
A 77 E 75
L 78 I 76
I 79 I 77
G 80 G 80
K 81 L 81
D 82 K 82
A 83 V 83
K 84 T 84
D 85 Q 85
Q 86 Q 86
A 87 K 87
G 88 E 88
I 89 C 89
D 90 D 90
K 91 E 91
I 92 F 92
M 93 M 93
I 94 C 94
D 95 K 95
L 96 L 96
D 97 D 97
G 98 G 98
T 99 T 99
E 100 E 100
N 101 N 101
K 102 K 102
S 103 S 103
K 104 S 104
F 105 L 105
G 106 G 106
A 107 A 107
N 108 N 108
A 109 A 109
I 110 I 110
L 111 L 111
A 112 G 112
V 113 V 113
S 114 S 114
L 115 L 115
A 116 A 116
N 117 I 117
A 118 C 118
K 119 K 119
A 120 A 120
A 121 G 121
A 122 A 122
A 123 A 123
A 124 E 124
K 125 L 125
G 126 G 126
M 127 I 127
P 128 P 128
L 129 L 129
Y 130 Y 130
E 131 R 131
H 132 H 132
I 133 I 133
A 134 A 134
E 135 N 135
L 136 L 136
N 137 A 137
T 139 N 138
P 140 Y 139
G 141 D 140
K 142 E 141
Y 143 V 142
S 144 I 143
M 145 L 144
P 146 P 145
V 147 V 146
P 148 P 147
M 149 A 148
M 150 F 149
N 151 N 150
I 152 V 151
I 153 I 152
N 154 N 153
G 155 G 154
G 156 G 155
E 157 S 156
H 158 H 157
A 159 A 158
D 160 G 159
N 161 N 160
N 162 K 161
V 163 L 162
D 164 A 163
I 165 M 164
Q 166 Q 165
E 167 E 166
F 168 F 167
M 169 M 168
I 170 I 169
Q 171 L 170
P 172 P 171
V 173 T 172
G 174 G 173
A 175 A 174
K 176 T 175
T 177 S 176
V 178 F 177
K 179 T 178
E 180 E 179
A 181 A 180
I 182 M 181
R 183 R 182
M 184 M 183
G 185 G 184
S 186 T 185
E 187 E 186
V 188 V 187
F 189 Y 188
H 190 H 189
H 191 H 190
L 192 L 191
A 193 K 192
K 194 A 193
V 195 V 194
L 196 I 195
K 197 K 196
A 198 A 197
K 199 R 198
G 200 F 199
M 201 G 200
N 202 A 203
T 203 T 204
A 204 A 205
V 205 V 206
G 206 G 207
D 207 D 208
E 208 E 209
G 209 G 210
G 210 G 211
Y 211 F 212
A 212 A 213
P 213 P 214
N 214 N 215
L 215 I 216
G 216 L 217
S 217 N 218
N 218 N 219
A 219 K 220
E 220 D 221
A 221 A 222
L 222 L 223
A 223 D 224
V 224 L 225
I 225 I 226
A 226 Q 227
E 227 E 228
A 228 A 229
V 229 I 230
K 230 K 231
A 231 K 232
A 232 A 233
G 233 G 234
Y 234 Y 235
E 235 T 236
K 238 G 237
D 239 K 238
I 240 I 239
T 241 E 240
L 242 I 241
A 243 G 242
M 244 M 243
D 245 D 244
C 246 V 245
A 247 A 246
A 248 A 247
S 249 S 248
E 250 E 249
F 251 F 250
Y 252 Y 251
K 253 K 252
D 254 Q 253
G 255 N 254
K 256 N 255
Y 257 Y 257
V 258 D 258
L 259 L 259
A 260 D 260
G 261 F 261
E 262 D 267
G 263 G 268
N 264 S 269
K 265 Q 270
A 266 K 271
F 267 I 272
T 268 S 273
S 269 G 274
E 270 D 275
E 271 Q 276
F 272 L 277
T 273 R 278
H 274 D 279
F 275 M 280
L 276 Y 281
E 277 M 282
E 278 E 283
L 279 F 284
T 280 C 285
K 281 K 286
Q 282 D 287
Y 283 F 288
P 284 P 289
I 285 I 290
V 286 V 291
S 287 S 292
I 288 I 293
E 289 E 294
D 290 D 295
G 291 P 296
L 292 F 297
D 293 D 298
E 294 Q 299
S 295 D 300
D 296 D 301
W 297 W 302
D 298 E 303
G 299 T 304
F 300 W 305
A 301 S 306
Y 302 K 307
Q 303 M 308
T 304 T 309
K 305 S 310
G 308 G 311
D 309 T 312
K 310 T 313
I 311 I 314
Q 312 Q 315
L 313 I 316
V 314 V 317
G 315 G 318
D 316 D 319
D 317 D 320
L 318 L 321
F 319 T 322
V 320 V 323
T 321 T 324
N 322 N 325
T 323 P 326
K 324 K 327
I 325 R 328
L 326 I 329
K 327 T 330
E 328 T 331
G 329 A 332
I 330 V 333
E 331 E 334
K 332 K 335
G 333 K 336
I 334 A 337
A 335 C 338
N 336 K 339
S 337 C 340
I 338 L 341
L 339 L 342
I 340 L 343
K 341 K 344
F 342 V 345
N 343 N 346
Q 344 Q 347
I 345 I 348
G 346 G 349
S 347 S 350
L 348 V 351
T 349 T 352
E 350 E 353
T 351 S 354
L 352 I 355
A 353 D 356
A 354 A 357
I 355 H 358
K 356 L 359
M 357 L 360
A 358 A 361
K 359 K 362
D 360 K 363
A 361 N 364
G 362 G 365
Y 363 W 366
T 364 G 367
A 365 T 368
V 366 M 369
I 367 V 370
S 368 S 371
H 369 H 372
R 370 R 373
S 371 S 374
G 372 G 375
E 373 E 376
T 374 T 377
E 375 E 378
D 376 D 379
A 377 C 380
T 378 F 381
I 379 I 382
A 380 A 383
D 381 D 384
L 382 L 385
A 383 V 386
V 384 V 387
G 385 G 388
T 386 L 389
A 387 C 390
A 388 T 391
G 389 G 392
Q 390 Q 393
I 391 I 394
K 392 K 395
T 393 T 396
G 394 G 397
S 395 A 398
M 396 P 399
S 397 C 400
R 398 R 401
S 399 S 402
D 400 E 403
R 401 R 404
V 402 L 405
A 403 A 406
K 404 K 407
Y 405 Y 408
N 406 N 409
Q 407 Q 410
L 408 I 411
I 409 L 412
R 410 R 413
I 411 I 414
E 412 E 415
E 413 E 416
A 414 E 417
L 415 L 418
G 416 G 419
E 417 S 420
K 418 G 421
A 419 A 422
P 420 K 423
Y 421 F 424
N 422 A 425
G 423 G 426
R 424 K 427
K 425 N 428
E 426 F 429
I 427 R 430
K 428 A 431
G 429 P 432
TER
END

