
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  2
PARENT 1PDZ
REMARK DATE	1995-11-15
REMARK SCORE	?
K 2 S 1
I 3 I 2
V 4 T 3
K 5 K 4
I 6 V 5
I 7 F 6
G 8 A 7
R 9 R 8
E 10 T 9
I 11 I 10
I 12 F 11
D 13 D 12
S 14 S 13
R 15 R 14
G 16 G 15
N 17 N 16
P 18 P 17
T 19 T 18
V 20 V 19
E 21 E 20
A 22 V 21
E 23 D 22
V 24 L 23
H 25 Y 24
L 26 T 25
E 27 S 26
G 28 K 27
G 29 G 28
F 30 L 29
V 31 F 30
G 32 R 31
M 33 A 32
A 34 A 33
A 35 V 34
A 36 P 35
P 37 S 36
S 38 G 37
G 39 A 38
A 40 S 39
S 41 T 40
T 42 G 41
G 43 V 42
S 44 H 43
R 45 E 44
E 46 A 45
A 47 L 46
L 48 E 47
E 49 M 48
L 50 R 49
R 51 D 50
D 52 G 51
G 53 D 52
D 54 K 53
K 55 S 54
S 56 K 55
R 57 Y 56
F 58 H 57
L 59 G 58
G 60 K 59
K 61 S 60
G 62 V 61
V 63 F 62
T 64 N 63
K 65 A 64
A 66 V 65
V 67 K 66
A 68 N 67
A 69 V 68
V 70 N 69
N 71 D 70
G 72 V 71
P 73 I 72
I 74 V 73
A 75 P 74
Q 76 E 75
A 77 I 76
L 78 I 77
I 79 G 80
G 80 L 81
K 81 K 82
D 82 V 83
A 83 T 84
K 84 Q 85
D 85 Q 86
Q 86 K 87
A 87 E 88
G 88 C 89
I 89 D 90
D 90 E 91
K 91 F 92
I 92 M 93
M 93 C 94
I 94 K 95
D 95 L 96
L 96 D 97
D 97 G 98
G 98 T 99
T 99 E 100
E 100 N 101
N 101 K 102
K 102 S 103
S 103 S 104
K 104 L 105
F 105 G 106
G 106 A 107
A 107 N 108
N 108 A 109
A 109 I 110
I 110 L 111
L 111 G 112
A 112 V 113
V 113 S 114
S 114 L 115
L 115 A 116
A 116 I 117
N 117 C 118
A 118 K 119
K 119 A 120
A 120 G 121
A 121 A 122
A 122 A 123
A 123 E 124
A 124 L 125
K 125 G 126
G 126 I 127
M 127 P 128
P 128 L 129
L 129 Y 130
Y 130 R 131
E 131 H 132
H 132 I 133
I 133 A 134
A 134 N 135
E 135 L 136
L 136 A 137
N 137 N 138
G 138 Y 139
T 139 D 140
P 140 E 141
G 141 V 142
K 142 I 143
Y 143 L 144
S 144 P 145
M 145 V 146
P 146 P 147
V 147 A 148
P 148 F 149
M 149 N 150
M 150 V 151
N 151 I 152
I 152 N 153
I 153 G 154
N 154 G 155
G 155 S 156
G 156 H 157
E 157 A 158
H 158 G 159
A 159 N 160
D 160 K 161
N 161 L 162
N 162 A 163
V 163 M 164
D 164 Q 165
I 165 E 166
Q 166 F 167
E 167 M 168
F 168 I 169
M 169 L 170
I 170 P 171
Q 171 T 172
P 172 G 173
V 173 A 174
G 174 T 175
A 175 S 176
K 176 F 177
T 177 T 178
V 178 E 179
K 179 A 180
E 180 M 181
A 181 R 182
I 182 M 183
R 183 G 184
M 184 T 185
G 185 E 186
S 186 V 187
E 187 Y 188
V 188 H 189
F 189 H 190
H 190 L 191
H 191 K 192
L 192 A 193
A 193 V 194
K 194 I 195
V 195 K 196
L 196 A 197
K 197 R 198
A 198 F 199
K 199 G 200
G 200 A 203
M 201 T 204
N 202 A 205
T 203 V 206
A 204 G 207
V 205 D 208
G 206 E 209
D 207 G 210
E 208 G 211
G 209 F 212
G 210 A 213
Y 211 P 214
A 212 N 215
P 213 I 216
N 214 L 217
L 215 N 218
G 216 N 219
S 217 K 220
N 218 D 221
A 219 A 222
E 220 L 223
A 221 D 224
L 222 L 225
A 223 I 226
V 224 Q 227
I 225 E 228
A 226 A 229
E 227 I 230
A 228 K 231
V 229 K 232
K 230 A 233
A 231 G 234
A 232 Y 235
G 233 T 236
Y 234 G 237
E 235 K 238
L 236 I 239
G 237 E 240
K 238 I 241
D 239 G 242
I 240 M 243
T 241 D 244
L 242 V 245
A 243 A 246
M 244 A 247
D 245 S 248
C 246 E 249
A 247 F 250
A 248 Y 251
S 249 K 252
E 250 Q 253
F 251 N 254
Y 252 N 255
K 253 Y 257
D 254 D 258
G 255 L 259
K 256 D 260
Y 257 F 261
V 258 D 267
L 259 G 268
A 260 S 269
G 261 Q 270
E 262 K 271
G 263 I 272
N 264 S 273
K 265 G 274
A 266 D 275
F 267 Q 276
T 268 L 277
S 269 R 278
E 270 D 279
E 271 M 280
F 272 Y 281
T 273 M 282
H 274 E 283
F 275 F 284
L 276 C 285
E 277 K 286
E 278 D 287
L 279 F 288
T 280 P 289
K 281 I 290
Q 282 V 291
Y 283 S 292
P 284 I 293
I 285 E 294
V 286 D 295
S 287 P 296
I 288 F 297
E 289 D 298
D 290 Q 299
G 291 D 300
L 292 D 301
D 293 W 302
E 294 E 303
S 295 T 304
D 296 W 305
W 297 S 306
D 298 K 307
G 299 M 308
F 300 T 309
A 301 S 310
Y 302 G 311
Q 303 T 312
T 304 T 313
K 305 I 314
V 306 Q 315
L 307 I 316
G 308 V 317
D 309 G 318
K 310 D 319
I 311 D 320
Q 312 L 321
L 313 T 322
V 314 V 323
G 315 T 324
D 316 N 325
D 317 P 326
L 318 K 327
F 319 R 328
V 320 I 329
T 321 T 330
N 322 T 331
T 323 A 332
K 324 V 333
I 325 E 334
L 326 K 335
K 327 K 336
E 328 A 337
G 329 C 338
I 330 K 339
E 331 C 340
K 332 L 341
G 333 L 342
I 334 L 343
A 335 K 344
N 336 V 345
S 337 N 346
I 338 Q 347
L 339 I 348
I 340 G 349
K 341 S 350
F 342 V 351
N 343 T 352
Q 344 E 353
I 345 S 354
G 346 I 355
S 347 D 356
L 348 A 357
T 349 H 358
E 350 L 359
T 351 L 360
L 352 A 361
A 353 K 362
A 354 K 363
I 355 N 364
K 356 G 365
M 357 W 366
A 358 G 367
K 359 T 368
D 360 M 369
A 361 V 370
G 362 S 371
Y 363 H 372
T 364 R 373
A 365 S 374
V 366 G 375
I 367 E 376
S 368 T 377
H 369 E 378
R 370 D 379
S 371 C 380
G 372 F 381
E 373 I 382
T 374 A 383
E 375 D 384
D 376 L 385
A 377 V 386
T 378 V 387
I 379 G 388
A 380 L 389
D 381 C 390
L 382 T 391
A 383 G 392
V 384 Q 393
G 385 I 394
T 386 K 395
A 387 T 396
A 388 G 397
G 389 A 398
Q 390 P 399
I 391 C 400
K 392 R 401
T 393 S 402
G 394 E 403
S 395 R 404
M 396 L 405
S 397 A 406
R 398 K 407
S 399 Y 408
D 400 N 409
R 401 Q 410
V 402 I 411
A 403 L 412
K 404 R 413
Y 405 I 414
N 406 E 415
Q 407 E 416
L 408 E 417
I 409 L 418
R 410 G 419
I 411 S 420
E 412 G 421
E 413 A 422
A 414 K 423
L 415 F 424
G 416 A 425
E 417 G 426
K 418 K 427
A 419 N 428
P 420 F 429
Y 421 R 430
N 422 A 431
G 423 P 432
TER
END

