
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  4
PARENT 2MNR
REMARK DATE	1994-01-31
REMARK SCORE	?
K 2 L 5
I 3 I 6
V 4 T 7
K 5 G 8
I 6 L 9
I 7 R 10
G 8 T 11
R 9 R 12
E 10 A 13
I 11 V 14
I 12 N 15
D 13 V 16
S 14 P 17
R 15 L 18
G 16 A 19
N 17 Y 20
P 18 P 21
T 19 V 22
V 20 H 23
E 21 T 24
A 22 A 25
E 23 V 26
V 24 G 27
H 25 T 28
L 26 V 29
E 27 G 30
G 28 T 31
G 29 A 32
F 30 L 34
V 31 V 35
G 32 L 36
M 33 I 37
A 34 D 38
A 35 L 39
A 36 A 40
P 37 T 41
S 38 S 42
G 39 A 43
A 40 G 44
S 41 V 45
T 42 V 46
G 43 G 47
S 44 H 48
R 45 S 49
E 46 Y 50
A 47 L 51
L 48 F 52
E 49 A 53
L 50 Y 54
R 51 T 55
D 52 P 56
G 53 V 57
D 54 A 58
K 55 L 59
S 56 K 60
R 57 S 61
F 58 L 62
L 59 K 63
G 60 Q 64
K 61 L 65
G 62 L 66
V 63 D 67
T 64 D 68
K 65 M 69
A 66 A 70
V 67 A 71
A 68 M 72
A 69 I 73
V 70 V 74
N 71 N 75
G 72 E 76
P 73 P 77
I 74 L 78
A 75 A 79
Q 76 P 80
A 77 V 81
L 78 S 82
I 79 L 83
G 80 E 84
K 81 A 85
D 82 M 86
A 83 L 87
K 84 A 88
D 85 K 89
Q 86 R 90
A 87 F 91
G 88 C 92
I 89 L 93
D 90 A 94
K 91 G 95
I 92 Y 96
M 93 T 97
I 94 G 98
D 95 L 99
L 96 I 100
D 97 R 101
G 98 M 102
T 99 A 103
E 100 A 104
N 101 A 105
K 102 G 106
S 103 I 107
K 104 D 108
F 105 M 109
G 106 A 110
A 107 A 111
N 108 W 112
A 109 D 113
I 110 A 114
L 111 L 115
A 112 G 116
V 113 K 117
S 114 V 118
L 115 H 119
A 116 E 120
N 117 T 121
A 118 P 122
K 119 L 123
A 120 V 124
A 121 K 125
A 122 L 126
A 123 L 127
A 124 G 128
K 125 A 129
G 126 N 130
M 127 A 131
P 128 R 132
L 129 P 133
Y 130 V 134
E 131 Q 135
H 132 A 136
I 133 Y 137
A 134 D 138
E 135 S 139
L 136 H 140
N 137 S 141
G 138 L 142
T 139 D 143
P 140 G 144
G 141 V 145
K 142 K 146
Y 143 L 147
S 144 A 148
M 145 T 149
P 146 E 150
V 147 R 151
P 148 A 152
M 149 V 153
M 150 T 154
N 151 A 155
I 152 A 156
I 153 E 157
N 154 L 158
G 155 G 159
G 156 F 160
E 157 R 161
H 158 A 162
A 159 V 163
D 160 K 164
N 161 T 165
N 162 K 166
V 163 I 167
D 164 G 168
I 165 Y 169
Q 166 P 170
E 167 A 171
F 168 L 172
M 169 D 173
I 170 Q 174
Q 171 D 175
P 172 L 176
V 173 A 177
G 174 V 178
A 175 V 179
K 176 R 180
T 177 S 181
V 178 I 182
K 179 R 183
E 180 Q 184
A 181 A 185
I 182 V 186
R 183 G 187
M 184 D 188
G 185 D 189
S 186 F 190
E 187 G 191
V 188 I 192
F 189 M 193
H 190 V 194
H 191 D 195
L 192 Y 196
A 193 N 197
K 194 Q 198
V 195 S 199
L 196 L 200
K 197 D 201
A 198 V 202
K 199 P 203
G 200 A 204
M 201 A 205
N 202 I 206
T 203 K 207
A 204 R 208
V 205 S 209
G 206 Q 210
D 207 A 211
E 208 L 212
G 209 Q 213
G 210 Q 214
Y 211 E 215
A 212 G 216
P 213 V 217
N 214 T 218
L 215 W 219
G 216 I 220
S 217 E 221
N 218 E 222
A 219 P 223
E 220 T 224
A 221 L 225
L 222 Q 226
A 223 H 227
V 224 D 228
I 225 Y 229
A 226 E 230
E 227 G 231
A 228 H 232
V 229 Q 233
K 230 R 234
A 231 I 235
A 232 Q 236
G 233 S 237
Y 234 K 238
E 235 L 239
L 236 N 240
G 237 V 241
K 238 P 242
D 239 V 243
I 240 Q 244
T 241 M 245
L 242 G 246
A 243 E 247
M 244 N 248
D 245 W 249
C 246 L 250
A 247 G 251
A 248 P 252
S 249 E 253
E 250 E 254
F 251 M 255
Y 252 F 256
K 253 K 257
D 254 A 258
G 255 L 259
K 256 S 260
Y 257 I 261
V 258 G 262
L 259 A 263
A 260 C 264
G 261 R 265
E 262 L 266
G 263 A 267
N 264 M 268
K 265 P 269
A 266 D 270
F 267 A 271
T 268 M 272
S 269 K 273
E 270 I 274
E 271 G 275
F 272 G 276
T 273 V 277
H 274 T 278
F 275 G 279
L 276 W 280
E 277 I 281
E 278 R 282
L 279 A 283
T 280 S 284
K 281 A 285
Q 282 L 286
Y 283 A 287
P 284 Q 288
I 285 Q 289
V 286 F 290
S 287 G 291
I 288 I 292
E 289 P 293
D 290 M 294
G 291 S 295
L 292 S 296
D 293 H 297
E 294 L 298
S 295 F 299
D 296 Q 300
W 297 E 301
D 298 I 302
G 299 S 303
F 300 A 304
A 301 H 305
Y 302 L 306
Q 303 L 307
T 304 A 308
K 305 A 309
V 306 T 310
L 307 P 311
G 308 T 312
D 309 A 313
K 310 H 314
I 311 L 316
Q 312 E 317
L 313 R 318
V 314 L 319
G 315 D 320
D 316 L 321
D 317 A 322
L 318 G 323
F 319 S 324
V 320 V 325
T 321 I 326
N 322 E 327
T 323 P 328
K 324 T 329
I 325 L 330
L 326 T 331
K 327 F 332
E 328 E 333
G 329 G 334
I 330 I 348
E 331 W 349
K 332 R 350
G 333 E 351
I 334 K 352
A 335 G 355
N 336 K 356
S 337 Y 357
I 338 L 358
TER
END

