
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  5
PARENT 2chr
K 2 K 2
I 3 I 3
V 4 D 4
K 5 A 5
I 6 I 6
I 7 E 7
G 8 A 8
R 9 V 9
E 10 I 10
I 11 V 11
I 12 D 12
D 13 V 13
S 14 P 14
R 15 T 15
G 16 K 16
N 17 R 17
P 18 P 18
T 19 I 19
V 20 Q 20
E 21 M 21
A 22 S 22
E 23 I 23
V 24 T 24
H 25 T 25
L 26 V 26
E 27 H 27
G 28 Q 28
G 29 Q 29
F 30 S 30
V 31 Y 31
G 32 V 32
M 33 I 33
A 34 V 34
A 35 R 35
A 36 V 36
P 37 Y 37
S 38 S 38
G 39 E 39
A 40 G 40
S 41 L 41
T 42 V 42
G 43 G 43
S 44 V 44
R 45 G 45
E 46 E 46
A 47 G 47
L 48 G 48
E 49 S 49
L 50 V 50
D 54 G 51
K 55 G 52
S 56 P 53
R 57 V 54
F 58 W 55
L 59 S 56
G 60 A 57
K 61 E 58
G 62 C 59
V 63 A 60
T 64 E 61
K 65 T 62
A 66 I 63
V 67 K 64
A 68 I 65
A 69 I 66
V 70 V 67
N 71 E 68
G 72 R 69
P 73 Y 70
I 74 L 71
A 75 A 72
Q 76 P 73
A 77 H 74
L 78 L 75
I 79 L 76
G 80 G 77
K 81 T 78
D 82 D 79
A 83 A 80
K 84 F 81
D 85 N 82
Q 86 V 83
A 87 S 84
G 88 G 85
I 89 A 86
D 90 L 87
K 91 Q 88
I 92 T 89
M 93 M 90
I 94 A 91
D 95 R 92
L 96 A 93
D 97 V 94
K 104 T 95
F 105 G 96
G 106 N 97
A 107 A 98
N 108 S 99
A 109 A 100
I 110 K 101
L 111 A 102
A 112 A 103
V 113 V 104
S 114 E 105
L 115 M 106
A 116 A 107
N 117 L 108
A 118 L 109
K 119 D 110
A 120 L 111
A 121 K 112
A 122 A 113
A 123 R 114
A 124 A 115
K 125 L 116
G 126 G 117
M 127 V 118
P 128 S 119
L 129 I 120
Y 130 A 121
E 131 E 122
H 132 L 123
I 133 L 124
A 134 G 125
E 135 G 126
P 140 P 127
G 141 L 128
K 142 R 129
Y 143 S 130
S 144 A 131
M 145 I 132
P 146 P 133
V 147 I 134
G 155 A 135
G 156 W 136
E 157 T 137
H 158 L 138
A 159 A 139
D 160 S 140
N 161 G 141
N 162 D 142
V 163 T 143
D 164 K 144
K 176 R 145
T 177 D 146
V 178 L 147
K 179 D 148
E 180 S 149
A 181 A 150
I 182 V 151
R 183 E 152
M 184 M 153
G 185 I 154
S 186 E 155
E 187 R 156
V 188 R 157
F 189 R 158
H 190 H 159
H 191 N 160
L 192 R 161
A 193 F 162
K 194 K 163
V 195 V 164
D 207 K 165
E 208 L 166
G 209 G 167
G 210 F 168
Y 211 R 169
A 212 S 170
P 213 P 171
A 219 Q 172
E 220 D 173
A 221 D 174
L 222 L 175
A 223 I 176
V 224 H 177
I 225 M 178
A 226 E 179
E 227 A 180
A 228 L 181
V 229 S 182
K 230 N 183
A 231 S 184
A 232 L 185
G 233 G 186
K 238 S 187
D 239 K 188
I 240 A 189
T 241 Y 190
L 242 L 191
A 243 R 192
M 244 V 193
D 245 D 194
C 246 V 195
D 254 N 196
G 255 Q 197
K 256 A 198
Y 257 W 199
V 258 D 200
E 270 E 201
E 271 Q 202
F 272 V 203
T 273 A 204
H 274 S 205
F 275 V 206
L 276 Y 207
E 277 I 208
E 278 P 209
L 279 E 210
T 280 L 211
K 281 E 212
Q 282 A 213
Y 283 L 214
P 284 G 215
I 285 V 216
V 286 E 217
S 287 L 218
I 288 I 219
E 289 E 220
D 290 Q 221
G 291 P 222
L 292 V 223
D 293 G 224
E 294 R 225
S 295 E 226
D 296 N 227
W 297 T 228
D 298 Q 229
G 299 A 230
F 300 L 231
A 301 R 232
Y 302 R 233
Q 303 L 234
T 304 S 235
K 305 D 236
V 306 N 237
L 307 N 238
G 308 R 239
I 311 V 240
Q 312 A 241
L 313 I 242
V 314 M 243
G 315 A 244
D 316 D 245
D 317 E 246
L 318 S 247
F 319 L 248
V 320 S 249
T 321 T 250
T 323 L 251
K 324 A 252
I 325 S 253
L 326 A 254
K 327 F 255
E 328 D 256
G 329 L 257
I 330 A 258
E 331 R 259
K 332 D 260
G 333 R 261
I 334 S 262
A 335 V 263
N 336 D 264
S 337 V 265
I 338 F 266
L 339 S 267
I 340 L 268
K 341 K 269
F 342 L 270
N 343 C 271
Q 344 N 272
I 345 M 273
G 346 G 274
S 347 G 275
L 348 V 276
T 349 S 277
E 350 A 278
T 351 T 279
L 352 Q 280
A 353 K 281
A 354 I 282
I 355 A 283
K 356 A 284
M 357 V 285
A 358 A 286
K 359 E 287
D 360 A 288
A 361 S 289
G 362 G 290
Y 363 I 291
T 364 A 292
A 365 S 293
V 366 Y 294
S 368 G 295
H 369 G 296
R 370 T 297
S 371 M 298
G 372 L 299
E 373 D 300
T 374 S 301
E 375 T 302
D 376 I 303
A 377 G 304
T 378 T 305
I 379 S 306
A 380 V 307
D 381 A 308
L 382 L 309
A 383 Q 310
V 384 L 311
G 385 Y 312
T 386 S 313
A 387 T 314
A 388 V 315
G 389 P 316
Q 390 S 317
I 391 L 318
K 392 P 319
T 393 F 320
G 394 G 321
S 395 C 322
M 396 E 323
S 397 L 324
R 398 I 325
S 399 G 326
D 400 L 330
R 401 A 331
V 402 D 332
A 403 T 333
K 404 L 334
Y 405 S 335
N 406 H 336
Q 407 E 337
L 408 P 338
I 409 L 339
R 410 E 340
I 411 I 341
E 412 R 342
E 413 D 343
G 416 Y 344
E 417 E 345
K 418 L 346
A 419 Q 347
P 420 V 348
Y 421 P 349
N 422 T 350
G 423 G 351
TER
END

