
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  2
PARENT 2one_A
S   1    K    4
K   2    V    5
I   3    Y    6
V   4    A    7
K   5    R    8
R   9    Y   11
D  13    R   14
S  14    G   15
R  15    N   16
G  16    P   17
N  17    T   18
P  18    V   19
T  19    E   20
V  20    V   21
E  21    E   22
A  22    L   23
E  23    T   24
V  24    T   25
H  25    E   26
G  29    V   29
F  30    F   30
V  31    R   31
G  32    S   32
M  33    I   33
A  34    V   34
A  35    P   35
A  36    S   36
P  37    G   37
S  38    A   38
G  39    S   39
A  40    T   40
S  41    G   41
T  42    V   42
G  43    H   43
S  44    E   44
R  45    A   45
E  46    L   46
A  47    E   47
L  48    M   48
E  49    R   49
L  50    D   50
R  51    G   51
D  52    D   52
G  53    K   53
D  54    S   54
K  55    K   55
S  56    W   56
G  60    L   62
T  64    V   65
K  65    K   66
A  66    N   67
V  67    V   68
A  68    N   69
A  69    D   70
V  70    V   71
I  74    P   74
A  75    A   75
Q  76    F   76
A  77    V   77
L  78    K   78
I  79    A   79
G  80    N   80
K  81    I   81
D  82    D   82
A  83    V   83
K  84    K   84
D  85    D   85
Q  86    Q   86
A  87    K   87
G  88    A   88
I  89    V   89
D  90    D   90
K  91    D   91
I  92    F   92
M  93    L   93
I  94    I   94
D  95    S   95
L  96    L   96
D  97    D   97
G  98    G   98
T  99    T   99
E 100    A  100
N 101    N  101
K 102    K  102
S 103    S  103
K 104    K  104
F 105    L  105
G 106    G  106
A 107    A  107
N 108    N  108
A 109    A  109
I 110    I  110
L 111    L  111
A 112    G  112
V 113    V  113
S 114    S  114
L 115    L  115
A 116    A  116
N 117    A  117
A 118    S  118
K 119    R  119
A 120    A  120
A 121    A  121
A 122    A  122
A 123    A  123
A 124    E  124
K 125    K  125
G 126    N  126
M 127    V  127
P 128    P  128
L 129    L  129
Y 130    Y  130
E 131    K  131
E 135    S  137
L 136    K  138
N 137    S  139
G 138    K  140
T 139    T  141
P 140    S  142
G 141    P  143
K 142    Y  144
Y 143    V  145
S 144    L  146
M 145    P  147
P 146    V  148
V 147    P  149
P 148    F  150
M 149    L  151
M 150    N  152
N 151    V  153
I 152    L  154
I 153    N  155
N 154    G  156
G 155    G  157
G 156    S  158
D 160    G  161
N 161    G  162
N 162    A  163
V 163    L  164
D 164    A  165
I 165    L  166
Q 166    Q  167
E 167    E  168
F 168    F  169
M 169    M  170
I 170    I  171
Q 171    A  172
P 172    P  173
V 173    T  174
G 174    G  175
A 175    A  176
K 176    K  177
T 177    T  178
V 178    F  179
K 179    A  180
E 180    E  181
A 181    A  182
I 182    L  183
R 183    R  184
M 184    I  185
G 185    G  186
S 186    S  187
E 187    E  188
V 188    V  189
F 189    Y  190
H 190    H  191
H 191    N  192
L 192    L  193
A 193    K  194
K 194    S  195
V 195    L  196
L 196    T  197
K 197    K  198
A 198    K  199
K 199    R  200
G 200    Y  201
M 201    G  202
N 202    A  203
T 203    S  204
A 204    A  205
V 205    G  206
G 206    N  207
D 207    V  208
E 208    G  209
G 209    D  210
G 210    E  211
Y 211    G  212
A 212    G  213
P 213    V  214
N 214    A  215
L 215    P  216
G 216    N  217
S 217    I  218
N 218    Q  219
A 219    T  220
E 220    A  221
A 221    E  222
L 222    E  223
A 223    A  224
V 224    L  225
I 225    D  226
A 226    L  227
E 227    I  228
A 228    V  229
V 229    D  230
K 230    A  231
A 231    I  232
A 232    K  233
G 233    A  234
Y 234    A  235
E 235    G  236
L 236    H  237
G 237    D  238
K 238    G  239
D 239    K  240
I 240    V  241
T 241    K  242
L 242    I  243
A 243    G  244
M 244    L  245
D 245    D  246
C 246    C  247
A 247    A  248
A 248    S  249
S 249    S  250
E 250    E  251
F 251    F  252
Y 252    F  253
K 253    K  254
D 254    D  255
G 255    G  256
K 256    K  257
G 263    K  269
N 264    S  270
K 265    K  271
A 266    W  272
F 267    L  273
T 268    T  274
S 269    G  275
E 270    P  276
E 271    Q  277
F 272    L  278
T 273    A  279
H 274    D  280
F 275    L  281
L 276    Y  282
E 277    H  283
E 278    S  284
L 279    L  285
T 280    M  286
K 281    K  287
Q 282    R  288
Y 283    Y  289
P 284    P  290
I 285    I  291
V 286    V  292
S 287    S  293
I 288    I  294
E 289    E  295
D 290    D  296
G 291    P  297
L 292    F  298
D 293    A  299
E 294    E  300
S 295    D  301
D 296    D  302
W 297    W  303
D 298    E  304
G 299    A  305
F 300    W  306
A 301    S  307
Y 302    H  308
Q 303    F  309
T 304    F  310
K 305    K  311
K 310    G  314
I 311    I  315
Q 312    Q  316
L 313    I  317
V 314    V  318
G 315    A  319
D 316    D  320
D 317    D  321
L 318    L  322
F 319    T  323
V 320    V  324
T 321    T  325
N 322    N  326
T 323    P  327
K 324    K  328
I 325    R  329
L 326    I  330
K 327    A  331
E 328    T  332
G 329    A  333
I 330    I  334
E 331    E  335
K 332    K  336
G 333    K  337
I 334    A  338
A 335    A  339
N 336    D  340
S 337    A  341
I 338    L  342
L 339    L  343
I 340    L  344
K 341    K  345
F 342    V  346
N 343    N  347
Q 344    Q  348
I 345    I  349
G 346    G  350
S 347    T  351
L 348    L  352
T 349    S  353
E 350    E  354
T 351    S  355
L 352    I  356
A 353    K  357
A 354    A  358
I 355    A  359
K 356    Q  360
M 357    D  361
A 358    S  362
K 359    F  363
D 360    A  364
A 361    A  365
G 362    G  366
Y 363    W  367
T 364    G  368
A 365    V  369
V 366    M  370
I 367    V  371
S 368    S  372
H 369    H  373
R 370    R  374
S 371    S  375
G 372    G  376
E 373    E  377
T 374    T  378
E 375    E  379
D 376    D  380
A 377    T  381
T 378    F  382
I 379    I  383
A 380    A  384
D 381    D  385
L 382    L  386
A 383    V  387
V 384    V  388
G 385    G  389
T 386    L  390
A 387    R  391
A 388    T  392
G 389    G  393
Q 390    Q  394
I 391    I  395
K 392    K  396
T 393    T  397
G 394    G  398
S 395    A  399
M 396    P  400
S 397    A  401
R 398    R  402
S 399    S  403
D 400    E  404
R 401    R  405
V 402    L  406
A 403    A  407
K 404    K  408
Y 405    L  409
N 406    N  410
Q 407    Q  411
L 408    L  412
I 409    L  413
R 410    R  414
I 411    I  415
E 412    E  416
E 413    E  417
A 414    E  418
L 415    L  419
G 416    G  420
E 417    D  421
K 418    N  422
A 419    A  423
P 420    V  424
Y 421    F  425
N 422    A  426
G 423    G  427
R 424    E  428
K 425    N  429
E 426    F  430
I 427    H  431
K 428    H  432
G 429    G  433
Q 430    D  434
A 431    K  435
TER
END


