
PFRMAT AL
TARGET T0111
AUTHOR 1956-6867-1656
METHOD COMPASS
METHOD  K.Nishikawa and Y.Matsuo:
METHOD  Protein Eng., Vol.6, pp.811-820 (1993)
METHOD  Y.Matsuo and K.Nishikawa:
METHOD  Protein Sci., Vol.3, pp.2055-2063 (1994)
METHOD  Y.Matsuo and K.Nishikawa:
METHOD  Proteins Struct. Funct. Genet., Vol.23, pp.370-375(1995)
METHOD  The structural library for the threading contains 1692 protein
METHOD  chains, which were selected from PDB at July 11, 2000
METHOD  by using the system for PDB-REPRDB: a database of representative
METHOD  protein chains from the PDB at the PAPIA WWW server
METHOD  (http://www.rwcp.or.jp/papia/).
METHOD  All selected protein chains are of < 30 identity with one another.
MODEL  1
PARENT 1ONE_A
K   2    A   1 
I   3    V   2 
V   4    S   3 
K   5    K   4 
I   6    V   5 
I   7    Y   6 
G   8    A   7 
R   9    R   8 
E  10    S   9 
I  11    V  10 
I  12    Y  11 
D  13    D  12 
S  14    S  13 
R  15    R  14 
G  16    G  15 
N  17    N  16 
P  18    P  17 
T  19    T  18 
V  20    V  19 
E  21    E  20 
A  22    V  21 
E  23    E  22 
V  24    L  23 
H  25    T  24 
L  26    T  25 
E  27    E  26 
G  28    K  27 
G  29    G  28 
F  30    V  29 
V  31    F  30 
G  32    R  31 
M  33    S  32 
A  34    I  33 
A  36    V  34 
P  37    P  35 
S  38    S  36 
G  39    G  37 
A  40    A  38 
S  41    S  39 
T  42    T  40 
G  43    G  41 
S  44    V  42 
R  45    H  43 
E  46    E  44 
A  47    A  45 
L  48    L  46 
E  49    E  47 
L  50    M  48 
R  51    R  49 
D  52    D  50 
G  53    G  51 
D  54    D  52 
K  55    K  53 
S  56    S  54 
R  57    K  55 
F  58    W  56 
L  59    M  57 
G  60    G  58 
K  61    K  59 
G  62    G  60 
V  63    V  61 
T  64    L  62 
K  65    H  63 
A  66    A  64 
V  67    V  65 
A  68    K  66 
A  69    N  67 
V  70    V  68 
N  71    N  69 
G  72    D  70 
P  73    V  71 
I  74    I  72 
A  75    A  73 
Q  76    P  74 
A  77    A  75 
L  78    F  76 
I  79    A  79 
G  80    N  80 
K  81    I  81 
D  82    D  82 
A  83    V  83 
K  84    K  84 
D  85    D  85 
Q  86    Q  86 
A  87    K  87 
G  88    A  88 
I  89    V  89 
D  90    D  90 
K  91    D  91 
I  92    F  92 
M  93    L  93 
I  94    I  94 
D  95    S  95 
L  96    L  96 
D  97    D  97 
G  98    G  98 
T  99    T  99 
E 100    A 100 
N 101    N 101 
K 102    K 102 
S 103    S 103 
K 104    K 104 
F 105    L 105 
G 106    G 106 
A 107    A 107 
N 108    N 108 
A 109    A 109 
I 110    I 110 
L 111    L 111 
A 112    G 112 
V 113    V 113 
S 114    S 114 
L 115    L 115 
A 116    A 116 
N 117    A 117 
A 118    S 118 
K 119    R 119 
A 120    A 120 
A 121    A 121 
A 122    A 122 
A 123    A 123 
A 124    E 124 
K 125    K 125 
G 126    N 126 
M 127    V 127 
P 128    P 128 
L 129    L 129 
Y 130    Y 130 
E 131    K 131 
H 132    H 132 
I 133    L 133 
A 134    A 134 
E 135    D 135 
L 136    L 136 
N 137    S 137 
G 138    K 138 
T 139    S 139 
P 140    K 140 
G 141    S 142 
K 142    P 143 
Y 143    Y 144 
S 144    V 145 
M 145    L 146 
P 146    P 147 
V 147    V 148 
P 148    P 149 
M 149    F 150 
M 150    L 151 
N 151    N 152 
I 152    V 153 
I 153    L 154 
N 154    N 155 
G 155    G 156 
G 156    G 157 
E 157    S 158 
H 158    H 159 
A 159    A 160 
D 160    G 161 
N 161    G 162 
N 162    A 163 
V 163    L 164 
D 164    A 165 
I 165    L 166 
Q 166    Q 167 
E 167    E 168 
F 168    F 169 
M 169    M 170 
I 170    I 171 
Q 171    A 172 
P 172    P 173 
V 173    T 174 
G 174    G 175 
A 175    A 176 
K 176    K 177 
T 177    T 178 
V 178    F 179 
K 179    A 180 
E 180    E 181 
A 181    A 182 
I 182    L 183 
R 183    R 184 
M 184    I 185 
G 185    G 186 
S 186    S 187 
E 187    E 188 
V 188    V 189 
F 189    Y 190 
H 190    H 191 
H 191    N 192 
L 192    L 193 
A 193    K 194 
K 194    S 195 
V 195    L 196 
L 196    T 197 
K 197    R 200 
A 198    Y 201 
K 199    G 202 
G 200    A 203 
M 201    S 204 
N 202    A 205 
T 203    G 206 
A 204    N 207 
V 205    V 208 
G 206    G 209 
D 207    D 210 
E 208    E 211 
G 209    G 212 
G 210    G 213 
Y 211    V 214 
A 212    A 215 
P 213    P 216 
N 214    N 217 
L 215    I 218 
G 216    Q 219 
S 217    T 220 
N 218    A 221 
A 219    E 222 
E 220    E 223 
A 221    A 224 
L 222    L 225 
A 223    D 226 
V 224    L 227 
I 225    I 228 
A 226    V 229 
E 227    D 230 
A 228    A 231 
V 229    I 232 
K 230    K 233 
A 231    A 234 
A 232    A 235 
G 233    G 236 
Y 234    H 237 
E 235    D 238 
G 237    G 239 
K 238    K 240 
D 239    V 241 
I 240    K 242 
T 241    I 243 
L 242    G 244 
A 243    L 245 
M 244    D 246 
C 246    C 247 
A 247    A 248 
A 248    S 249 
S 249    S 250 
E 250    E 251 
F 251    F 252 
Y 252    F 253 
K 253    K 254 
D 254    D 255 
G 255    G 256 
K 256    K 257 
Y 257    Y 258 
V 258    D 259 
L 259    L 260 
A 260    N 266 
G 261    S 267 
E 262    D 268 
G 263    K 269 
N 264    S 270 
K 265    K 271 
A 266    W 272 
F 267    L 273 
T 268    T 274 
S 269    G 275 
E 270    P 276 
E 271    Q 277 
F 272    L 278 
T 273    A 279 
H 274    D 280 
F 275    L 281 
L 276    Y 282 
E 277    H 283 
E 278    S 284 
L 279    L 285 
T 280    M 286 
K 281    K 287 
Q 282    R 288 
Y 283    Y 289 
P 284    P 290 
I 285    I 291 
V 286    V 292 
S 287    S 293 
I 288    I 294 
E 289    E 295 
G 291    D 296 
L 292    P 297 
D 293    F 298 
E 294    A 299 
S 295    E 300 
D 296    D 301 
W 297    D 302 
D 298    W 303 
G 299    E 304 
F 300    A 305 
A 301    W 306 
Y 302    S 307 
Q 303    H 308 
T 304    F 309 
K 305    F 310 
V 306    K 311 
L 307    T 312 
G 308    A 313 
D 309    G 314 
K 310    I 315 
I 311    Q 316 
Q 312    I 317 
L 313    V 318 
V 314    A 319 
D 316    D 320 
D 317    D 321 
L 318    L 322 
F 319    T 323 
V 320    V 324 
T 321    T 325 
N 322    N 326 
T 323    P 327 
K 324    K 328 
I 325    R 329 
L 326    I 330 
K 327    A 331 
E 328    T 332 
G 329    A 333 
I 330    I 334 
E 331    E 335 
K 332    K 336 
G 333    K 337 
I 334    A 338 
A 335    A 339 
N 336    D 340 
S 337    A 341 
I 338    L 342 
L 339    L 343 
I 340    L 344 
K 341    K 345 
F 342    V 346 
N 343    N 347 
Q 344    Q 348 
I 345    I 349 
G 346    G 350 
S 347    T 351 
L 348    L 352 
T 349    S 353 
E 350    E 354 
T 351    S 355 
L 352    I 356 
A 353    K 357 
A 354    A 358 
I 355    A 359 
K 356    Q 360 
M 357    D 361 
A 358    S 362 
K 359    F 363 
D 360    A 364 
A 361    A 365 
G 362    G 366 
Y 363    W 367 
T 364    G 368 
A 365    V 369 
V 366    M 370 
I 367    V 371 
S 368    S 372 
H 369    H 373 
R 370    R 374 
S 371    S 375 
G 372    G 376 
E 373    E 377 
T 374    T 378 
E 375    E 379 
D 376    D 380 
A 377    T 381 
T 378    F 382 
I 379    I 383 
A 380    A 384 
D 381    D 385 
L 382    L 386 
A 383    V 387 
V 384    V 388 
G 385    G 389 
T 386    L 390 
A 387    R 391 
A 388    T 392 
G 389    G 393 
Q 390    Q 394 
I 391    I 395 
K 392    K 396 
T 393    T 397 
G 394    G 398 
S 395    A 399 
M 396    P 400 
S 397    A 401 
R 398    R 402 
S 399    S 403 
D 400    E 404 
R 401    R 405 
V 402    L 406 
A 403    A 407 
K 404    K 408 
Y 405    L 409 
N 406    N 410 
Q 407    Q 411 
L 408    L 412 
I 409    L 413 
R 410    R 414 
I 411    I 415 
E 412    E 416 
E 413    E 417 
A 414    E 418 
L 415    L 419 
G 416    G 420 
E 417    D 421 
K 418    N 422 
A 419    A 423 
P 420    V 424 
Y 421    F 425 
N 422    A 426 
G 423    G 427 
R 424    E 428 
K 425    N 429 
E 426    F 430 
I 427    H 431 
K 428    H 432 
G 429    G 433 
Q 430    D 434 
A 431    K 435 
TER
END


