
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  2
PARENT 1QOR_B
REMARK DATE	1995-06-03
REMARK SCORE	?
N 5 A 2
L 6 T 3
S 7 R 4
A 8 I 5
V 9 E 6
L 10 F 7
Y 11 H 8
K 12 G 12
Q 13 P 13
N 14 E 14
D 15 V 15
L 16 L 16
R 17 Q 17
L 18 A 18
E 19 V 19
Q 20 E 20
R 21 F 21
P 22 T 22
I 23 P 23
P 24 A 24
E 25 D 25
P 26 P 26
K 27 A 27
E 28 E 28
D 29 N 29
E 30 E 30
V 31 I 31
L 32 Q 32
L 33 V 33
Q 34 E 34
M 35 N 35
A 36 K 36
Y 37 A 37
V 38 I 38
G 39 G 39
I 40 I 40
C 41 N 41
G 42 F 42
S 43 I 43
D 44 D 44
V 45 T 45
H 46 Y 46
Y 47 I 47
Y 48 R 48
E 49 S 49
H 50 G 50
G 51 L 51
R 52 Y 52
I 53 P 53
A 54 P 54
D 55 P 55
F 56 S 56
I 57 L 57
V 58 P 58
K 59 S 59
D 60 G 60
P 61 L 61
M 62 G 62
V 63 T 63
I 64 E 64
G 65 A 65
H 66 A 66
E 67 G 67
A 68 I 68
S 69 V 69
G 70 S 70
T 71 K 71
V 72 V 72
V 73 G 73
K 74 S 74
V 75 G 75
G 76 V 76
K 77 K 77
N 78 H 78
V 79 I 79
K 80 K 80
H 81 A 81
L 82 G 82
K 83 D 83
K 84 R 84
G 85 V 85
D 86 V 86
R 87 Y 87
V 88 A 88
A 89 Q 89
V 90 S 90
E 91 A 91
P 92 L 92
G 93 G 93
V 94 A 94
P 95 Y 95
C 96 S 96
R 97 S 97
R 98 V 98
C 99 H 99
Q 100 N 100
F 101 I 101
C 102 I 102
K 103 A 103
E 104 D 104
G 105 K 105
K 106 A 106
Y 107 A 107
N 108 I 108
L 109 L 109
C 110 P 110
P 111 A 111
D 112 A 112
L 113 I 113
T 114 S 114
F 115 F 115
C 116 E 116
A 117 Q 117
T 118 A 118
P 119 A 119
P 120 A 120
D 121 S 121
D 122 F 122
G 123 L 123
N 124 K 124
L 125 G 125
A 126 T 127
R 127 V 128
Y 128 Y 129
Y 129 Y 130
V 130 L 131
H 131 L 132
A 132 K 134
A 133 T 135
D 134 Y 136
F 135 E 137
C 136 I 138
H 137 K 139
K 138 P 140
L 139 D 141
P 140 E 142
D 141 Q 143
N 142 F 144
V 143 L 145
S 144 F 146
L 145 H 147
E 146 A 148
E 147 A 149
G 148 G 151
A 149 G 152
L 150 V 153
L 151 G 154
E 152 L 155
P 153 I 156
L 154 A 157
S 155 C 158
V 156 Q 159
G 157 W 160
V 158 A 161
H 159 K 162
A 160 A 163
C 161 L 164
R 162 G 165
R 163 A 166
A 164 K 167
G 165 L 168
V 166 I 169
Q 167 G 170
L 168 T 171
G 169 V 172
T 170 G 173
T 171 T 174
V 172 A 175
L 173 Q 176
V 174 K 177
I 175 A 178
G 176 Q 179
A 177 S 180
G 178 A 181
P 179 L 182
I 180 K 183
G 181 A 184
L 182 G 185
V 183 A 186
S 184 W 187
V 185 Q 188
L 186 V 189
A 187 I 190
A 188 N 191
K 189 Y 192
A 190 R 193
Y 191 E 194
G 192 E 195
A 193 D 196
F 194 L 197
V 195 V 198
V 196 E 199
C 197 R 200
T 198 L 201
A 199 K 202
R 200 E 203
S 201 I 204
P 202 T 205
R 203 G 206
R 204 G 207
L 205 K 208
E 206 V 210
V 207 R 211
A 208 V 212
K 209 V 213
N 210 Y 214
C 211 D 215
G 212 S 216
A 213 V 217
D 214 G 218
V 215 R 219
T 216 D 220
L 217 T 221
V 218 W 222
V 219 E 223
D 220 R 224
P 221 S 225
A 222 L 226
K 223 D 227
E 224 C 228
E 225 L 229
E 226 Q 230
S 227 R 231
S 228 R 232
I 229 G 233
I 230 L 234
E 231 M 235
R 232 V 236
I 233 S 237
R 234 F 238
S 235 G 239
A 236 N 240
I 237 S 241
G 238 S 242
D 239 G 243
L 240 A 244
P 241 V 245
N 242 T 246
V 243 G 247
T 244 V 248
I 245 N 249
D 246 L 250
C 247 S 258
S 248 L 259
G 249 Y 260
N 250 V 261
E 251 T 262
K 252 R 263
C 253 P 264
I 254 S 265
T 255 L 266
I 256 Q 267
G 257 G 268
I 258 Y 269
N 259 I 270
I 260 T 271
T 261 L 276
R 262 T 277
T 263 E 278
G 264 A 279
G 265 S 280
T 266 N 281
L 267 E 282
M 268 L 283
L 269 F 284
V 270 S 285
G 271 L 286
M 272 I 287
G 273 A 288
S 274 S 289
Q 275 G 290
M 276 V 291
V 277 I 292
T 278 K 293
V 279 V 294
P 280 D 295
L 281 V 296
V 282 A 297
N 283 E 298
A 284 Q 299
C 285 Q 300
A 286 K 301
R 287 Y 302
E 288 P 303
I 289 L 304
D 290 K 305
I 291 D 306
K 292 A 307
S 293 Q 308
V 294 R 309
F 295 A 310
R 296 H 311
Y 297 E 312
C 298 I 313
N 299 L 314
D 300 E 315
Y 301 S 316
P 302 R 317
I 303 A 318
A 304 T 319
L 305 Q 320
E 306 G 321
M 307 S 322
V 308 S 323
A 309 L 324
S 310 L 325
G 311 I 326
R 312 P 327
TER
END

