
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  3
PARENT 1YKF_D
REMARK DATE	1998-01-14
REMARK SCORE	?
N 5 M 1
L 6 K 2
S 7 G 3
A 8 F 4
V 9 A 5
L 10 M 6
Y 11 L 7
K 12 S 8
Q 13 I 9
N 14 G 10
D 15 K 11
L 16 V 12
R 17 G 13
L 18 W 14
E 19 I 15
Q 20 E 16
R 21 K 17
P 22 E 18
I 23 K 19
P 24 P 20
E 25 A 21
P 26 P 22
K 27 G 23
E 28 P 24
D 29 F 25
E 30 D 26
V 31 A 27
L 32 I 28
L 33 V 29
Q 34 R 30
M 35 P 31
A 36 L 32
Y 37 A 33
V 38 V 34
G 39 A 35
I 40 P 36
C 41 C 37
G 42 T 38
S 43 S 39
D 44 D 40
V 45 I 41
H 46 H 42
Y 47 T 43
Y 48 V 44
E 49 F 45
H 50 E 46
G 51 G 47
R 52 A 48
I 53 I 49
A 54 G 50
D 55 E 51
F 56 R 52
I 57 H 53
V 58 N 54
K 59 M 55
D 60 I 56
P 61 L 57
M 62 G 58
V 63 H 59
I 64 E 60
G 65 A 61
H 66 V 62
E 67 G 63
A 68 E 64
S 69 V 65
G 70 V 66
T 71 E 67
V 72 V 68
V 73 G 69
K 74 S 70
V 75 E 71
G 76 V 72
K 77 K 73
N 78 D 74
V 79 F 75
K 80 K 76
H 81 P 77
L 82 G 78
K 83 D 79
K 84 R 80
G 85 V 81
D 86 V 82
R 87 V 83
V 88 P 84
A 89 A 85
V 90 I 86
E 91 T 87
P 92 P 88
G 93 D 89
V 94 W 90
P 95 R 91
C 96 T 92
R 97 S 93
R 98 E 94
C 99 V 95
Q 100 Q 96
F 101 R 97
C 102 G 98
K 103 Y 99
E 104 H 100
G 105 Q 101
K 106 H 102
Y 107 S 103
N 108 G 104
L 109 G 105
C 110 M 106
P 111 L 107
D 112 A 108
L 113 K 111
T 114 F 112
F 115 S 113
C 116 N 114
A 117 V 115
T 118 K 116
P 119 D 117
P 120 G 118
D 121 V 119
D 122 F 120
G 123 G 121
N 124 E 122
L 125 F 123
A 126 F 124
R 127 H 125
Y 128 V 126
Y 129 N 127
V 130 D 128
H 131 A 129
A 132 D 130
A 133 L 133
D 134 A 134
F 135 H 135
C 136 L 136
H 137 P 137
K 138 K 138
L 139 E 139
P 140 I 140
D 141 P 141
N 142 L 142
V 143 E 143
S 144 A 144
L 145 A 145
E 146 V 146
E 147 M 147
G 148 I 148
A 149 P 149
L 150 D 150
L 151 M 151
E 152 T 153
P 153 T 154
L 154 G 155
S 155 F 156
V 156 H 157
G 157 G 158
V 158 A 159
H 159 E 160
A 160 L 161
C 161 A 162
R 162 D 163
R 163 I 164
A 164 E 165
G 165 L 166
V 166 G 167
Q 167 A 168
L 168 T 169
G 169 V 170
T 170 A 171
T 171 V 172
V 172 L 173
L 173 G 174
V 174 I 175
I 175 G 176
G 176 P 177
A 177 V 178
G 178 G 179
P 179 L 180
I 180 M 181
G 181 A 182
L 182 V 183
V 183 A 184
S 184 G 185
V 185 A 186
L 186 K 187
A 187 L 188
A 188 R 189
K 189 G 190
A 190 A 191
Y 191 R 193
G 192 I 194
A 193 I 195
F 194 A 196
V 195 V 197
V 196 G 198
C 197 S 199
T 198 R 200
A 199 P 201
R 200 V 202
S 201 C 203
P 202 V 204
R 203 D 205
R 204 A 206
L 205 A 207
E 206 K 208
V 207 Y 209
A 208 Y 210
K 209 G 211
N 210 A 212
C 211 T 213
G 212 D 214
A 213 I 215
D 214 V 216
V 215 N 217
T 216 Y 218
L 217 K 219
V 218 D 220
V 219 G 221
D 220 P 222
P 221 I 223
A 222 E 224
K 223 S 225
E 224 Q 226
E 225 I 227
E 226 M 228
S 227 N 229
S 228 L 230
I 229 T 231
I 230 E 232
E 231 G 233
R 232 K 234
I 233 G 235
R 234 V 236
S 235 D 237
A 236 A 238
I 237 A 239
G 238 I 240
D 239 I 241
L 240 A 242
P 241 G 243
N 242 G 244
V 243 N 245
T 244 A 246
I 245 D 247
D 246 I 248
C 247 M 249
S 248 A 250
G 249 T 251
N 250 A 252
E 251 V 253
K 252 K 254
C 253 I 255
I 254 V 256
T 255 K 257
I 256 P 258
G 257 G 259
I 258 G 260
N 259 T 261
I 260 I 262
T 261 A 263
R 262 N 264
T 263 V 265
G 264 N 266
G 265 Y 267
T 266 F 268
L 267 G 269
M 268 E 270
L 269 G 271
V 270 E 272
G 271 V 273
M 272 L 274
G 273 P 275
S 274 V 276
Q 275 P 277
M 276 R 278
V 277 L 279
T 278 G 284
V 279 M 285
P 280 A 286
L 281 H 287
V 282 K 288
N 283 T 289
A 284 I 290
C 285 K 291
A 286 G 292
R 287 G 293
E 288 L 294
I 289 G 297
D 290 G 298
I 291 R 299
K 292 L 300
S 293 R 301
V 294 M 302
F 295 E 303
R 296 R 304
Y 297 L 305
C 298 I 306
N 299 D 307
D 300 L 308
Y 301 V 309
P 302 F 310
I 303 Y 311
A 304 K 312
L 305 R 313
E 306 V 314
M 307 D 315
V 308 P 316
A 309 S 317
S 310 K 318
G 311 L 319
R 312 V 320
C 313 T 321
N 314 H 322
V 315 V 323
K 316 F 324
Q 317 G 326
L 318 F 327
V 319 D 328
T 320 N 329
H 321 I 330
S 322 E 331
F 323 K 332
K 324 A 333
L 325 F 334
E 326 M 335
Q 327 L 336
T 328 M 337
V 329 K 338
D 330 D 339
A 331 K 340
F 332 P 341
E 333 K 342
A 334 D 343
A 335 L 344
R 336 I 345
K 337 K 346
K 338 P 347
A 339 V 348
D 340 V 349
N 341 I 350
TER
END

