
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  4
PARENT 1QLJ_A
REMARK DATE	2000-01-01
REMARK SCORE	?
D 4 K 8
N 5 C 9
L 6 K 10
S 7 A 11
A 8 A 12
V 9 V 13
L 10 L 14
Y 11 W 15
K 12 E 16
Q 13 E 17
N 14 K 18
D 15 P 20
L 16 F 21
R 17 S 22
L 18 I 23
E 19 E 24
Q 20 E 25
R 21 V 26
P 22 E 27
I 23 V 28
P 24 A 29
E 25 P 30
P 26 P 31
K 27 K 32
E 28 A 33
D 29 H 34
E 30 E 35
V 31 V 36
L 32 R 37
L 33 I 38
Q 34 K 39
M 35 M 40
A 36 V 41
Y 37 A 42
V 38 T 43
G 39 G 44
I 40 I 45
C 41 C 46
G 42 R 47
S 43 S 48
D 44 D 49
V 45 D 50
H 46 H 51
Y 47 V 52
Y 48 V 53
E 49 S 54
H 50 G 55
G 51 T 56
R 52 L 57
I 53 V 58
A 54 T 59
D 55 P 60
F 56 L 61
I 57 P 62
V 58 V 63
K 59 I 64
D 60 A 65
P 61 G 66
M 62 H 67
V 63 E 68
I 64 A 69
G 65 A 70
H 66 G 71
E 67 I 72
A 68 V 73
S 69 E 74
G 70 S 75
T 71 I 76
V 72 G 77
V 73 E 78
K 74 G 79
V 75 V 80
G 76 T 81
K 77 T 82
N 78 V 83
V 79 R 84
K 80 P 85
H 81 G 86
L 82 D 87
K 83 K 88
K 84 V 89
G 85 I 90
D 86 P 91
R 87 L 92
V 88 F 93
A 89 T 94
V 90 P 95
E 91 Q 96
P 92 C 97
G 93 G 98
V 94 K 99
P 95 C 100
C 96 R 101
R 97 V 102
R 98 C 103
C 99 K 104
Q 100 H 105
F 101 P 106
C 102 E 107
K 103 G 108
E 104 N 109
G 105 F 110
K 106 C 111
Y 107 L 112
N 108 K 113
L 109 N 114
C 110 D 115
P 111 L 116
D 112 S 117
L 113 M 118
T 114 G 121
F 115 T 122
C 116 M 123
A 117 Q 124
T 118 D 125
P 119 G 126
P 120 T 127
D 121 F 146
D 122 S 147
G 123 Q 148
N 124 Y 149
L 125 T 150
A 126 V 151
R 127 V 152
Y 128 D 153
Y 129 E 154
V 130 I 155
H 131 S 156
A 132 V 157
A 133 A 158
D 134 K 159
F 135 I 160
C 136 D 161
H 137 A 162
K 138 A 163
L 139 S 164
P 140 P 165
D 141 L 166
N 142 E 167
V 143 K 168
S 144 V 169
L 145 C 170
E 146 L 171
E 147 I 172
G 148 G 173
A 149 C 174
L 150 F 176
L 151 S 177
E 152 T 178
P 153 G 179
L 154 Y 180
S 155 G 181
V 156 S 182
G 157 V 184
V 158 K 185
H 159 V 186
A 160 A 187
C 161 K 188
R 162 V 189
R 163 T 190
A 164 Q 191
G 165 G 192
V 166 S 193
Q 167 T 194
L 168 C 195
G 169 A 196
T 170 V 197
T 171 F 198
V 172 G 199
L 173 L 200
V 174 G 201
I 175 G 202
G 176 V 203
A 177 G 204
G 178 L 205
P 179 S 206
I 180 V 207
G 181 I 208
L 182 M 209
V 183 G 210
S 184 C 211
V 185 K 212
L 186 A 213
A 187 A 214
A 188 G 215
K 189 A 216
A 190 R 218
Y 191 I 219
G 192 I 220
A 193 G 221
F 194 V 222
V 195 D 223
V 196 I 224
C 197 N 225
T 198 K 226
A 199 D 227
R 200 K 228
S 201 F 229
P 202 A 230
R 203 K 231
R 204 A 232
L 205 K 233
E 206 E 234
V 207 V 235
A 208 G 236
K 209 A 237
N 210 T 238
C 211 E 239
G 212 C 240
A 213 V 241
D 214 N 242
V 215 P 243
T 216 Q 244
L 217 D 245
V 218 Y 246
V 219 K 247
D 220 K 248
P 221 P 249
A 222 I 250
K 223 Q 251
E 224 E 252
E 225 V 253
E 226 L 254
S 227 T 255
S 228 E 256
I 229 M 257
I 230 S 258
E 231 N 259
R 232 G 260
I 233 G 261
R 234 V 262
S 235 D 263
A 236 F 264
I 237 S 265
G 238 F 266
D 239 E 267
L 240 V 268
P 241 I 269
N 242 G 270
V 243 R 271
T 244 L 272
I 245 D 273
D 246 T 274
C 247 M 275
S 248 V 276
G 249 T 277
N 250 A 278
E 251 L 279
K 252 S 280
C 253 C 281
I 254 C 282
T 255 Q 283
I 256 E 284
G 257 A 285
I 258 G 287
N 259 V 288
I 260 S 289
T 261 V 290
R 262 I 291
T 263 V 292
G 264 A 293
G 265 V 294
T 266 T 295
L 267 P 296
M 268 D 297
L 269 S 298
V 270 Q 299
G 271 N 300
M 272 L 301
G 273 S 302
S 274 L 308
Q 275 L 309
M 276 S 310
V 277 G 311
T 278 R 312
V 279 T 313
P 280 W 314
L 281 K 315
V 282 G 316
N 283 A 317
A 284 I 318
C 285 F 319
A 286 G 320
R 287 G 321
E 288 F 322
I 289 K 323
D 290 S 324
I 291 K 325
K 292 D 326
S 293 S 327
V 294 V 328
F 295 P 329
R 296 K 330
Y 297 L 331
C 298 V 332
N 299 A 333
D 300 D 334
Y 301 F 335
P 302 M 336
I 303 A 337
A 304 K 338
L 305 K 339
E 306 F 340
M 307 A 341
V 308 L 342
A 309 D 343
S 310 P 344
G 311 L 345
R 312 I 346
C 313 T 347
N 314 H 348
V 315 V 349
K 316 L 350
Q 317 P 351
L 318 F 352
V 319 E 353
T 320 K 354
H 321 I 355
S 322 N 356
F 323 E 357
K 324 G 358
L 325 F 359
E 326 D 360
Q 327 L 361
T 328 L 362
V 329 R 363
D 330 S 364
A 331 G 365
F 332 E 366
E 333 S 367
A 334 I 368
A 335 R 369
R 336 T 370
K 337 I 371
K 338 L 372
A 339 T 373
TER
END

