
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  4
PARENT 8adh
M   1    S    1
A   2    T    2
S   3    A    3
D   4    G    4
N   5    K    5
L  10    K   32
Y  11    A   33
K  12    H   34
Q  13    E   35
N  14    V   36
D  15    R   37
L  16    I   38
R  17    K   39
L  18    M   40
E  19    V   41
Q  20    A   42
R  21    T   43
P  22    G   44
I  23    I   45
P  24    C   46
E  25    R   47
D  29    D   50
L  33    T   56
Q  34    L   57
M  35    V   58
A  36    T   59
Y  37    P   60
V  38    L   61
G  39    P   62
I  40    V   63
C  41    I   64
G  42    A   65
S  43    G   66
D  44    H   67
V  45    E   68
H  46    A   69
Y  47    A   70
Y  48    G   71
E  49    I   72
H  50    V   73
G  51    E   74
R  52    S   75
I  53    I   76
A  54    G   77
D  55    E   78
F  56    G   79
I  57    V   80
V  58    T   81
K  59    T   82
D  60    V   83
P  61    R   84
M  62    P   85
V  63    G   86
I  64    D   87
G  65    K   88
H  66    V   89
E  67    I   90
A  68    P   91
S  69    L   92
G  70    F   93
T  71    T   94
V  72    P   95
V  73    Q   96
K  74    C   97
V  75    G   98
G  76    K   99
K  77    C  100
N  78    R  101
K  83    K  104
K  84    H  105
G  85    P  106
D  86    E  107
R  87    G  108
V  88    N  109
A  89    F  110
V  90    C  111
E  91    L  112
P  92    K  113
G  93    N  114
V  94    D  115
P  95    L  116
C  96    S  117
R  97    M  118
R  98    P  119
C  99    R  120
Q 100    G  121
F 101    T  122
C 102    M  123
K 103    Q  124
E 104    D  125
G 105    G  126
K 106    T  127
Y 107    S  128
N 108    R  129
L 109    F  130
C 110    T  131
P 111    C  132
D 112    R  133
L 113    G  134
T 114    K  135
F 115    P  136
C 116    I  137
A 117    H  138
T 118    H  139
P 119    F  140
P 120    L  141
D 121    G  142
D 122    T  143
G 123    S  144
N 124    T  145
L 125    F  146
A 126    S  147
R 127    Q  148
Y 128    Y  149
Y 129    T  150
V 130    V  151
H 131    V  152
A 132    D  153
A 133    E  154
D 134    I  155
F 135    S  156
C 136    V  157
H 137    A  158
K 138    K  159
L 139    I  160
P 140    D  161
D 141    A  162
N 142    A  163
V 143    S  164
S 144    P  165
L 145    L  166
E 146    E  167
E 147    K  168
G 148    V  169
A 149    C  170
L 150    L  171
L 151    I  172
E 152    G  173
P 153    C  174
L 154    G  175
S 155    F  176
V 156    S  177
G 157    T  178
V 158    G  179
H 159    Y  180
A 160    G  181
C 161    S  182
R 162    A  183
R 163    V  184
A 164    K  185
L 168    Q  191
G 169    G  192
T 170    S  193
T 171    T  194
V 172    C  195
L 173    A  196
V 174    V  197
I 175    F  198
G 176    G  199
A 177    L  200
G 178    G  201
P 179    G  202
I 180    V  203
G 181    G  204
L 182    L  205
V 183    S  206
S 184    V  207
V 185    I  208
L 186    M  209
A 187    G  210
A 188    C  211
K 189    K  212
A 190    A  213
Y 191    A  214
G 192    G  215
A 193    A  216
F 194    A  217
V 195    R  218
V 196    I  219
C 197    I  220
T 198    G  221
A 199    V  222
R 200    D  223
S 201    I  224
P 202    N  225
R 203    K  226
R 204    D  227
L 205    K  228
E 206    F  229
V 207    A  230
A 208    K  231
K 209    A  232
N 210    K  233
C 211    E  234
G 212    V  235
A 213    G  236
D 214    A  237
V 215    T  238
T 216    E  239
D 220    N  242
P 221    P  243
A 222    Q  244
K 223    D  245
E 224    Y  246
E 225    K  247
E 226    K  248
I 230    Q  251
E 231    E  252
R 232    V  253
I 233    L  254
R 234    T  255
S 235    E  256
A 236    M  257
I 237    S  258
G 238    N  259
D 239    G  260
L 240    G  261
P 241    V  262
N 242    D  263
V 243    F  264
T 244    S  265
I 245    F  266
D 246    E  267
C 247    V  268
S 248    I  269
G 249    G  270
N 250    R  271
E 251    L  272
K 252    D  273
C 253    T  274
I 254    M  275
T 255    V  276
I 256    T  277
G 257    A  278
I 258    L  279
N 259    S  280
I 260    C  281
T 261    C  282
R 262    Q  283
T 263    E  284
G 264    A  285
G 265    Y  286
T 266    G  287
L 267    V  288
M 268    S  289
L 269    V  290
V 270    I  291
G 271    V  292
M 272    G  293
G 273    V  294
S 274    P  295
Q 275    P  296
M 276    D  297
V 277    S  298
T 278    Q  299
A 284    S  302
C 285    M  303
A 286    N  304
R 287    P  305
E 288    M  306
I 289    L  307
D 290    L  308
I 291    L  309
K 292    S  310
S 293    G  311
V 294    R  312
F 295    T  313
R 296    W  314
Y 297    K  315
C 298    G  316
N 299    A  317
D 300    I  318
Y 301    F  319
P 302    G  320
I 303    G  321
A 304    F  322
L 305    K  323
E 306    S  324
M 307    K  325
V 308    D  326
A 309    S  327
S 310    V  328
G 311    P  329
V 315    V  332
K 316    A  333
Q 317    D  334
L 318    F  335
V 319    M  336
T 320    A  337
H 321    K  338
S 322    K  339
F 323    F  340
K 324    A  341
L 325    L  342
E 326    D  343
Q 327    P  344
T 328    L  345
V 329    I  346
D 330    T  347
K 337    E  353
K 338    K  354
A 339    I  355
D 340    N  356
V 345    F  359
C 349    L  362
R 350    R  363
Q 351    S  364
TER
END


