

PFRMAT AL
TARGET T0115
AUTHOR 9885-9936-6780
METHOD Smith-Waterman alignment of
METHOD secondadry structure annotated sequence
MODEL 1
PARENT 1brw_B
M    1   I 1074
R    2   R 1075
E    3   G 1076
I    4   V 1077
K    6   K 1078
V    7   V 1079
R    8   D 1080
V    9   K 1081
K   10   H 1082
A   11   S 1083
P   12   T 1084
C   13   G 1085
S   15   G 1086
A   16   V 1087
G   19   G 1088
V   20   D 1089
G   21   T 1090
F   22   T 1091
D   23   T 1092
V   24   V 1094
F   25   L 1095
G   26   G 1096
L   27   L 1098
C   28   V 1099
L   29   A 1100
K   30   S 1101
E   31   V 1102
P   32   G 1103
Y   33   V 1104
D   34   P 1105
V   35   V 1106
I   36   A 1107
E   37   K 1108
I   41   M 1109
D   42   S 1110
D   43   G 1111
K   44   R 1112
E   45   G 1113
I   46   L 1114
I   48   H 1116
E   49   T 1117
V   50   G 1118
D   51   G 1119
D   52   D 1122
N   54   S 1126
I   55   V 1127
P   56   P 1128
T   57   V 1132
D   58   E 1133
P   59   I 1134
D   60   S 1135
K   61   K 1136
N   62   D 1137
V   63   E 1138
A   64   F 1139
G   65   I 1140
K   70   R 1141
M   71   L 1142
I   72   V 1143
D   73   N 1144
D   74   E 1145
K   79   N 1146
G   80   G 1147
V   81   I 1148
K   82   A 1149
I   83   I 1150
I   85   I 1151
K   86   G 1152
K   87   Q 1153
G   88   T 1154
G   92   G 1155
S   93   D 1156
L   95   L 1157
G   96   T 1158
S   97   P 1159
A  100   A 1160
S  101   D 1161
S  102   K 1162
T  105   K 1163
A  106   L 1164
Y  107   Y 1165
A  108   A 1166
I  109   L 1167
N  110   R 1168
E  111   D 1169
L  112   V 1170
K  114   T 1171
L  115   A 1172
N  116   T 1173
L  117   V 1174
D  118   N 1175
K  119   S 1176
L  120   I 1177
K  121   P 1178
L  122   L 1179
V  123   I 1180
D  124   A 1181
Y  125   S 1182
A  126   S 1183
S  127   S 1186
Y  128   A 1191
G  129   G 1192
E  130   V 1197
L  131   L 1198
A  132   T 1202
S  133   G 1203
S  134   A 1204
G  135   G 1205
A  136   A 1206
K  137   F 1207
H  138   M 1208
A  139   K 1209
D  140   K 1210
V  142   L 1211
A  143   D 1212
P  144   E 1213
A  145   A 1214
I  146   L 1217
F  147   A 1218
G  149   R 1219
V  153   V 1220
V  161   M 1221
L  162   V 1222
H  163   D 1223
I  164   I 1224
P  165   R 1227
I  166   V 1228
D  167   G 1229
F  168   R 1230
K  169   R 1231
L  170   T 1232
D  171   M 1233
I  172   A 1234
L  173   V 1235
I  174   I 1236
A  175   S 1237
I  176   D 1238
P  177   M 1239
N  178   S 1240
I  179   Q 1241
S  180   P 1242
I  181   L 1243
N  182   N 1249
T  183   A 1250
K  184   L 1251
E  185   E 1252
A  186   V 1253
R  187   K 1254
E  188   E 1255
I  189   A 1256
L  190   I 1257
P  191   E 1258
K  192   K 1261
A  193   G 1262
V  194   N 1263
G  195   G 1264
L  196   P 1265
K  197   H 1266
D  198   D 1267
L  199   L 1268
V  200   T 1269
N  201   E 1270
N  202   L 1271
V  203   L 1273
G  204   T 1274
K  205   L 1275
A  206   G 1276
C  207   S 1277
G  208   H 1278
M  209   M 1279
V  210   V 1280
Y  211   Y 1281
L  213   L 1282
Y  214   A 1283
N  215   E 1284
K  216   K 1285
D  217   A 1286
K  218   P 1287
S  219   S 1288
L  220   L 1289
F  221   D 1290
G  222   A 1292
R  223   R 1293
Y  224   R 1294
M  225   L 1295
M  226   L 1296
S  227   E 1297
D  228   E 1298
K  229   A 1299
V  230   I 1300
I  231   S 1302
E  232   G 1303
P  233   A 1304
V  234   A 1305
R  235   I 1306
G  236   A 1307
K  237   A 1308
L  238   F 1309
I  239   K 1310
N  241   T 1311
Y  242   F 1312
F  243   L 1313
K  244   S 1321
I  245   V 1322
K  246   V 1323
E  247   D 1324
E  248   D 1325
V  249   L 1326
K  250   D 1327
D  251   K 1328
K  252   K 1331
V  253   A 1332
Y  254   Y 1334
G  255   T 1335
I  256   S 1336
T  257   T 1337
I  258   V 1338
S  259   T 1339
G  260   A 1340
S  261   A 1341
G  262   A 1342
S  264   D 1343
I  265   G 1344
I  266   Y 1345
A  267   V 1346
K  270   A 1347
E  271   E 1348
E  272   M 1349
F  273   A 1350
I  274   A 1351
D  275   D 1352
E  276   D 1353
V  277   I 1354
E  278   G 1355
N  279   T 1356
I  280   A 1357
L  281   A 1358
R  282   M 1359
D  283   W 1360
Y  284   L 1361
Y  285   G 1362
E  286   A 1363
N  287   G 1364
R  290   R 1365
V  293   A 1366
G  294   K 1367
K  295   K 1368
G  296   V 1371
V  297   I 1372
E  298   D 1373
V  299   L 1374
V  300   A 1375
TER
END
-------------------------------------------------------------
Ajay K. Royyuru, PhD                   Phone: (914) 945-1335
Manager, Structural Biology            Fax: (914) 945-4104
Computational Biology Center          mailto:ajayr@us.ibm.com
IBM Research                                 --- IBM Internal ---
T. J. Watson Research Center           Phone: T/L 862-1335
P.O. Box 218, Route 134                  Fax: T/L 862-4104
Yorktown Heights, NY 10598            Office: 13-106D


