
PFRMAT AL
TARGET T0115
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  5
PARENT 2pol_A
R   2    L   27
E   3    P   28
I   4    I   29
M   5    L   30
K   6    G   31
V   7    N   32
R   8    L   33
V   9    L   34
K  10    L   35
A  11    Q   36
P  12    V   37
C  13    A   38
T  14    D   39
S  15    G   40
A  16    T   41
N  17    L   42
L  18    S   43
G  19    L   44
V  20    T   45
G  21    G   46
F  22    T   47
D  23    D   48
V  24    L   49
F  25    E   50
G  26    M   51
L  27    E   52
C  28    M   53
L  29    V   54
K  30    A   55
E  31    R   56
P  32    V   57
Y  33    A   58
D  34    L   59
V  35    V   60
I  36    Q   61
E  37    P   62
V  38    H   63
E  39    E   64
A  40    P   65
I  41    G   66
D  42    A   67
D  43    T   68
K  44    T   69
E  45    V   70
I  46    P   71
V  50    K   74
N  54    D   77
D  58    P   83
P  59    E   84
D  60    G   85
K  61    A   86
N  62    E   87
V  63    I   88
A  64    A   89
G  65    V   90
I  66    Q   91
V  67    L   92
A  68    E   93
K  69    G   94
K  70    E   95
D  74    S  107
F  75    L  108
N  76    S  109
I  77    T  110
G  78    L  111
K  79    P  112
G  80    A  113
V  81    A  114
K  82    D  115
I  83    F  116
T  84    P  117
I  85    N  118
K  86    L  119
K  87    D  120
G  88    D  121
V  89    W  122
K  90    Q  123
A  91    S  124
G  92    E  125
S  93    V  126
G  94    E  127
L  95    F  128
G  96    T  129
S  97    L  130
S  98    P  131
A  99    Q  132
A 100    A  133
S 101    T  134
S 102    M  135
A 103    K  136
G 104    R  137
T 105    L  138
A 106    I  139
Y 107    E  140
A 108    A  141
I 109    T  142
N 110    Q  143
E 111    F  144
L 112    S  145
F 113    M  146
K 114    A  147
L 115    H  148
N 116    Q  149
L 117    D  150
D 118    V  151
K 119    R  152
D 124    D  173
Y 125    G  174
A 126    H  175
S 127    R  176
Y 128    L  177
G 129    A  178
E 130    V  179
L 131    C  180
A 132    S  181
S 133    M  182
S 134    P  183
G 135    I  184
A 136    G  185
K 137    Q  186
H 138    S  187
A 139    L  188
D 140    P  189
N 141    S  190
V 142    H  191
A 143    S  192
P 144    V  193
A 145    I  194
I 146    V  195
F 147    P  196
G 148    R  197
M 152    L  203
V 153    M  204
T 154    R  205
N 155    M  206
Y 156    L  207
E 157    D  208
P 158    G  209
L 159    G  210
E 160    D  211
V 161    N  212
L 162    P  213
H 163    L  214
I 164    R  215
P 165    V  216
I 166    Q  217
D 167    I  218
F 168    G  219
K 169    S  220
L 170    N  221
D 171    N  222
I 172    I  223
L 173    R  224
I 174    A  225
A 175    H  226
I 176    V  227
P 177    G  228
N 178    D  229
I 179    F  230
S 180    I  231
I 181    F  232
N 182    T  233
T 183    S  234
K 184    K  235
E 185    L  236
A 186    V  237
R 187    D  238
E 188    G  239
I 189    R  240
L 190    F  241
P 191    P  242
K 192    D  243
A 193    Y  244
V 194    R  245
D 198    L  248
L 199    P  249
V 200    K  250
N 201    N  251
N 202    P  252
V 203    D  253
G 204    K  254
K 205    H  255
A 206    L  256
C 207    E  257
G 208    A  258
M 209    G  259
V 210    C  260
Y 211    D  261
A 212    L  262
L 213    L  263
Y 214    K  264
N 215    Q  265
K 216    A  266
D 217    F  267
K 218    A  268
S 219    R  269
L 220    A  270
F 221    A  271
G 222    I  272
R 223    L  273
Y 224    S  274
M 225    N  275
M 226    E  276
S 227    K  277
D 228    F  278
K 229    R  279
V 230    G  280
I 231    V  281
E 232    R  282
P 233    L  283
V 234    Y  284
R 235    V  285
G 236    S  286
K 237    E  287
L 238    N  288
I 239    Q  289
P 240    L  290
N 241    K  291
Y 242    I  292
F 243    T  293
K 244    A  294
I 245    N  295
K 246    N  296
E 247    P  297
E 248    E  298
V 249    Q  299
K 250    E  300
D 251    E  301
K 252    A  302
V 253    E  303
Y 254    E  304
G 255    I  305
I 256    L  306
T 257    D  307
I 258    V  308
S 259    T  309
G 260    Y  310
S 261    S  311
G 262    G  312
P 263    A  313
S 264    E  314
I 265    M  315
I 266    E  316
A 267    I  317
F 268    G  318
P 269    F  319
K 270    N  320
E 271    V  321
E 272    S  322
F 273    Y  323
I 274    V  324
D 275    L  325
E 276    D  326
V 277    V  327
E 278    L  328
N 279    N  329
I 280    A  330
L 281    L  331
R 282    K  332
D 283    C  333
Y 284    E  334
Y 285    N  335
E 286    V  336
N 287    R  337
T 288    M  338
I 289    M  339
R 290    L  340
T 291    T  341
E 292    D  342
V 293    S  343
G 294    V  344
K 295    S  345
G 296    S  346
V 297    V  347
E 298    Q  348
V 299    I  349
V 300    E  350
TER
END


