
PFRMAT AL
TARGET T0116
AUTHOR 5619-7722-4694
REMARK Predictor remarks
METHOD Automated CAFASP2 submission
METHOD see http://cafasp.bioinfo.pl/server/3dpssm.html
METHOD and Kelley LA, MacCallum RM & Sternberg MJE (2000).
METHOD     Enhanced Genome Annotation using Structural Profiles
METHOD     in the Program 3D-PSSM. J. Mol. Biol. 299(2), 501-522.
METHOD
METHOD Major differences from the publication:
METHOD
METHOD Fold library based on SCOP 1.50 - no more than 70% pairwise
METHOD identity (astral-scopdom-seqres-sel-gs-bib-70-1.50).
METHOD
METHOD Fold library continuously updated from PDB, using 70%
METHOD identity cut-off and overlap criteria.
METHOD
METHOD The 3D-PSSM E-value is multiplied by the SAWTED E-value
METHOD if the latter is less than 0.2 and folds with SAWTED E-values
METHOD less than 0.2 do not belong to different superfamilies.
METHOD
MODEL 5
PARENT 1qsl_A
V  150 M 324
S  151 I 325
T  152 S 326
G  153 Y 327
E  154 D 328
F  155 N 329
K  156 Y 330
G  157 V 331
T  158 T 332
L  160 I 333
K  161 L 334
S  162 D 335
K  163 E 336
S  164 E 337
A  165 T 338
L  166 L 339
Y  167 I 343
D  168 A 344
E  169 K 345
L  170 L 346
F  171 E 347
R  172 K 348
H  173 A 349
R  174 P 350
P  175 V 351
A  176 T 356
E  177 E 357
V  178 T 358
L  179 D 359
L  180 S 360
A  181 L 361
P  182 D 362
E  183 N 363
L  184 I 364
L  185 S 365
E  186 A 366
N  187 N 367
G  188 L 368
A  189 V 369
F  190 G 370
L  191 L 371
D  192 S 372
E  193 F 373
F  194 A 374
R  195 I 375
K  196 E 376
R  197 P 377
F  198 V 379
P  199 A 380
V  200 A 381
M  201 Y 382
L  202 I 383
S  203 P 384
E  204 V 385
A  205 A 386
P  206 H 387
F  207 D 388
E  208 Y 389
P  209 L 390
E  210 D 391
G  211 A 392
E  212 P 393
G  213 D 394
P  214 Q 395
L  215 I 396
A  216 S 397
L  217 R 398
R  218 E 399
R  219 R 400
A  220 A 401
R  221 L 402
A  223 E 403
L  224 L 404
L  225 L 405
A  226 K 406
Y  227 P 407
A  228 L 408
T  231 L 409
Q  232 E 410
G  233 D 411
G  234 E 412
A  235 K 413
P  240 A 414
F  241 L 415
R  242 K 416
F  243 V 417
G  247 G 418
A  248 Q 419
F  249 N 420
M  250 L 421
R  251 K 422
L  252 Y 423
P  253 D 424
E  254 R 425
A  255 G 426
T  256 I 427
L  257 L 428
R  258 A 429
A  259 N 430
L  260 I 433
E  261 E 434
V  262 L 435
F  263 R 436
E  264 G 437
P  265 I 438
L  266 A 439
R  267 F 440
G  268 D 441
Q  269 T 442
D  270 M 443
T  271 L 444
L  272 E 445
F  273 S 446
S  274 Y 447
V  275 I 448
L  276 L 449
D  277 N 450
E  278 S 451
T  279 V 452
R  280 A 453
T  281 G 454
A  282 D 457
P  283 M 458
G  284 D 459
R  285 S 460
L  287 L 461
L  288 A 462
Q  289 E 463
S  290 R 464
W  291 W 465
L  292 L 466
R  293 K 467
H  294 H 468
P  295 K 469
L  296 T 470
L  297 I 471
D  298 T 472
R  299 F 473
G  300 E 474
P  301 E 475
L  302 I 476
E  303 N 487
A  304 Q 488
R  305 A 490
L  306 L 491
D  307 E 492
R  308 E 493
V  309 A 494
E  310 G 495
G  311 R 496
F  312 Y 497
V  313 A 498
R  314 A 499
G  316 E 500
A  317 D 501
L  318 A 502
R  319 D 503
E  320 V 504
G  321 T 505
V  322 L 506
R  323 Q 507
R  324 L 508
L  325 H 509
L  326 L 510
Y  327 K 511
R  328 M 512
L  329 W 513
A  330 P 514
D  331 D 515
L  332 L 516
E  333 V 534
R  334 P 535
L  335 V 536
A  336 L 537
T  337 S 538
R  338 R 539
L  339 I 540
E  340 E 541
L  341 R 542
G  342 V 545
R  343 K 546
A  344 I 547
S  345 D 548
P  346 P 549
K  347 K 550
D  348 V 551
L  349 L 552
G  350 H 553
A  351 N 554
L  352 H 555
R  353 S 556
R  354 E 557
S  355 E 558
L  356 L 559
Q  357 L 561
I  358 R 562
L  359 L 563
P  360 A 564
E  361 E 565
L  362 L 566
R  363 E 567
A  364 K 568
L  365 K 569
L  366 A 570
G  367 H 571
E  368 E 572
E  369 I 573
V  370 A 574
G  371 E 576
L  372 E 577
P  373 F 578
D  374 N 579
L  375 L 580
S  376 S 581
P  377 S 582
K  379 T 583
E  380 K 584
E  381 Q 585
L  382 L 586
E  383 Q 587
A  384 T 588
A  385 I 589
L  386 L 590
V  387 F 591
E  388 E 592
D  389 K 593
L  392 Q 594
K  393 G 595
V  394 I 596
S  395 K 597
E  396 P 598
G  397 L 599
G  398 K 600
L  399 K 601
I  400 T 602
R  401 P 607
E  402 S 608
G  403 T 609
Y  404 S 610
D  405 E 611
P  406 E 612
D  407 V 613
L  408 L 614
D  409 E 615
A  410 E 616
L  411 L 617
A  414 A 618
H  415 L 619
R  416 D 620
E  417 P 622
G  418 L 623
V  419 P 624
A  420 K 625
Y  421 V 626
F  422 I 627
L  423 L 628
E  424 E 629
L  425 Y 630
E  426 R 631
E  427 L 633
R  428 A 634
E  429 K 635
R  430 L 636
E  431 K 637
R  432 S 638
T  433 T 639
G  434 Y 640
I  435 T 641
P  436 D 642
T  437 K 643
L  438 L 644
L  450 P 645
E  451 L 646
V  452 M 647
T  453 I 648
R  454 N 649
P  455 P 650
Y  456 K 651
Y  457 T 652
E  458 G 653
R  459 R 654
V  460 V 655
P  461 H 656
K  462 T 657
E  463 S 658
Y  464 Y 659
R  465 H 660
P  466 Q 661
V  467 A 662
Q  468 V 663
T  469 T 664
L  470 A 665
K  471 T 666
D  472 G 667
R  473 R 668
Q  474 L 669
R  475 S 670
Y  476 S 671
T  477 T 672
L  478 D 673
P  479 P 674
E  480 N 675
M  481 L 676
K  482 Q 677
E  483 E 684
K  484 E 685
E  485 G 686
R  486 R 687
E  487 R 688
V  488 I 689
Y  489 R 690
R  490 Q 691
L  491 A 692
E  492 S 703
A  493 A 704
L  494 D 705
I  495 Y 706
R  496 S 707
R  497 Q 708
R  498 I 709
E  499 E 710
E  500 L 711
E  501 R 712
V  502 I 713
F  503 M 714
L  504 K 721
E  505 G 722
V  506 L 723
R  507 L 724
E  508 T 725
R  509 A 726
A  510 F 727
K  511 A 728
R  512 E 729
Q  513 V 749
A  514 T 750
E  515 S 751
A  516 E 752
L  517 Q 753
R  518 R 754
E  519 R 755
A  520 S 756
A  521 A 757
R  522 K 758
I  523 A 759
L  524 I 760
A  525 N 761
E  526 F 762
L  527 I 765
D  528 Y 766
V  529 G 767
Y  530 M 768
A  531 S 769
A  532 A 770
L  533 F 771
A  534 G 772
V  536 L 773
A  537 A 774
V  538 R 775
R  539 Q 776
Y  540 L 777
G  541 N 778
Y  542 I 779
V  543 P 780
R  544 R 781
P  545 K 782
R  546 E 783
F  547 A 784
G  548 Q 785
D  549 K 786
R  550 Y 787
L  551 M 788
Q  552 D 789
I  553 L 790
R  554 Y 791
A  555 F 792
G  556 E 793
R  557 R 794
H  558 Y 795
P  559 P 796
V  560 T 817
V  561 L 818
E  562 D 819
R  563 G 820
R  564 R 821
T  565 R 822
E  566 L 823
F  567 Y 824
V  568 L 825
P  569 P 826
D  571 D 827
L  572 I 828
E  573 K 829
M  574 S 830
A  575 S 831
H  576 N 832
E  577 E 840
L  578 R 841
V  579 A 842
L  580 A 843
I  581 I 844
T  582 N 845
G  583 A 846
P  584 P 847
M  586 M 848
A  587 Q 849
G  588 G 850
K  589 T 851
S  590 A 852
T  591 A 853
F  592 D 854
L  593 I 855
R  594 I 856
Q  595 K 857
T  596 R 858
A  597 A 859
L  598 M 860
I  599 I 861
A  600 A 862
L  601 V 863
L  602 D 864
A  603 A 865
Q  604 W 866
V  605 L 867
G  606 Q 868
S  607 A 869
F  608 E 870
V  609 Q 871
P  610 P 872
A  611 R 873
E  612 V 874
E  613 R 875
A  614 M 876
H  615 I 877
L  616 M 878
P  617 Q 879
L  618 V 880
F  619 H 881
D  620 D 882
G  621 E 883
I  622 L 884
Y  623 V 885
T  624 F 886
R  625 E 887
I  626 V 888
G  627 H 889
A  628 K 890
D  630 D 891
D  631 D 892
L  632 V 893
A  633 D 894
G  634 A 895
E  642 V 896
M  643 A 897
E  644 K 898
E  645 Q 899
V  646 I 900
A  647 H 901
L  648 Q 902
I  649 L 903
L  650 M 904
K  651 E 905
E  652 N 906
A  653 C 907
T  654 T 908
E  655 R 909
N  656 L 910
S  657 D 911
L  658 V 912
V  659 P 913
L  660 L 914
L  661 L 915
D  662 V 916
E  663 E 917
V  664 V 918
G  665 G 919
R  666 S 920
G  667 G 921
T  668 E 922
S  669 N 923
S  670 W 924
L  671 D 925
D  672 Q 926
G  673 A 927
V  674 H 928
TER
END

