
PFRMAT AL
TARGET T0116
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  5
PARENT 1D9X_A
REMARK DATE	2000-05-03
REMARK SCORE	 0.17	32.3	41/246 (16%)
L 292 L 417
R 293 L 418
H 294 D 419
P 295 P 420
L 296 T 421
L 297 I 422
D 298 D 423
R 299 V 424
G 300 R 425
P 301 P 426
L 302 T 427
E 303 K 428
A 304 G 429
R 305 Q 430
L 306 I 431
D 307 D 432
R 308 D 433
V 309 L 434
E 310 I 435
G 311 G 436
F 312 E 437
V 313 I 438
R 314 R 439
E 315 E 440
G 316 R 441
A 317 V 442
L 318 E 443
R 319 R 444
E 320 N 445
G 321 E 446
V 322 V 450
R 323 T 451
R 324 T 452
L 325 L 453
L 326 T 454
Y 327 K 455
R 328 K 456
L 329 M 457
A 330 E 459
D 331 D 460
L 332 L 461
E 333 T 462
R 334 D 463
L 335 Y 464
A 336 L 465
T 337 K 466
R 338 E 467
L 339 A 468
E 340 G 469
L 341 I 470
G 342 K 471
R 343 V 472
A 344 A 473
S 345 Y 474
P 346 L 475
K 347 H 476
D 348 S 477
L 349 E 478
G 350 I 479
A 351 K 480
L 352 T 481
R 353 L 482
R 354 E 483
S 355 R 484
L 356 I 485
Q 357 E 486
I 358 I 487
L 359 I 488
P 360 R 489
E 361 D 490
L 362 L 491
R 363 R 492
A 364 N 503
L 365 L 504
L 366 L 505
G 367 R 506
E 368 E 507
E 369 G 508
V 370 L 509
G 371 D 510
L 372 I 511
P 373 P 512
D 374 E 513
L 375 L 516
S 376 V 517
P 377 A 518
L 378 I 519
K 379 L 520
E 380 D 521
E 381 A 522
L 382 D 523
E 383 K 524
A 384 E 525
A 385 G 526
L 386 F 527
V 387 L 528
E 388 R 529
D 389 S 530
P 390 E 531
P 391 R 532
L 392 S 533
K 393 L 534
V 394 I 535
S 395 Q 536
E 396 T 537
G 397 I 538
G 398 G 539
L 399 R 540
I 400 A 541
R 401 A 542
E 402 R 543
G 403 N 544
Y 404 A 545
D 405 N 546
P 406 G 547
D 407 H 548
L 411 V 549
R 412 I 550
A 413 M 551
A 414 Y 552
H 415 A 553
R 416 D 554
E 417 T 555
G 418 I 556
V 419 T 557
A 420 K 558
Y 421 S 559
F 422 M 560
L 423 E 561
E 424 I 562
L 425 A 563
E 426 I 564
E 427 Q 565
R 428 E 566
E 429 T 567
R 430 K 568
E 431 R 569
R 432 R 570
T 433 R 571
G 434 A 572
I 435 I 573
K 439 Q 574
V 440 E 575
G 441 E 576
Y 442 Y 577
N 443 N 578
A 444 R 579
V 445 K 580
F 446 H 581
G 447 G 582
Y 448 I 583
Y 449 V 584
L 450 P 585
E 451 R 586
V 452 T 587
T 453 V 588
R 454 K 589
P 455 K 590
Y 456 E 591
Y 457 I 592
E 458 R 593
R 459 D 594
V 460 V 595
TER
END

