
PFRMAT AL
TARGET T0116
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1DG3_A
REMARK DATE	2000-02-11
REMARK SCORE	?
K 156 F 178
G 157 V 179
T 158 W 180
V 159 T 181
L 160 L 182
K 161 R 183
S 162 D 184
K 163 F 185
S 164 S 186
A 165 L 187
L 166 D 188
Y 167 L 189
R 172 Q 194
H 173 P 195
R 174 L 196
P 175 T 197
A 176 P 198
E 177 D 199
V 178 E 200
L 179 Y 201
L 180 L 202
A 181 T 203
P 182 Y 204
E 183 S 205
L 184 L 206
L 185 K 207
E 186 L 208
N 187 K 209
G 188 K 210
A 189 G 211
F 190 T 212
L 191 S 213
D 192 Q 214
E 193 K 215
F 194 D 216
R 195 E 217
K 196 T 218
R 197 F 219
F 198 N 220
P 199 L 221
V 200 P 222
M 201 R 223
L 202 L 224
S 203 C 225
E 204 I 226
A 205 R 227
P 206 K 228
F 207 F 229
E 208 F 230
P 209 P 231
E 210 K 232
G 211 K 233
E 212 K 234
G 213 C 235
P 214 F 236
L 215 V 237
A 216 F 238
L 217 D 239
R 218 R 240
R 219 P 241
A 220 V 242
R 221 H 243
A 235 E 257
L 236 L 258
S 237 D 259
L 238 P 260
Q 239 E 261
P 240 F 262
F 241 V 263
R 242 Q 264
F 243 Q 265
Y 244 V 266
D 245 A 267
P 246 D 268
G 247 F 269
A 248 C 270
F 249 S 271
M 250 Y 272
R 251 I 273
L 252 F 274
P 253 S 275
E 254 N 276
A 255 S 277
T 256 K 278
L 257 T 279
R 258 K 280
A 259 T 281
L 260 L 282
E 261 G 285
V 262 I 286
F 263 Q 287
E 264 V 288
P 265 N 289
L 266 G 290
R 267 P 291
G 268 R 292
Q 269 L 293
D 270 E 294
T 271 S 295
L 272 L 296
F 273 V 297
S 274 L 298
V 275 T 299
L 276 Y 300
D 277 V 301
E 278 N 302
T 279 A 303
R 280 I 304
T 281 S 305
A 282 S 306
P 283 G 307
G 284 D 308
R 285 L 309
R 286 P 310
L 287 C 311
L 288 M 312
Q 289 E 313
S 290 N 314
W 291 A 315
L 292 V 316
R 293 L 317
H 294 A 318
P 295 L 319
L 296 A 320
L 297 Q 321
D 298 I 322
R 299 E 323
G 300 N 324
P 301 S 325
L 302 A 326
E 303 A 327
A 304 V 328
R 305 Q 329
L 306 K 330
D 307 A 331
R 308 I 332
V 309 A 333
E 310 H 334
G 311 Y 335
F 312 E 336
V 313 Q 337
R 314 Q 338
E 315 G 340
G 316 Q 341
A 317 K 342
L 318 V 343
R 319 Q 344
E 320 L 345
G 321 P 346
V 322 T 347
R 323 E 348
R 324 S 349
L 325 L 350
L 326 Q 351
Y 327 E 352
R 328 L 353
L 329 L 354
A 330 D 355
D 331 L 356
L 332 H 357
E 333 R 358
R 334 D 359
L 335 S 360
A 336 E 361
T 337 R 362
R 338 E 363
L 339 A 364
E 340 I 365
L 341 E 366
G 342 R 370
R 343 S 371
A 344 S 372
S 345 F 373
P 346 K 374
K 347 D 375
D 348 V 376
L 349 D 377
G 350 H 378
A 351 L 379
L 352 F 380
R 353 Q 381
R 354 K 382
S 355 L 388
L 356 E 389
Q 357 K 390
I 358 K 391
L 359 R 392
P 360 D 393
E 361 D 394
L 362 F 395
R 363 C 396
A 364 K 397
L 365 Q 398
L 366 N 399
G 367 Q 400
E 368 E 401
E 369 A 402
V 370 S 403
G 371 S 404
L 372 D 405
P 373 R 406
D 374 C 407
L 375 S 408
S 376 G 409
P 377 L 410
L 378 L 411
K 379 Q 412
E 380 V 413
E 381 I 414
L 382 F 415
E 383 S 416
A 384 P 417
A 385 L 418
L 386 E 419
V 387 E 420
E 388 E 421
D 389 V 422
P 390 K 423
P 391 A 424
L 392 G 425
K 393 I 426
V 394 Y 427
S 395 S 428
E 396 K 429
G 397 P 430
G 398 G 431
L 399 G 432
I 400 Y 433
R 401 R 434
E 402 L 435
G 403 F 436
Y 404 V 437
D 405 Q 438
P 406 K 439
D 407 L 440
L 408 Q 441
D 409 D 442
A 410 L 443
L 411 K 444
R 412 K 445
A 413 K 446
A 414 Y 447
H 415 Y 448
R 416 E 449
E 417 E 450
G 418 P 451
V 419 R 452
A 420 K 453
Y 421 G 454
F 422 I 455
L 423 Q 456
E 424 A 457
L 425 E 458
E 426 E 459
E 427 I 460
R 428 L 461
E 429 Q 462
R 430 T 463
E 431 Y 464
R 432 L 465
T 433 K 466
G 434 S 467
I 435 K 468
P 436 E 469
T 437 S 470
L 438 M 471
K 439 T 472
V 440 D 473
G 441 A 474
Y 442 I 475
N 443 L 476
A 444 Q 477
V 445 T 478
F 446 D 479
G 447 Q 480
Y 448 T 481
Y 449 L 482
L 450 T 483
E 451 E 484
V 452 K 485
T 453 E 486
R 454 K 487
P 455 E 488
Y 456 I 489
Y 457 E 490
E 458 K 495
R 459 A 496
V 460 E 497
P 461 S 498
K 462 A 499
E 463 Q 500
Y 464 A 501
R 465 S 502
P 466 A 503
V 467 K 504
Q 468 M 505
T 469 L 506
L 470 H 507
K 471 E 508
D 472 M 509
R 473 Q 510
Q 474 R 511
R 475 K 512
Y 476 N 513
T 477 E 514
L 478 Q 515
P 479 M 516
E 480 M 517
M 481 R 522
K 482 S 523
E 483 Y 524
K 484 Q 525
E 485 E 526
R 486 H 527
E 487 L 528
V 488 K 529
Y 489 Q 530
R 490 L 531
L 491 T 532
E 492 E 533
A 493 K 534
L 494 M 535
I 495 E 536
R 496 N 537
R 497 D 538
R 498 R 539
E 499 V 540
E 500 Q 541
E 501 L 542
V 502 L 543
F 503 K 544
L 504 E 545
E 505 Q 546
V 506 E 547
R 507 R 548
E 508 T 549
R 509 L 550
A 510 A 551
K 511 L 552
R 512 K 553
Q 513 L 554
A 514 Q 555
E 515 E 556
A 516 Q 557
L 517 E 558
R 518 Q 559
E 519 L 560
A 520 L 561
A 521 K 562
R 522 E 563
I 523 G 564
L 524 F 565
A 525 Q 566
E 526 S 569
L 527 R 570
D 528 I 571
V 529 M 572
Y 530 K 573
A 531 N 574
A 532 E 575
L 533 I 576
A 534 Q 577
E 535 D 578
V 536 L 579
A 537 Q 580
V 538 T 581
R 539 K 582
Y 540 M 583
TER
END

