
PFRMAT AL
TARGET T0120
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  3
PARENT 1DG3_A
REMARK DATE	2000-02-11
REMARK SCORE	?
D 58 E 257
M 59 L 258
A 60 D 259
M 61 P 260
E 62 E 261
K 63 F 262
G 64 V 263
K 65 Q 264
Y 66 Q 265
V 67 V 266
G 68 A 267
E 69 D 268
L 70 F 269
R 71 C 270
K 72 S 271
A 73 Y 272
L 74 I 273
L 75 F 274
S 76 S 275
G 77 N 276
A 78 S 277
G 79 K 278
P 80 T 279
A 81 K 280
D 82 T 281
V 83 L 282
Y 84 S 283
T 85 G 284
F 86 G 285
N 87 I 286
F 88 Q 287
S 89 V 288
K 90 N 289
E 91 G 290
S 92 P 291
C 93 R 292
Y 94 L 293
F 95 E 294
F 96 S 295
F 97 L 296
E 98 V 297
K 99 L 298
N 100 T 299
L 101 Y 300
K 102 V 301
D 103 N 302
V 104 A 303
S 105 I 304
F 106 S 305
R 107 S 306
L 108 G 307
G 109 D 308
S 110 L 309
F 111 P 310
N 112 C 311
L 113 M 312
E 114 E 313
K 115 N 314
V 116 A 315
E 117 V 316
N 118 L 317
P 119 A 318
A 120 L 319
E 121 A 320
V 122 Q 321
I 123 I 322
R 124 E 323
E 125 N 324
L 126 S 325
I 127 V 328
C 128 Q 329
Y 129 K 330
C 130 A 331
L 131 I 332
D 132 A 333
T 133 H 334
I 134 Y 335
A 135 E 336
E 136 Q 337
N 137 Q 338
Q 138 M 339
A 139 G 340
K 140 Q 341
N 141 K 342
E 142 V 343
H 143 Q 344
L 144 L 345
Q 145 P 346
K 146 T 347
E 147 E 348
N 148 S 349
E 149 L 350
R 150 Q 351
L 151 E 352
L 152 L 353
R 153 L 354
D 154 D 355
W 155 L 356
N 156 H 357
D 157 R 358
V 158 D 359
Q 159 S 360
G 160 E 361
R 161 R 362
F 162 E 363
E 163 A 364
K 164 I 365
C 165 E 366
V 166 V 367
S 167 F 368
A 168 I 369
K 169 R 370
E 170 S 371
A 171 S 372
L 172 F 373
E 173 K 374
T 174 D 375
D 175 V 376
L 176 D 377
Y 177 H 378
K 178 L 379
R 179 F 380
F 180 Q 381
I 181 K 382
L 182 E 383
V 183 L 384
L 184 A 385
N 185 A 386
E 186 Q 387
K 187 L 388
K 188 E 389
T 189 K 390
K 190 K 391
I 191 R 392
R 192 D 393
S 193 D 394
L 194 F 395
H 195 C 396
N 196 K 397
K 197 Q 398
L 198 N 399
L 199 Q 400
N 200 E 401
A 201 A 402
A 202 S 403
Q 203 S 404
E 204 D 405
R 205 R 406
E 206 C 407
K 207 S 408
D 208 G 409
I 209 V 413
K 210 I 414
Q 211 F 415
E 212 S 416
G 213 P 417
E 214 L 418
T 215 E 419
A 216 E 420
I 217 E 421
C 218 V 422
S 219 K 423
E 220 A 424
M 221 G 425
T 222 I 426
A 223 Y 427
D 224 S 428
R 225 K 429
D 226 P 430
P 227 G 431
V 228 G 432
Y 229 Y 433
D 230 R 434
E 231 L 435
S 232 F 436
T 233 V 437
D 234 Q 438
E 235 K 439
E 236 L 440
S 237 Q 441
E 238 D 442
N 239 L 443
Q 240 K 444
T 241 K 445
D 242 K 446
L 243 Y 447
S 244 Y 448
G 245 E 449
L 246 E 450
A 247 P 451
S 248 R 452
A 249 K 453
A 250 G 454
V 251 E 458
S 252 E 459
K 253 I 460
D 254 L 461
D 255 Q 462
S 256 T 463
I 257 Y 464
I 258 L 465
S 259 K 466
S 260 S 467
L 261 K 468
D 262 E 469
V 263 S 470
T 264 M 471
D 265 T 472
I 266 D 473
A 267 A 474
P 268 I 475
S 269 L 476
R 270 Q 477
K 271 T 478
R 272 D 479
R 273 Q 480
Q 274 T 481
R 275 L 482
M 276 T 483
Q 277 E 484
R 278 K 485
N 279 E 486
L 280 K 487
G 281 E 488
T 282 I 489
E 283 E 490
P 284 V 491
K 285 E 492
M 286 R 493
A 287 V 494
P 288 K 495
Q 289 A 496
E 290 E 497
N 291 S 498
Q 292 A 499
L 293 Q 500
Q 294 A 501
E 295 S 502
K 296 A 503
E 297 K 504
N 298 M 505
S 299 L 506
R 300 H 507
P 301 E 508
D 302 M 509
S 303 Q 510
S 304 R 511
L 305 K 512
P 306 N 513
E 307 E 514
T 308 Q 515
S 309 M 516
K 310 M 517
K 311 E 518
E 312 Q 519
H 313 K 520
I 314 E 521
S 315 R 522
A 316 S 523
E 317 Y 524
N 318 Q 525
M 319 E 526
S 320 H 527
L 321 L 528
E 322 K 529
T 323 Q 530
L 324 L 531
R 325 T 532
N 326 E 533
S 327 K 534
S 328 M 535
P 329 E 536
E 330 N 537
D 331 D 538
TER
END

