
PFRMAT AL
TARGET T0120
AUTHOR 3995-5176-6362
METHOD Chandonia & Cohen, mostly unpublished.
METHOD Uses a combination of PSI-BLAST scoring matrix
METHOD and Pred2ary secondary structure prediction.
METHOD Pred2ary page is http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/pred2ary/
METHOD The potential is documented in the paper by
METHOD Schwartz et al which is referenced on
METHOD my research page: http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/research.html
MODEL 1
PARENT 1d8d_A
M 1 Y 92
E 2 S 93
R 3 E 94
K 4 K 95
I 5 F 96
S 6 R 97
R 7 D 98
I 8 V 99
H 9 Y 100
L 10 D 101
V 11 Y 102
S 12 F 103
E 13 R 104
P 14 A 105
S 15 V 106
I 16 L 107
T 17 Q 108
H 18 R 109
F 19 D 110
L 20 E 111
Q 21 R 112
V 22 S 113
S 23 E 114
W 24 R 115
E 25 A 116
K 26 F 117
T 27 K 118
L 28 L 119
E 29 T 120
S 30 R 121
G 31 D 122
F 32 A 123
V 33 I 124
I 34 E 125
T 35 L 126
L 36 T 132
T 37 V 133
D 38 W 134
G 39 H 135
H 40 F 136
S 41 R 137
A 42 R 138
W 43 V 139
T 44 L 140
G 45 L 141
T 46 R 142
V 47 S 143
S 48 L 144
E 49 Q 145
S 50 K 146
E 51 D 147
I 52 L 148
S 53 Q 149
Q 54 E 150
E 55 E 151
A 56 M 152
D 57 N 153
D 58 Y 154
M 59 I 155
A 60 I 156
M 61 A 157
Y 66 I 158
V 67 I 159
G 68 E 160
E 69 E 161
L 70 Q 162
R 71 P 163
K 72 K 164
A 73 N 165
L 74 Y 166
L 75 Q 167
S 76 V 168
G 77 W 169
A 78 H 170
G 79 H 171
P 80 R 172
A 81 R 173
D 82 V 174
V 83 L 175
Y 84 V 176
T 85 E 177
F 86 W 178
N 87 L 179
F 88 K 180
S 89 D 181
K 90 P 182
E 91 S 183
S 92 Q 184
C 93 E 185
Y 94 L 186
F 95 E 187
F 96 F 188
F 97 I 189
E 98 A 190
K 99 D 191
N 100 I 192
L 101 L 193
K 102 N 194
D 103 Q 195
V 104 D 196
S 105 A 197
F 106 K 198
R 107 N 199
L 108 Y 200
G 109 H 201
S 110 A 202
F 111 W 203
N 112 Q 204
L 113 H 205
E 114 R 206
K 115 Q 207
V 116 W 208
E 117 V 209
N 118 I 210
P 119 Q 211
A 120 E 212
E 121 F 213
V 122 R 214
I 123 L 215
R 124 W 216
E 125 D 217
L 126 N 218
I 127 E 219
C 128 L 220
Y 129 Q 221
C 130 Y 222
L 131 V 223
D 132 D 224
T 133 Q 225
I 134 L 226
A 135 L 227
E 136 K 228
N 137 E 229
Q 138 D 230
A 139 V 231
K 140 R 232
N 141 N 233
E 142 N 234
H 143 S 235
L 144 V 236
Q 145 W 237
K 146 N 238
E 147 Q 239
N 148 R 240
E 149 H 241
R 150 F 242
L 151 V 243
W 155 I 244
N 156 S 245
D 157 N 246
V 158 T 247
Q 159 T 248
G 160 G 249
R 161 Y 250
F 162 S 251
E 163 D 252
K 164 R 253
C 165 A 254
V 166 V 255
L 172 L 256
E 173 E 257
T 174 R 258
D 175 E 259
L 176 V 260
Y 177 Q 261
K 178 Y 262
R 179 T 263
F 180 L 264
I 181 E 265
H 195 M 266
N 196 I 267
K 197 K 268
L 198 L 269
L 199 E 274
N 200 S 275
A 201 A 276
A 202 W 277
Q 203 N 278
E 204 Y 279
R 205 L 280
E 206 K 281
K 207 G 282
D 208 I 283
I 209 L 284
K 210 Q 285
Q 211 D 286
E 212 R 287
G 213 G 288
A 223 L 289
D 224 S 290
R 225 R 291
D 226 Y 292
P 227 P 293
V 228 N 294
Y 229 L 295
D 230 L 296
E 231 N 297
S 232 Q 298
T 233 L 299
D 234 L 300
E 235 D 301
E 236 L 302
S 237 Q 303
E 238 P 304
N 239 S 305
Q 240 H 306
T 241 S 307
D 242 S 308
L 243 P 309
S 244 Y 310
G 245 L 311
L 246 I 312
A 247 A 313
S 248 F 314
A 249 L 315
A 250 V 316
V 251 D 317
S 252 I 318
K 253 Y 319
D 254 E 320
D 255 D 321
S 256 M 322
I 257 L 323
I 258 E 324
S 259 N 325
S 260 Q 326
L 261 C 327
D 262 D 328
V 263 N 329
T 264 K 330
D 265 E 331
I 266 D 332
A 267 I 333
P 268 L 334
S 269 N 335
R 270 K 336
K 271 A 337
R 272 L 338
R 273 E 339
Q 274 L 340
R 275 C 341
M 276 E 342
Q 277 I 343
R 278 L 344
N 279 A 345
L 280 K 346
G 281 E 347
I 314 K 348
S 315 D 349
A 316 T 350
E 317 I 351
N 318 R 352
M 319 K 353
S 320 E 354
L 321 Y 355
E 322 W 356
T 323 R 357
L 324 Y 358
R 325 I 359
N 326 G 360
S 327 R 361
S 328 S 362
P 329 L 363
E 330 Q 364
D 331 S 365
L 332 R 369
F 333 E 370
D 334 S 371
E 335 D 372
I 336 I 373
TER
END

