
PFRMAT AL
TARGET T0121
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  2
PARENT 1NBD
REMARK DATE	1997-05-16
REMARK SCORE	 1e-31	131	53/220 (24%)
E 15 G 437
V 16 T 438
T 17 P 439
A 18 V 440
V 19 L 441
R 20 K 442
E 21 D 443
L 22 I 444
S 23 N 445
L 24 F 446
E 25 K 447
V 26 I 448
K 27 E 449
D 28 R 450
G 29 G 451
E 30 Q 452
F 31 L 453
M 32 L 454
I 33 A 455
L 34 V 456
L 35 A 457
G 36 G 458
P 37 S 459
S 38 T 460
G 39 G 461
C 40 A 462
G 41 G 463
K 42 K 464
T 43 T 465
T 44 S 466
T 45 L 467
L 46 L 468
R 47 M 469
M 48 M 470
I 49 I 471
A 50 M 472
G 51 G 473
L 52 E 474
E 53 L 475
E 54 E 476
P 55 P 477
S 56 S 478
R 57 E 479
G 58 G 480
Q 59 K 481
I 60 I 482
Y 61 K 483
I 62 H 484
G 63 S 485
D 64 G 486
D 82 R 487
I 83 I 488
A 84 S 489
M 85 F 490
V 86 C 491
F 87 S 492
Q 88 Q 493
S 89 F 494
Y 90 S 495
A 91 W 496
L 92 I 497
Y 93 M 498
P 94 P 499
H 95 G 500
T 97 T 501
V 98 I 502
Y 99 K 503
D 100 E 504
N 101 N 505
I 102 I 506
A 103 I 507
F 104 F 508
P 105 G 509
L 106 V 510
K 107 R 516
L 108 Y 517
R 109 R 518
K 110 S 519
V 111 V 520
P 112 I 521
R 113 K 522
Q 114 A 523
E 115 Q 525
I 116 L 526
D 117 E 527
Q 118 E 528
R 119 D 529
V 120 I 530
R 121 S 531
E 122 K 532
V 123 F 533
A 124 A 534
E 125 E 535
L 126 K 536
L 127 D 537
G 128 N 538
L 129 I 539
L 132 V 540
L 133 L 541
N 134 G 542
R 135 E 543
K 136 G 544
P 137 G 545
R 138 I 546
E 139 T 547
L 140 L 548
S 141 S 549
G 142 G 550
G 143 G 551
Q 144 Q 552
R 145 R 553
Q 146 A 554
R 147 R 555
V 148 I 556
A 149 S 557
L 150 L 558
G 151 A 559
R 152 R 560
A 153 A 561
I 154 V 562
V 155 Y 563
R 156 K 564
K 157 D 565
P 158 A 566
Q 159 D 567
V 160 L 568
F 161 Y 569
L 162 L 570
M 163 L 571
D 164 D 572
E 165 S 573
P 166 P 574
L 167 F 575
S 168 G 576
N 169 Y 577
L 170 L 578
D 171 D 579
A 172 V 580
K 173 L 581
L 174 T 582
R 175 E 583
V 176 K 584
R 177 E 585
M 178 I 586
R 179 F 587
A 180 E 588
E 181 C 590
L 182 V 591
K 183 C 592
K 184 K 593
L 185 L 594
Q 186 M 595
R 187 A 596
G 190 N 597
V 191 K 598
T 192 T 599
T 193 R 600
I 194 I 601
Y 195 L 602
V 196 V 603
T 197 T 604
H 198 S 605
D 199 K 606
Q 200 M 607
V 201 E 608
E 202 H 609
A 203 L 610
M 204 K 611
T 205 K 612
G 207 A 613
D 208 D 614
R 209 K 615
I 210 I 616
A 211 L 617
V 212 I 618
M 213 L 619
N 214 H 620
R 215 E 621
G 216 G 622
V 217 S 623
L 218 S 624
Q 219 Y 625
Q 220 F 626
V 221 Y 627
G 222 G 628
S 223 T 629
P 224 F 630
D 225 S 631
E 226 E 632
V 227 L 633
TER
END

