
PFRMAT AL
TARGET T0124
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  1
PARENT 1C1G_D
REMARK DATE	2000-02-11
REMARK SCORE	 2e-30	126	49/257 (19%)
V 884 L 871
T 885 D 872
Q 886 R 873
L 887 A 874
P 888 D 875
E 889 E 876
P 890 A 877
Q 891 E 878
T 892 A 879
A 893 D 880
S 894 K 881
L 895 K 882
A 896 A 883
E 897 A 884
L 898 E 885
Q 899 D 886
Q 900 R 887
M 901 S 888
K 902 K 889
L 903 Q 890
F 904 L 891
L 905 E 892
K 906 D 893
L 907 E 894
L 908 L 895
K 909 V 896
K 910 S 897
Q 911 L 898
E 912 Q 899
K 913 K 900
E 914 K 901
L 915 L 902
K 916 K 903
E 917 A 904
L 918 T 905
E 919 E 906
R 920 D 907
K 921 E 908
G 922 L 909
S 923 D 910
K 924 K 911
R 925 Y 912
R 926 S 913
E 927 E 914
E 928 A 915
L 929 L 916
L 930 K 917
Q 931 D 918
K 932 A 919
Y 933 Q 920
S 934 E 921
V 935 K 922
L 936 L 923
F 937 E 924
L 938 L 925
E 939 A 926
P 940 E 927
V 941 K 928
Y 942 K 929
P 943 A 930
R 944 T 931
G 945 D 932
L 979 A 933
D 980 E 934
S 981 A 935
Q 982 D 936
V 983 V 937
V 984 A 938
E 985 S 939
L 986 L 940
K 987 N 941
E 988 R 942
R 989 R 943
L 990 I 944
E 991 E 948
M 992 E 949
E 993 E 950
L 994 L 951
I 995 D 952
H 996 R 953
L 997 A 954
G 998 Q 955
E 999 E 956
E 1000 R 957
Y 1001 L 958
H 1002 A 959
D 1003 T 960
G 1004 A 961
I 1005 L 962
R 1006 Q 963
R 1007 K 964
R 1008 L 965
K 1009 E 966
E 1010 E 967
Q 1011 A 968
H 1012 E 969
A 1013 K 970
T 1014 A 971
E 1015 A 972
Q 1016 D 973
T 1017 E 974
A 1018 S 975
K 1019 E 976
I 1020 R 977
T 1021 G 978
E 1022 M 979
L 1023 K 980
A 1024 V 981
R 1025 I 982
E 1026 E 983
K 1027 S 984
Q 1028 R 985
I 1029 A 986
A 1030 Q 987
E 1031 K 988
L 1032 D 989
K 1033 E 990
A 1034 E 991
L 1035 K 992
K 1036 M 993
E 1037 E 994
S 1038 I 995
S 1039 Q 996
E 1040 E 997
S 1041 I 998
N 1042 Q 999
I 1043 L 1000
K 1044 K 1001
D 1045 E 1002
I 1046 A 1003
K 1047 K 1004
K 1048 H 1005
K 1049 I 1006
L 1050 A 1007
E 1051 E 1008
A 1052 A 1018
K 1053 R 1019
R 1054 K 1020
L 1055 L 1021
D 1056 V 1022
R 1057 I 1023
I 1058 I 1024
Q 1059 E 1025
V 1060 S 1026
M 1061 D 1027
M 1062 L 1028
R 1063 E 1029
S 1064 R 1030
T 1065 A 1031
S 1066 E 1032
D 1067 E 1033
K 1068 R 1034
A 1069 A 1035
A 1070 E 1036
Q 1071 L 1037
E 1072 S 1038
R 1073 E 1039
L 1074 G 1040
K 1075 K 1041
K 1076 C 1042
E 1077 A 1043
I 1078 E 1044
N 1079 L 1045
N 1080 E 1046
S 1081 E 1047
H 1082 E 1048
I 1083 I 1049
Q 1084 K 1050
E 1085 T 1051
V 1086 V 1052
V 1087 T 1053
Q 1088 N 1054
T 1089 N 1055
I 1090 L 1056
K 1091 K 1057
L 1092 S 1058
L 1093 L 1059
T 1094 E 1060
E 1095 A 1061
K 1096 Q 1062
T 1097 A 1063
A 1098 E 1064
R 1099 K 1065
Y 1100 Y 1066
Q 1101 S 1067
Q 1102 Q 1068
K 1103 K 1069
E 1105 E 1070
E 1106 D 1071
K 1107 K 1072
Q 1108 Y 1073
A 1109 E 1074
E 1110 E 1075
N 1111 E 1076
L 1112 I 1077
R 1113 K 1078
A 1114 V 1079
I 1115 L 1080
Q 1116 S 1081
E 1117 D 1082
K 1118 K 1083
E 1119 L 1084
G 1120 K 1085
Q 1121 E 1086
L 1122 A 1087
Q 1123 E 1088
Q 1124 E 1095
E 1125 R 1096
A 1126 S 1097
V 1127 V 1098
A 1128 T 1099
E 1129 K 1100
Y 1130 L 1101
E 1131 E 1102
E 1132 K 1103
K 1133 S 1104
L 1134 I 1105
K 1135 D 1106
T 1136 D 1107
L 1137 L 1108
T 1138 E 1109
V 1139 D 1110
E 1140 E 1111
V 1141 L 1112
Q 1142 Y 1113
E 1143 A 1114
M 1144 Q 1115
V 1145 K 1116
K 1146 K 1120
N 1147 A 1121
Y 1148 I 1122
M 1149 S 1123
K 1150 E 1124
E 1151 E 1125
V 1152 L 1126
TER
END

