
PFRMAT AL
TARGET T0124
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  2
PARENT 1C1G_D
REMARK DATE	2000-02-11
REMARK SCORE	 1e-23	103	25/240 (10%)
L 898 M 853
Q 899 D 854
Q 900 A 855
M 901 I 856
K 902 K 857
L 903 K 858
F 904 K 859
L 905 M 860
K 906 Q 861
L 907 M 862
L 908 L 863
K 909 K 864
K 910 L 865
Q 911 D 866
E 912 K 867
K 913 E 868
E 914 N 869
L 915 A 870
K 916 L 871
E 917 D 872
L 918 R 873
E 919 A 874
R 920 D 875
K 921 E 876
G 922 A 877
S 923 E 878
K 924 A 879
R 925 D 880
R 926 K 881
E 927 K 882
E 928 A 883
L 929 A 884
L 930 E 885
Q 931 D 886
K 932 R 887
Y 933 S 888
S 934 K 889
V 935 Q 890
L 936 L 891
F 937 E 892
L 938 D 893
E 939 E 894
P 940 L 895
V 941 V 896
Y 942 S 897
P 943 L 898
R 944 Q 899
G 945 K 900
L 979 K 901
D 980 L 902
S 981 K 903
Q 982 A 904
V 983 T 905
V 984 E 906
E 985 D 907
L 986 E 908
K 987 L 909
E 988 D 910
R 989 K 911
L 990 Y 912
E 991 S 913
M 992 E 914
E 993 A 915
L 994 L 916
I 995 K 917
H 996 D 918
L 997 A 919
G 998 Q 920
E 999 E 921
E 1000 K 922
Y 1001 L 923
H 1002 E 924
D 1003 L 925
G 1004 A 926
I 1005 E 927
R 1006 K 928
R 1007 K 929
R 1008 A 930
K 1009 T 931
E 1010 D 932
Q 1011 A 933
H 1012 E 934
A 1013 A 935
T 1014 D 936
E 1015 V 937
Q 1016 A 938
T 1017 S 939
A 1018 L 940
K 1019 N 941
I 1020 R 942
T 1021 R 943
E 1022 I 944
L 1023 Q 945
A 1024 L 946
R 1025 F 947
E 1026 E 948
K 1027 E 949
Q 1028 E 950
I 1029 L 951
A 1030 D 952
E 1031 R 953
L 1032 A 954
K 1033 Q 955
A 1034 E 956
L 1035 R 957
K 1036 L 958
E 1037 A 959
S 1038 T 960
S 1039 A 961
E 1040 L 962
S 1041 Q 963
N 1042 K 964
I 1043 L 965
K 1044 E 966
D 1045 E 967
I 1046 A 968
K 1047 E 969
K 1048 K 970
K 1049 Q 987
L 1050 K 988
E 1051 D 989
A 1052 E 990
K 1053 E 991
R 1054 K 992
L 1055 M 993
D 1056 E 994
R 1057 I 995
I 1058 Q 996
Q 1059 E 997
V 1060 I 998
M 1061 Q 999
M 1062 L 1000
R 1063 K 1001
S 1064 E 1002
T 1065 A 1003
S 1066 K 1004
D 1067 H 1005
K 1068 I 1006
A 1069 A 1007
A 1070 E 1008
Q 1071 D 1009
E 1072 A 1010
R 1073 D 1011
L 1074 R 1012
K 1075 K 1013
K 1076 Y 1014
E 1077 E 1015
I 1078 E 1016
N 1079 V 1017
N 1080 A 1018
S 1081 R 1019
H 1082 K 1020
I 1083 L 1021
Q 1084 V 1022
E 1085 I 1023
V 1086 I 1024
V 1087 E 1025
Q 1088 S 1026
T 1089 D 1027
I 1090 L 1028
K 1091 E 1029
L 1092 R 1030
L 1093 A 1031
T 1094 E 1032
E 1095 E 1033
K 1096 R 1034
T 1097 A 1035
A 1098 E 1036
R 1099 L 1037
Y 1100 S 1038
Q 1101 E 1039
Q 1102 G 1040
K 1103 K 1041
L 1104 C 1042
E 1105 A 1043
E 1106 E 1044
K 1107 L 1045
Q 1108 E 1046
A 1109 E 1047
E 1110 E 1048
N 1111 I 1049
L 1112 K 1050
R 1113 L 1056
A 1114 K 1057
I 1115 S 1058
Q 1116 L 1059
E 1117 E 1060
K 1118 A 1061
E 1119 Q 1062
G 1120 A 1063
Q 1121 E 1064
L 1122 K 1065
Q 1123 Y 1066
Q 1124 S 1067
E 1125 Q 1068
A 1126 K 1069
V 1127 E 1070
A 1128 D 1071
E 1129 K 1072
Y 1130 Y 1073
E 1131 E 1074
E 1132 E 1075
K 1133 E 1076
L 1134 I 1077
K 1135 K 1078
T 1136 V 1079
L 1137 L 1080
T 1138 S 1081
V 1139 D 1082
E 1140 K 1083
V 1141 L 1084
Q 1142 K 1085
E 1143 E 1086
M 1144 A 1087
V 1145 E 1088
K 1146 T 1089
N 1147 R 1090
Y 1148 A 1091
M 1149 E 1092
TER
END

