

PFRMAT AL
TARGET T0127
AUTHOR 9885-9936-6780
METHOD Smith-Waterman alignment of secondary structure
METHOD and sequence
MODEL 1
PARENT 1a5t
Q   29   R    8
E   30   P    9
D   31   D   10
M   32   F   11
K   33   K   13
L   34   L   14
A   35   V   15
L   36   A   16
L   37   S   17
L   38   Y   18
T   39   Q   19
A   40   A   20
D   42   G   21
P   43   R   22
G   44   G   23
I   45   H   24
G   46   H   25
V   48   A   26
L   49   L   27
V   50   L   28
F   51   I   29
G   52   Q   30
D   53   A   31
R   54   L   32
G   55   G   34
T   56   M   35
G   57   G   36
K   58   D   37
S   59   D   38
T   60   A   39
A   61   L   40
V   62   I   41
R   63   Y   42
A   64   A   43
L   65   L   44
A   66   S   45
A   67   R   46
L   68   L   48
L   69   L   49
P   70   Q   51
E   71   Q   52
I   72   P   53
E   73   Q   54
A   74   G   55
V   75   H   56
E   76   K   57
G   77   S   58
C   78   C   59
P   79   G   60
S   81   H   61
S   82   C   62
P   83   R   63
N   84   G   64
V   85   C   65
E   86   Q   66
M   87   L   67
I   88   M   68
P   89   Q   69
D   90   A   70
A   92   G   71
T   93   T   72
V   94   H   73
T   97   P   74
N   98   D   75
V   99   Y   76
R  101   Y   77
T  104   T   78
V  107   L   79
L  109   A   80
P  110   P   81
V  113   E   82
S  114   K   83
E  115   G   84
D  116   K   85
R  117   N   86
V  118   T   87
V  119   L   88
A  121   G   89
L  122   V   90
D  123   D   91
I  124   A   92
E  125   V   93
R  126   R   94
A  127   E   95
I  128   V   96
S  129   T   97
E  132   E   98
K  133   K   99
A  134   L  100
F  135   N  101
E  136   E  102
P  137   H  103
G  138   A  104
R  142   R  105
N  144   L  106
R  145   G  107
G  146   G  108
Y  147   A  109
L  148   K  110
Y  149   V  111
I  150   V  112
D  151   W  113
E  152   V  114
C  153   T  115
N  154   A  117
L  155   A  118
L  156   L  119
E  157   T  121
D  158   D  122
H  159   A  123
I  160   A  124
V  161   A  125
D  162   N  126
L  163   A  127
L  164   L  128
L  165   L  129
D  166   K  130
V  167   T  131
A  168   L  132
G  171   E  133
E  172   E  134
E  176   P  135
G  179   P  136
S  181   A  137
R  187   W  140
F  188   F  141
V  189   F  142
L  190   L  143
V  191   A  144
G  192   T  145
G  194   R  146
N  195   E  147
P  196   P  148
E  197   E  149
E  198   R  150
L  201   L  151
R  202   L  152
Q  204   A  153
L  205   T  154
L  206   L  155
D  207   R  156
R  208   S  157
G  210   R  158
L  211   C  159
S  212   R  160
V  213   L  161
E  214   H  162
V  215   Y  163
L  216   L  164
S  217   A  165
P  218   P  166
R  219   P  167
D  220   P  168
V  221   E  169
E  222   Q  170
T  223   Y  171
R  224   A  172
V  225   V  173
E  226   T  174
V  227   W  175
I  228   L  176
R  230   S  177
R  231   R  178
D  232   E  179
T  233   V  180
D  235   T  181
A  236   M  182
D  237   S  183
P  238   Q  184
K  239   D  185
A  240   A  186
F  241   L  187
L  242   L  188
E  243   A  189
E  244   A  190
W  245   L  191
R  246   R  192
P  247   L  193
K  248   P  198
D  249   G  199
M  250   A  200
D  251   A  201
I  252   L  202
R  253   D  208
N  254   N  209
Q  255   Q  211
I  256   A  212
L  257   R  213
E  258   E  214
A  259   T  215
R  260   L  216
E  261   Q  218
R  262   A  219
L  263   L  220
P  264   A  221
K  265   Y  222
T  271   S  223
A  272   V  224
L  273   P  225
Y  274   S  226
D  275   D  228
C  276   W  229
A  277   Y  230
A  278   S  231
L  279   L  232
C  280   L  233
I  281   A  234
A  282   A  235
L  283   L  236
G  284   N  237
S  285   H  238
D  286   E  239
G  287   Q  240
L  288   A  241
R  289   P  242
G  290   A  243
E  291   R  244
L  292   L  245
T  293   H  246
L  294   W  247
L  295   L  248
R  299   A  249
A  300   T  250
L  301   L  251
A  302   L  252
A  303   M  253
L  304   D  254
E  305   A  255
G  306   L  256
A  307   K  257
A  309   N  267
V  310   V  268
G  311   D  269
R  312   V  270
D  313   P  271
H  314   G  272
L  315   L  273
V  318   V  274
A  319   A  275
T  320   E  276
M  321   L  277
A  322   A  278
S  324   N  279
H  325   H  280
R  326   L  281
L  327   S  282
TER
END
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Ajay K. Royyuru, PhD                   Phone: (914) 945-1335
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