
PFRMAT AL
TARGET T0127
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  3
PARENT 1C4O_A
REMARK DATE	2000-07-26
REMARK SCORE	 0.004	36.6	43/319 (13%)
Q 29 Q 14
E 30 P 15
D 31 K 16
M 32 A 17
K 33 I 18
L 34 A 19
A 35 G 20
L 36 L 21
L 37 V 22
L 38 E 23
T 39 A 24
A 40 L 25
V 41 R 26
D 42 D 27
G 44 G 28
I 45 E 29
G 46 R 30
G 47 F 31
V 48 V 32
L 49 T 33
V 50 L 34
F 51 L 35
G 52 G 36
D 53 A 37
R 54 T 38
G 55 G 39
T 56 T 40
G 57 G 41
K 58 K 42
S 59 T 43
T 60 V 44
A 61 T 45
V 62 M 46
R 63 A 47
A 64 K 48
L 65 V 49
A 66 I 50
A 67 E 51
L 68 A 52
L 69 L 53
P 70 G 54
E 71 R 55
I 72 P 56
E 73 A 57
A 74 L 58
V 75 V 59
E 76 L 60
G 77 A 61
P 79 P 62
V 80 N 63
S 81 K 64
S 82 I 65
P 83 L 66
N 84 A 67
V 85 A 68
E 86 Q 69
M 87 L 70
I 88 A 71
P 89 A 72
D 90 E 73
W 91 F 74
A 92 R 75
T 93 E 76
V 94 L 77
L 95 F 78
S 96 P 79
T 97 E 80
N 98 N 81
V 99 A 82
I 100 V 83
R 101 E 84
K 102 Y 85
E 115 F 86
D 116 I 87
R 117 S 88
V 118 Y 89
V 119 Y 90
G 120 D 91
A 121 Y 92
L 122 Y 93
D 123 Q 94
I 124 P 95
E 125 E 96
R 126 A 97
A 127 Y 98
I 128 V 99
S 129 P 100
K 130 G 101
G 131 K 102
E 132 D 103
K 133 L 104
A 134 Y 105
F 135 I 106
E 136 E 107
P 137 K 108
G 138 D 109
L 139 A 110
L 140 S 111
A 141 I 112
R 142 N 113
A 143 P 114
E 152 E 115
C 153 I 116
N 154 E 117
L 155 R 118
L 156 L 119
E 157 R 120
D 158 H 121
H 159 S 122
I 160 T 123
V 161 T 124
D 162 R 125
L 163 S 126
L 164 L 127
L 165 L 128
D 166 T 129
P 185 R 130
A 186 R 131
R 187 D 132
F 188 V 133
V 189 I 134
L 190 V 135
V 191 V 136
G 192 A 137
S 193 S 138
G 194 V 139
N 195 S 140
P 196 A 141
E 197 I 142
E 198 Y 143
G 199 G 144
D 200 L 145
L 201 G 146
R 202 D 147
P 203 P 148
Q 204 R 149
L 205 E 150
L 206 Y 151
D 207 R 152
R 208 A 153
F 209 R 154
G 210 N 155
L 211 L 156
S 212 V 157
T 293 G 236
L 294 F 237
L 295 V 238
R 296 L 239
S 297 F 240
A 298 P 241
R 299 A 242
A 300 T 243
L 301 H 244
A 309 Y 245
V 310 L 246
G 311 S 247
R 312 P 248
D 313 E 249
H 314 G 250
L 315 L 251
K 316 E 252
R 317 E 253
V 318 I 254
A 319 L 255
T 320 K 256
M 321 E 257
A 322 I 258
L 323 E 259
S 324 K 260
H 325 E 261
R 326 L 262
L 327 W 263
R 328 E 264
R 329 R 265
D 330 V 266
P 331 R 267
L 332 Y 268
D 333 F 269
E 334 E 270
A 335 E 271
G 336 R 272
S 337 G 273
T 338 E 274
A 339 V 275
R 340 L 276
V 341 Y 277
A 342 A 278
R 343 Q 279
T 344 R 280
V 345 L 281
E 346 K 282
E 347 E 283
TER
END

