
PFRMAT AL
TARGET T0127
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1A5T
REMARK DATE	1998-05-27
REMARK SCORE	?
G 28 W 6
Q 29 L 7
E 30 R 8
D 31 P 9
M 32 D 10
K 33 F 11
L 34 E 12
A 35 K 13
L 36 L 14
L 37 V 15
L 38 A 16
T 39 S 17
A 40 Y 18
V 41 Q 19
D 42 A 20
P 43 G 21
G 44 R 22
I 45 G 23
G 46 H 24
G 47 H 25
V 48 L 27
L 49 L 28
V 50 I 29
F 51 Q 30
G 52 A 31
D 53 L 32
R 54 P 33
G 55 G 34
T 56 M 35
G 57 G 36
K 58 D 37
S 59 D 38
T 60 A 39
A 61 L 40
V 62 I 41
R 63 Y 42
A 64 A 43
L 65 L 44
A 66 S 45
A 67 R 46
L 68 Y 47
L 69 L 48
P 70 E 82
E 71 K 83
I 72 G 84
E 73 K 85
A 74 N 86
V 75 T 87
E 76 L 88
G 77 G 89
C 78 V 90
P 79 D 91
V 80 A 92
S 81 V 93
S 82 R 94
P 83 E 95
N 84 V 96
V 85 T 97
E 86 E 98
M 87 K 99
I 88 L 100
P 89 N 101
D 90 E 102
W 91 H 103
A 92 A 104
T 93 R 105
V 94 L 106
L 95 G 107
S 96 G 108
T 97 A 109
N 98 K 110
V 99 V 111
I 100 V 112
R 101 W 113
K 102 V 114
P 103 T 115
T 104 D 116
P 105 A 117
V 106 A 118
V 107 L 119
D 108 L 120
L 109 T 121
P 110 D 122
L 111 A 123
G 112 A 124
V 113 A 125
S 114 N 126
E 115 A 127
D 116 L 128
R 117 L 129
V 118 K 130
V 119 T 131
G 120 L 132
A 121 E 133
L 122 E 134
D 123 P 135
I 124 P 136
E 125 A 137
R 126 E 138
A 127 T 139
I 128 W 140
S 129 F 141
K 130 F 142
G 131 L 143
E 132 A 144
K 133 T 145
A 134 R 146
F 135 E 147
E 136 P 148
P 137 E 149
G 138 R 150
L 139 L 151
L 140 L 152
A 141 A 153
R 142 T 154
A 143 L 155
N 144 R 156
R 145 S 157
G 146 R 158
Y 147 C 159
L 148 R 160
Y 149 L 161
I 150 H 162
D 151 Y 163
E 152 L 164
C 153 A 165
N 154 P 166
L 155 P 167
L 156 P 168
E 157 E 169
D 158 Q 170
H 159 Y 171
I 160 A 172
V 161 V 173
D 162 T 174
L 163 W 175
L 164 L 176
L 165 S 177
D 166 R 178
V 167 E 179
A 168 V 180
Q 169 T 181
S 170 M 182
G 171 S 183
E 172 Q 184
N 173 D 185
V 174 A 186
V 175 L 187
E 176 L 188
R 177 A 189
D 178 A 190
G 179 L 191
L 180 R 192
S 181 L 193
I 182 S 194
R 183 A 195
H 184 G 196
P 185 S 197
A 186 P 198
R 187 G 199
F 188 F 205
V 189 Q 206
L 190 G 207
V 191 D 208
G 192 N 209
S 193 W 210
G 194 Q 211
N 195 A 212
P 196 R 213
E 197 E 214
E 198 T 215
G 199 L 216
D 200 C 217
L 201 Q 218
R 202 A 219
P 203 L 220
Q 204 A 221
L 205 Y 222
L 206 S 223
D 207 V 224
R 208 P 225
F 209 S 226
G 210 G 227
L 211 D 228
S 212 W 229
V 213 Y 230
E 214 S 231
V 215 L 232
L 216 L 233
S 217 A 234
P 218 A 235
R 219 L 236
D 220 N 237
V 221 H 238
E 222 E 239
T 223 Q 240
R 224 A 241
V 225 P 242
E 226 A 243
V 227 R 244
I 228 L 245
R 229 H 246
R 230 W 247
R 231 L 248
D 232 A 249
T 233 L 252
Y 234 M 253
D 235 D 254
A 236 A 255
D 237 L 256
P 238 K 257
K 239 R 258
R 246 V 265
P 247 T 266
K 248 N 267
D 249 V 268
M 250 D 269
D 251 V 270
I 252 P 271
R 253 G 272
N 254 L 273
Q 255 V 274
I 256 A 275
L 257 E 276
E 258 L 277
A 259 A 278
R 260 N 279
E 261 H 280
R 262 L 281
L 263 S 282
P 264 P 283
K 265 S 284
V 266 R 285
E 267 L 286
A 268 Q 287
P 269 A 288
N 270 I 289
T 271 L 290
A 272 G 291
L 273 D 292
Y 274 V 293
D 275 C 294
C 276 H 295
A 277 I 296
A 278 R 297
L 279 E 298
C 280 Q 299
I 281 L 300
A 282 M 301
L 283 S 302
G 284 V 303
TER
END

