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# LGA #
# --------------- #
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# Local-Global Alignment #
# A Method for Finding 3-D Similarities #
# in Protein Structures #
# #
# ------------ 09/2019 #
# #
# Adam Zemla (zemla1@llnl.gov) #
# Lawrence Livermore National Laboratory, CA #
# #
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# Molecule1: number of CA atoms 136 ( 1097), selected 135 , name T1228v2TS079_1-D2
# Molecule2: number of CA atoms 135 ( 2219), selected 135 , name T1228v2-D2.pdb
# PARAMETERS: -3 -ie -o1 -sda -d:4 -gdc_sc -swap T1228v2TS079_1-D2.lga
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis
LCS - RMSD CUTOFF 5.00 length segment l_RMS g_RMS
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 1.01 1.01
LCS_AVERAGE: 100.00
LCS - RMSD CUTOFF 2.00 length segment l_RMS g_RMS
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 1.01 1.01
LCS_AVERAGE: 100.00
LCS - RMSD CUTOFF 1.00 length segment l_RMS g_RMS
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 134 165 - 299 0.99 1.01
LCS_AVERAGE: 99.18
LCS_GDT MOLECULE-1 MOLECULE-2 LCS_DETAILS GDT_DETAILS TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS: 135
LCS_GDT RESIDUE RESIDUE SEGMENT_SIZE GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT NAME NUMBER NAME NUMBER 1.0 2.0 5.0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5 8.0 8.5 9.0 9.5 10.0
LCS_GDT G 165 G 165 134 135 135 40 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 166 K 166 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT W 167 W 167 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 168 I 168 134 135 135 76 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT S 169 S 169 134 135 135 55 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT G 170 G 170 134 135 135 23 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 171 L 171 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 172 A 172 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT P 173 P 173 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Y 174 Y 174 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT G 175 G 175 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Y 176 Y 176 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 177 Q 177 134 135 135 75 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 178 L 178 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 179 N 179 134 135 135 4 94 119 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 180 K 180 134 135 135 3 3 30 121 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 181 K 181 134 135 135 3 70 111 125 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT T 182 T 182 134 135 135 33 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT S 183 S 183 134 135 135 63 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 184 K 184 134 135 135 67 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 185 L 185 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT D 186 D 186 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT P 187 P 187 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 188 V 188 134 135 135 66 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT E 189 E 189 134 135 135 75 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT D 190 D 190 134 135 135 78 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT E 191 E 191 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 192 A 192 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 193 K 193 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 194 V 194 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 195 V 195 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 196 Q 196 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 197 L 197 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 198 I 198 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT F 199 F 199 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 200 N 200 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 201 I 201 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT F 202 F 202 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 203 L 203 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 204 N 204 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT G 205 G 205 134 135 135 75 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 206 L 206 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 207 N 207 134 135 135 62 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT G 208 G 208 134 135 135 41 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 209 K 209 134 135 135 7 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT D 210 D 210 134 135 135 7 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Y 211 Y 211 134 135 135 3 95 119 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT S 212 S 212 134 135 135 3 33 42 128 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Y 213 Y 213 134 135 135 3 6 38 52 123 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 215 A 215 134 135 135 19 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 216 I 216 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 217 A 217 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT S 218 S 218 134 135 135 75 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT H 219 H 219 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 220 L 220 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT T 221 T 221 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 222 N 222 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 223 L 223 134 135 135 63 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 224 Q 224 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 225 I 225 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT P 226 P 226 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT T 227 T 227 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT P 228 P 228 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT S 229 S 229 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT G 230 G 230 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 231 K 231 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 232 K 232 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT R 233 R 233 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT W 234 W 234 134 135 135 73 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 235 N 235 134 135 135 38 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 236 Q 236 134 135 135 44 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Y 237 Y 237 134 135 135 46 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT T 238 T 238 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 239 I 239 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 240 K 240 134 135 135 78 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 241 A 241 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 242 I 242 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT L 243 L 243 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 244 Q 244 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 245 N 245 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT E 246 E 246 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 247 V 247 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Y 248 Y 248 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 249 I 249 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT G 250 G 250 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT T 251 T 251 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 252 V 252 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 253 K 253 134 135 135 78 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Y 254 Y 254 134 135 135 24 106 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 255 K 255 134 135 135 73 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 256 V 256 134 135 135 21 105 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT R 257 R 257 134 135 135 30 106 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT E 258 E 258 134 135 135 38 106 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 259 K 259 134 135 135 23 102 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT T 260 T 260 134 135 135 23 94 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 261 K 261 134 135 135 9 94 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT D 262 D 262 134 135 135 9 47 88 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT G 263 G 263 134 135 135 17 47 112 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 264 K 264 134 135 135 23 47 118 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT R 265 R 265 134 135 135 23 47 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT T 266 T 266 134 135 135 23 47 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 267 I 267 134 135 135 23 47 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT R 268 R 268 134 135 135 23 98 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT P 269 P 269 134 135 135 23 76 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT E 270 E 270 134 135 135 23 76 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 271 K 271 134 135 135 23 76 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT E 272 E 272 134 135 135 23 105 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 273 Q 273 134 135 135 23 105 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 274 I 274 134 135 135 56 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 275 V 275 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 276 V 276 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 277 Q 277 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT D 278 D 278 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 279 A 279 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT H 280 H 280 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 281 A 281 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT P 282 P 282 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 283 I 283 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 284 I 284 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT D 285 D 285 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 286 K 286 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT E 287 E 287 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 288 Q 288 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT F 289 F 289 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 290 Q 290 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 291 Q 291 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT S 292 S 292 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT Q 293 Q 293 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 294 V 294 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 295 K 295 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT I 296 I 296 134 135 135 78 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT A 297 A 297 134 135 135 66 104 117 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT N 298 N 298 134 135 135 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT K 299 K 299 134 135 135 3 5 109 121 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_GDT V 300 V 300 119 135 135 3 3 40 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
LCS_AVERAGE LCS_A: 99.73 ( 99.18 100.00 100.00 )
GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00 3.50 4.00 4.50 5.00 5.50 6.00 6.50 7.00 7.50 8.00 8.50 9.00 9.50 10.00
GDT NUMBER_AT 79 107 122 130 133 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135
GDT PERCENT_AT 58.52 79.26 90.37 96.30 98.52 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL 0.30 0.50 0.77 0.88 0.94 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01
GDT RMS_ALL_AT 1.22 1.16 1.02 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01 1.01
# Checking swapping
# possible swapping detected: Y 174 Y 174
# possible swapping detected: E 189 E 189
# possible swapping detected: E 191 E 191
# possible swapping detected: F 199 F 199
# possible swapping detected: F 202 F 202
# possible swapping detected: Y 211 Y 211
# possible swapping detected: E 270 E 270
# possible swapping detected: E 272 E 272
# possible swapping detected: D 285 D 285
# possible swapping detected: E 287 E 287
# possible swapping detected: F 289 F 289
# Molecule1 Molecule2 DISTANCE Mis MC All Dist_max GDC_mc GDC_all Dist_at
LGA G 165 G 165 0.907 0 0.035 0.035 0.981 81.818 81.818 -
LGA K 166 K 166 0.660 0 0.000 0.123 1.853 90.909 78.788 1.853
LGA W 167 W 167 0.360 0 0.183 0.151 0.597 90.909 94.805 0.274
LGA I 168 I 168 1.021 0 0.164 1.584 3.461 77.727 62.273 2.412
LGA S 169 S 169 0.700 0 0.045 0.080 1.045 77.727 79.091 0.856
LGA G 170 G 170 0.870 0 0.053 0.053 0.870 86.364 86.364 -
LGA L 171 L 171 0.652 0 0.096 1.417 6.206 81.818 51.818 3.852
LGA A 172 A 172 0.608 0 0.035 0.042 0.802 81.818 81.818 -
LGA P 173 P 173 0.527 0 0.037 0.125 0.705 90.909 89.610 0.705
LGA Y 174 Y 174 0.325 0 0.049 0.232 1.336 95.455 88.030 1.336
LGA G 175 G 175 0.520 0 0.079 0.079 0.529 90.909 90.909 -
LGA Y 176 Y 176 0.679 0 0.034 0.172 1.017 77.727 83.485 0.610
LGA Q 177 Q 177 1.060 0 0.061 0.564 1.992 73.636 67.475 1.393
LGA L 178 L 178 0.897 0 0.069 0.261 1.702 73.636 69.773 1.702
LGA N 179 N 179 1.368 0 0.162 0.678 4.901 69.545 41.136 4.901
LGA K 180 K 180 3.086 0 0.291 0.969 12.753 31.364 14.141 12.753
LGA K 181 K 181 2.340 0 0.434 0.943 11.206 55.000 25.051 11.206
LGA T 182 T 182 0.921 0 0.018 1.138 3.451 82.273 68.571 3.451
LGA S 183 S 183 1.113 0 0.145 0.132 1.419 69.545 68.182 1.419
LGA K 184 K 184 0.805 0 0.076 0.807 2.388 77.727 71.515 2.388
LGA L 185 L 185 0.479 0 0.045 0.065 0.701 90.909 95.455 0.260
LGA D 186 D 186 0.429 0 0.058 0.110 0.827 90.909 95.455 0.323
LGA P 187 P 187 0.628 0 0.000 0.115 1.576 70.000 75.065 0.634
LGA V 188 V 188 1.075 0 0.041 0.029 1.318 69.545 67.792 1.318
LGA E 189 E 189 1.021 0 0.063 0.320 1.389 73.636 74.545 1.389
LGA D 190 D 190 0.945 0 0.020 0.045 1.320 81.818 73.636 1.320
LGA E 191 E 191 0.775 0 0.000 0.046 1.342 81.818 76.364 1.342
LGA A 192 A 192 0.397 0 0.035 0.041 0.513 95.455 92.727 -
LGA K 193 K 193 0.433 0 0.059 0.128 1.419 100.000 84.444 1.419
LGA V 194 V 194 0.439 0 0.000 0.044 0.525 100.000 94.805 0.522
LGA V 195 V 195 0.231 0 0.000 0.041 0.451 100.000 100.000 0.243
LGA Q 196 Q 196 0.274 0 0.039 0.260 1.445 100.000 90.303 1.445
LGA L 197 L 197 0.328 0 0.000 0.051 0.472 100.000 100.000 0.472
LGA I 198 I 198 0.265 0 0.028 0.094 0.465 100.000 100.000 0.380
LGA F 199 F 199 0.248 0 0.015 0.027 0.327 100.000 100.000 0.180
LGA N 200 N 200 0.413 0 0.020 0.671 1.779 100.000 87.273 1.779
LGA I 201 I 201 0.224 0 0.000 0.055 0.294 100.000 100.000 0.173
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LGA L 203 L 203 0.477 0 0.065 0.126 1.133 100.000 88.864 0.905
LGA N 204 N 204 0.266 0 0.026 0.064 0.938 100.000 90.909 0.938
LGA G 205 G 205 0.263 0 0.034 0.034 0.331 100.000 100.000 -
LGA L 206 L 206 0.220 0 0.000 0.857 2.867 100.000 84.318 0.895
LGA N 207 N 207 0.670 0 0.049 0.146 0.789 86.364 84.091 0.574
LGA G 208 G 208 0.941 0 0.104 0.104 1.625 70.000 70.000 -
LGA K 209 K 209 1.074 0 0.095 0.225 2.365 69.545 61.010 2.365
LGA D 210 D 210 1.046 0 0.063 0.180 1.058 69.545 75.909 0.223
LGA Y 211 Y 211 1.667 0 0.069 0.625 2.062 58.182 54.697 1.655
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LGA Y 213 Y 213 2.940 0 0.125 1.072 14.271 41.818 14.091 14.271
LGA A 215 A 215 0.999 0 0.165 0.175 1.989 81.818 75.636 -
LGA I 216 I 216 0.353 0 0.000 0.139 0.483 100.000 100.000 0.403
LGA A 217 A 217 0.446 0 0.029 0.054 0.493 100.000 100.000 -
LGA S 218 S 218 0.512 0 0.000 0.086 1.017 90.909 85.152 1.017
LGA H 219 H 219 0.437 0 0.027 0.103 0.791 100.000 94.545 0.791
LGA L 220 L 220 0.419 0 0.000 0.149 0.513 100.000 97.727 0.513
LGA T 221 T 221 0.333 0 0.000 0.017 0.394 100.000 100.000 0.307
LGA N 222 N 222 0.290 0 0.038 0.114 0.578 100.000 97.727 0.578
LGA L 223 L 223 0.635 0 0.039 0.072 0.986 86.364 84.091 0.986
LGA Q 224 Q 224 0.552 0 0.043 0.193 1.287 81.818 76.364 1.023
LGA I 225 I 225 0.554 0 0.054 0.092 0.756 86.364 84.091 0.664
LGA P 226 P 226 0.544 0 0.047 0.100 0.987 81.818 81.818 0.987
LGA T 227 T 227 0.596 0 0.033 0.083 0.800 81.818 81.818 0.800
LGA P 228 P 228 0.850 0 0.039 0.073 0.928 81.818 81.818 0.681
LGA S 229 S 229 0.960 0 0.074 0.088 1.071 77.727 79.091 0.843
LGA G 230 G 230 0.964 0 0.011 0.011 1.017 77.727 77.727 -
LGA K 231 K 231 0.563 0 0.011 0.511 1.148 90.909 84.040 0.727
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LGA Y 237 Y 237 0.895 0 0.029 0.118 1.564 81.818 68.485 1.564
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LGA G 250 G 250 0.321 0 0.010 0.010 0.453 100.000 100.000 -
LGA T 251 T 251 0.554 0 0.101 0.124 0.720 81.818 81.818 0.674
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LGA K 253 K 253 0.413 0 0.048 0.079 1.133 90.909 86.061 1.133
LGA Y 254 Y 254 0.754 0 0.094 0.219 2.515 86.364 62.273 2.515
LGA K 255 K 255 0.649 0 0.091 0.597 3.946 86.364 58.384 3.883
LGA V 256 V 256 1.037 0 0.035 0.060 1.546 77.727 70.390 1.546
LGA R 257 R 257 0.688 0 0.031 1.050 4.494 90.909 59.008 4.494
LGA E 258 E 258 0.645 0 0.020 0.620 3.419 77.727 52.727 3.419
LGA K 259 K 259 0.907 0 0.031 0.308 2.961 81.818 61.010 2.961
LGA T 260 T 260 1.308 0 0.000 0.193 2.024 61.818 55.325 2.024
LGA K 261 K 261 1.419 0 0.049 0.308 2.041 55.000 64.444 1.265
LGA D 262 D 262 2.334 0 0.056 1.048 3.397 38.182 32.955 3.397
LGA G 263 G 263 1.970 0 0.029 0.029 2.081 47.727 47.727 -
LGA K 264 K 264 1.913 0 0.066 0.459 3.342 50.909 47.273 3.342
LGA R 265 R 265 1.720 0 0.037 0.958 4.401 44.545 33.554 4.401
LGA T 266 T 266 1.800 0 0.038 0.041 1.807 50.909 50.909 1.540
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LGA E 272 E 272 1.308 0 0.118 0.153 2.727 69.545 56.768 2.727
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LGA Q 277 Q 277 0.381 0 0.039 0.610 3.157 100.000 73.939 3.157
LGA D 278 D 278 0.410 0 0.112 0.222 0.903 95.455 95.455 0.903
LGA A 279 A 279 0.372 0 0.016 0.039 0.483 100.000 100.000 -
LGA H 280 H 280 0.188 0 0.035 0.150 0.459 100.000 100.000 0.170
LGA A 281 A 281 0.250 0 0.032 0.031 0.466 100.000 100.000 -
LGA P 282 P 282 0.328 0 0.062 0.083 0.672 100.000 94.805 0.672
LGA I 283 I 283 0.291 0 0.051 0.090 0.615 95.455 93.182 0.534
LGA I 284 I 284 0.361 0 0.000 0.058 0.521 90.909 95.455 0.213
LGA D 285 D 285 0.720 0 0.043 0.163 1.408 81.818 77.727 0.834
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LGA E 287 E 287 1.065 0 0.029 0.297 2.099 73.636 64.444 1.480
LGA Q 288 Q 288 0.720 0 0.028 0.327 1.926 81.818 74.747 1.926
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LGA Q 290 Q 290 1.113 0 0.063 0.518 1.307 69.545 69.091 1.113
LGA Q 291 Q 291 0.964 0 0.038 0.072 1.174 77.727 74.545 0.980
LGA S 292 S 292 0.680 0 0.059 0.684 2.784 81.818 72.727 2.784
LGA Q 293 Q 293 1.002 0 0.000 0.229 1.357 69.545 70.909 1.288
LGA V 294 V 294 1.239 0 0.043 0.065 1.430 65.455 65.455 1.430
LGA K 295 K 295 0.702 0 0.040 0.193 0.885 81.818 85.859 0.840
LGA I 296 I 296 0.943 0 0.025 0.089 1.359 73.636 75.682 0.870
LGA A 297 A 297 1.613 0 0.067 0.069 1.978 54.545 53.818 -
LGA N 298 N 298 0.815 0 0.105 0.199 2.131 65.909 60.682 2.131
LGA K 299 K 299 2.637 0 0.424 0.524 12.704 60.000 26.869 12.704
LGA V 300 V 300 1.980 0 0.112 0.109 4.405 54.545 34.286 4.405
# RMSD_GDC results: CA MC common percent ALL common percent GDC_mc GDC_all GDC_at
NUMBER_OF_ATOMS_AA: 135 540 540 100.00 1090 1090 100.00 135 119
SUMMARY(RMSD_GDC): 1.005 0.957 1.851 81.589 75.756 61.681
#CA N1 N2 DIST N RMSD GDT_TS LGA_S3 LGA_Q
SUMMARY(GDT) 136 135 4.0 135 1.01 93.889 97.287 12.217
LGA_LOCAL RMSD: 1.005 Number of atoms: 135 under DIST: 4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD: 1.005 Number of assigned atoms: 135
Std_ASGN_ATOMS RMSD: 1.005 Standard rmsd on all 135 assigned CA atoms
Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules (1=>2)
X_new = 0.794201 * X + -0.345881 * Y + -0.499611 * Z + 151.958969
Y_new = 0.454705 * X + 0.883694 * Y + 0.111035 * Z + 150.721680
Z_new = 0.403098 * X + -0.315360 * Y + 0.859104 * Z + 140.937958
Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
Phi Theta Psi [DEG: Phi Theta Psi ]
XYZ: 0.519977 -0.414900 -0.351809 [DEG: 29.7925 -23.7720 -20.1572 ]
ZXZ: -1.789485 0.537279 2.234675 [DEG: -102.5299 30.7838 128.0375 ]
# END of job
REMARK ----------------------------------------------------------
REMARK Citing LGA:
REMARK Zemla A., LGA - a Method for Finding 3D Similarities in
REMARK Protein Structures, Nucleic Acids Research, 2003, V. 31,
REMARK No. 13, pp. 3370-3374.
REMARK ----------------------------------------------------------
REMARK Superimposed MOLECULES (1=>2) Output: 1 molecule
REMARK 1: T1228v2TS079_1-D2
REMARK 2: T1228v2-D2.pdb
REMARK GDT and LCS analysis
REMARK FIXED Atom-Atom correspondence
REMARK LGA parameters: -3 -ie -o1 -sda -d:4 -gdc_sc -swap T1228v2TS079_1-D2.lga
REMARK #CA N1 N2 DIST N RMSD LGA_S3 RMSD_global
REMARK SUMMARY: 136 135 4.0 135 1.01 97.287 1.01
REMARK ----------------------------------------------------------
MOLECULE T1228v2TS079_1-D2
PFRMAT TS
TARGET T1228v2
MODEL 1
PARENT N/A
ATOM 1345 N GLY 165 153.452 185.179 153.085 1.00 0.00
ATOM 1346 CA GLY 165 153.022 185.962 154.232 1.00 0.00
ATOM 1347 C GLY 165 151.530 185.868 154.494 1.00 0.00
ATOM 1348 O GLY 165 150.978 186.660 155.261 1.00 0.00
ATOM 1349 N LYS 166 150.859 184.930 153.829 1.00 0.00
ATOM 1350 CA LYS 166 149.433 184.725 154.063 1.00 0.00
ATOM 1351 C LYS 166 149.193 183.972 155.368 1.00 0.00
ATOM 1352 CB LYS 166 148.804 183.963 152.895 1.00 0.00
ATOM 1353 O LYS 166 150.062 183.232 155.834 1.00 0.00
ATOM 1354 CG LYS 166 148.866 184.703 151.568 1.00 0.00
ATOM 1355 CD LYS 166 148.192 183.912 150.454 1.00 0.00
ATOM 1356 CE LYS 166 148.255 184.651 149.124 1.00 0.00
ATOM 1357 NZ LYS 166 147.587 183.883 148.031 1.00 0.00
ATOM 1358 N TRP 167 148.038 184.246 155.973 1.00 0.00
ATOM 1359 CA TRP 167 147.675 183.546 157.200 1.00 0.00
ATOM 1360 C TRP 167 146.864 182.293 156.893 1.00 0.00
ATOM 1361 CB TRP 167 146.881 184.469 158.130 1.00 0.00
ATOM 1362 O TRP 167 145.714 182.381 156.455 1.00 0.00
ATOM 1363 CG TRP 167 146.575 183.866 159.469 1.00 0.00
ATOM 1364 CD1 TRP 167 145.399 183.292 159.864 1.00 0.00
ATOM 1365 CD2 TRP 167 147.459 183.784 160.591 1.00 0.00
ATOM 1366 CE2 TRP 167 146.753 183.147 161.634 1.00 0.00
ATOM 1367 CE3 TRP 167 148.783 184.187 160.814 1.00 0.00
ATOM 1368 NE1 TRP 167 145.499 182.857 161.167 1.00 0.00
ATOM 1369 CH2 TRP 167 148.623 183.307 163.076 1.00 0.00
ATOM 1370 CZ2 TRP 167 147.326 182.903 162.884 1.00 0.00
ATOM 1371 CZ3 TRP 167 149.352 183.943 162.058 1.00 0.00
ATOM 1372 N ILE 168 147.468 181.160 157.196 1.00 0.00
ATOM 1373 CA ILE 168 146.816 179.900 156.852 1.00 0.00
ATOM 1374 C ILE 168 146.648 179.047 158.108 1.00 0.00
ATOM 1375 CB ILE 168 147.615 179.125 155.780 1.00 0.00
ATOM 1376 O ILE 168 146.268 177.877 158.024 1.00 0.00
ATOM 1377 CG1 ILE 168 149.097 179.053 156.167 1.00 0.00
ATOM 1378 CG2 ILE 168 147.439 179.771 154.403 1.00 0.00
ATOM 1379 CD1 ILE 168 149.810 177.808 155.658 1.00 0.00
ATOM 1380 N SER 169 146.973 179.515 159.312 1.00 0.00
ATOM 1381 CA SER 169 147.019 178.743 160.550 1.00 0.00
ATOM 1382 C SER 169 145.700 178.836 161.308 1.00 0.00
ATOM 1383 CB SER 169 148.164 179.227 161.440 1.00 0.00
ATOM 1384 O SER 169 145.689 178.878 162.541 1.00 0.00
ATOM 1385 OG SER 169 149.411 179.078 160.781 1.00 0.00
ATOM 1386 N GLY 170 144.577 178.869 160.705 1.00 0.00
ATOM 1387 CA GLY 170 143.300 178.857 161.401 1.00 0.00
ATOM 1388 C GLY 170 142.696 180.240 161.561 1.00 0.00
ATOM 1389 O GLY 170 142.757 181.060 160.644 1.00 0.00
ATOM 1390 N LEU 171 142.193 180.394 162.745 1.00 0.00
ATOM 1391 CA LEU 171 141.528 181.662 163.025 1.00 0.00
ATOM 1392 C LEU 171 142.549 182.771 163.259 1.00 0.00
ATOM 1393 CB LEU 171 140.613 181.529 164.246 1.00 0.00
ATOM 1394 O LEU 171 143.646 182.514 163.763 1.00 0.00
ATOM 1395 CG LEU 171 139.338 180.709 164.050 1.00 0.00
ATOM 1396 CD1 LEU 171 138.842 180.173 165.388 1.00 0.00
ATOM 1397 CD2 LEU 171 138.260 181.549 163.372 1.00 0.00
ATOM 1398 N ALA 172 142.205 183.916 162.843 1.00 0.00
ATOM 1399 CA ALA 172 143.080 185.069 163.037 1.00 0.00
ATOM 1400 C ALA 172 143.315 185.337 164.521 1.00 0.00
ATOM 1401 CB ALA 172 142.486 186.306 162.364 1.00 0.00
ATOM 1402 O ALA 172 142.393 185.226 165.332 1.00 0.00
ATOM 1403 N PRO 173 144.513 185.649 164.848 1.00 0.00
ATOM 1404 CA PRO 173 144.809 185.999 166.240 1.00 0.00
ATOM 1405 C PRO 173 144.050 187.237 166.710 1.00 0.00
ATOM 1406 CB PRO 173 146.317 186.255 166.226 1.00 0.00
ATOM 1407 O PRO 173 143.626 188.056 165.890 1.00 0.00
ATOM 1408 CG PRO 173 146.803 185.617 164.965 1.00 0.00
ATOM 1409 CD PRO 173 145.670 185.589 163.978 1.00 0.00
ATOM 1410 N TYR 174 143.868 187.346 168.004 1.00 0.00
ATOM 1411 CA TYR 174 143.184 188.487 168.605 1.00 0.00
ATOM 1412 C TYR 174 143.840 189.797 168.187 1.00 0.00
ATOM 1413 CB TYR 174 143.178 188.367 170.131 1.00 0.00
ATOM 1414 O TYR 174 145.066 189.928 168.239 1.00 0.00
ATOM 1415 CG TYR 174 142.354 189.429 170.819 1.00 0.00
ATOM 1416 CD1 TYR 174 142.963 190.498 171.471 1.00 0.00
ATOM 1417 CD2 TYR 174 140.964 189.363 170.821 1.00 0.00
ATOM 1418 CE1 TYR 174 142.208 191.477 172.109 1.00 0.00
ATOM 1419 CE2 TYR 174 140.199 190.336 171.454 1.00 0.00
ATOM 1420 OH TYR 174 140.076 192.355 172.723 1.00 0.00
ATOM 1421 CZ TYR 174 140.829 191.388 172.095 1.00 0.00
ATOM 1422 N GLY 175 143.047 190.757 167.667 1.00 0.00
ATOM 1423 CA GLY 175 143.560 192.041 167.215 1.00 0.00
ATOM 1424 C GLY 175 143.643 192.151 165.704 1.00 0.00
ATOM 1425 O GLY 175 143.877 193.236 165.168 1.00 0.00
ATOM 1426 N TYR 176 143.446 190.959 165.112 1.00 0.00
ATOM 1427 CA TYR 176 143.527 190.930 163.656 1.00 0.00
ATOM 1428 C TYR 176 142.282 190.289 163.054 1.00 0.00
ATOM 1429 CB TYR 176 144.776 190.169 163.202 1.00 0.00
ATOM 1430 O TYR 176 141.521 189.616 163.754 1.00 0.00
ATOM 1431 CG TYR 176 146.061 190.934 163.409 1.00 0.00
ATOM 1432 CD1 TYR 176 146.428 191.965 162.547 1.00 0.00
ATOM 1433 CD2 TYR 176 146.911 190.628 164.467 1.00 0.00
ATOM 1434 CE1 TYR 176 147.612 192.671 162.733 1.00 0.00
ATOM 1435 CE2 TYR 176 148.097 191.328 164.662 1.00 0.00
ATOM 1436 OH TYR 176 149.611 193.042 163.980 1.00 0.00
ATOM 1437 CZ TYR 176 148.438 192.346 163.792 1.00 0.00
ATOM 1438 N GLN 177 141.996 190.632 161.852 1.00 0.00
ATOM 1439 CA GLN 177 141.035 189.928 161.010 1.00 0.00
ATOM 1440 C GLN 177 141.676 189.479 159.699 1.00 0.00
ATOM 1441 CB GLN 177 139.820 190.814 160.723 1.00 0.00
ATOM 1442 O GLN 177 142.628 190.102 159.223 1.00 0.00
ATOM 1443 CG GLN 177 140.131 192.017 159.844 1.00 0.00
ATOM 1444 CD GLN 177 138.897 192.837 159.516 1.00 0.00
ATOM 1445 NE2 GLN 177 138.910 193.488 158.357 1.00 0.00
ATOM 1446 OE1 GLN 177 137.941 192.885 160.296 1.00 0.00
ATOM 1447 N LEU 178 141.155 188.422 159.200 1.00 0.00
ATOM 1448 CA LEU 178 141.681 187.896 157.945 1.00 0.00
ATOM 1449 C LEU 178 141.082 188.633 156.752 1.00 0.00
ATOM 1450 CB LEU 178 141.393 186.396 157.829 1.00 0.00
ATOM 1451 O LEU 178 139.859 188.728 156.626 1.00 0.00
ATOM 1452 CG LEU 178 142.042 185.670 156.650 1.00 0.00
ATOM 1453 CD1 LEU 178 143.548 185.555 156.862 1.00 0.00
ATOM 1454 CD2 LEU 178 141.416 184.293 156.460 1.00 0.00
ATOM 1455 N ASN 179 141.907 189.200 155.913 1.00 0.00
ATOM 1456 CA ASN 179 141.462 189.803 154.662 1.00 0.00
ATOM 1457 C ASN 179 141.126 188.744 153.616 1.00 0.00
ATOM 1458 CB ASN 179 142.523 190.765 154.122 1.00 0.00
ATOM 1459 O ASN 179 142.008 188.013 153.162 1.00 0.00
ATOM 1460 CG ASN 179 142.037 191.559 152.925 1.00 0.00
ATOM 1461 ND2 ASN 179 142.372 192.843 152.891 1.00 0.00
ATOM 1462 OD1 ASN 179 141.367 191.023 152.040 1.00 0.00
ATOM 1463 N LYS 180 139.988 188.667 153.253 1.00 0.00
ATOM 1464 CA LYS 180 139.512 187.621 152.353 1.00 0.00
ATOM 1465 C LYS 180 140.122 187.773 150.962 1.00 0.00
ATOM 1466 CB LYS 180 137.985 187.646 152.261 1.00 0.00
ATOM 1467 O LYS 180 140.200 186.803 150.204 1.00 0.00
ATOM 1468 CG LYS 180 137.281 187.252 153.552 1.00 0.00
ATOM 1469 CD LYS 180 135.773 187.157 153.359 1.00 0.00
ATOM 1470 CE LYS 180 135.070 186.729 154.641 1.00 0.00
ATOM 1471 NZ LYS 180 133.592 186.630 154.455 1.00 0.00
ATOM 1472 N LYS 181 140.551 188.987 150.576 1.00 0.00
ATOM 1473 CA LYS 181 141.117 189.233 149.254 1.00 0.00
ATOM 1474 C LYS 181 142.604 188.891 149.221 1.00 0.00
ATOM 1475 CB LYS 181 140.905 190.690 148.841 1.00 0.00
ATOM 1476 O LYS 181 143.069 188.206 148.306 1.00 0.00
ATOM 1477 CG LYS 181 139.514 190.984 148.300 1.00 0.00
ATOM 1478 CD LYS 181 139.392 192.426 147.823 1.00 0.00
ATOM 1479 CE LYS 181 137.987 192.734 147.324 1.00 0.00
ATOM 1480 NZ LYS 181 137.853 194.157 146.891 1.00 0.00
ATOM 1481 N THR 182 143.300 189.306 150.300 1.00 0.00
ATOM 1482 CA THR 182 144.746 189.118 150.291 1.00 0.00
ATOM 1483 C THR 182 145.138 187.897 151.118 1.00 0.00
ATOM 1484 CB THR 182 145.474 190.363 150.832 1.00 0.00
ATOM 1485 O THR 182 146.257 187.393 150.997 1.00 0.00
ATOM 1486 CG2 THR 182 145.093 191.610 150.041 1.00 0.00
ATOM 1487 OG1 THR 182 145.119 190.556 152.207 1.00 0.00
ATOM 1488 N SER 183 144.206 187.380 151.946 1.00 0.00
ATOM 1489 CA SER 183 144.438 186.280 152.876 1.00 0.00
ATOM 1490 C SER 183 145.509 186.639 153.902 1.00 0.00
ATOM 1491 CB SER 183 144.849 185.015 152.120 1.00 0.00
ATOM 1492 O SER 183 146.191 185.758 154.429 1.00 0.00
ATOM 1493 OG SER 183 143.790 184.556 151.297 1.00 0.00
ATOM 1494 N LYS 184 145.797 187.859 154.019 1.00 0.00
ATOM 1495 CA LYS 184 146.718 188.355 155.036 1.00 0.00
ATOM 1496 C LYS 184 145.961 188.953 156.218 1.00 0.00
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ATOM 2101 OE2 GLU 258 158.144 166.773 162.564 1.00 0.00
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ATOM 2107 CG LYS 259 151.200 166.302 168.272 1.00 0.00
ATOM 2108 CD LYS 259 149.685 166.464 168.268 1.00 0.00
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ATOM 2111 N THR 260 154.510 164.608 167.524 1.00 0.00
ATOM 2112 CA THR 260 154.914 163.215 167.372 1.00 0.00
ATOM 2113 C THR 260 153.718 162.283 167.540 1.00 0.00
ATOM 2114 CB THR 260 156.010 162.836 168.384 1.00 0.00
ATOM 2115 O THR 260 152.663 162.699 168.025 1.00 0.00
ATOM 2116 CG2 THR 260 157.339 163.494 168.029 1.00 0.00
ATOM 2117 OG1 THR 260 155.612 163.264 169.693 1.00 0.00
ATOM 2118 N LYS 261 153.786 161.135 166.895 1.00 0.00
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ATOM 2129 C ASP 262 152.433 161.091 171.443 1.00 0.00
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ATOM 2131 O ASP 262 152.173 161.103 172.648 1.00 0.00
ATOM 2132 CG ASP 262 155.141 158.349 171.023 1.00 0.00
ATOM 2133 OD1 ASP 262 154.459 157.404 170.575 1.00 0.00
ATOM 2134 OD2 ASP 262 156.391 158.318 171.062 1.00 0.00
ATOM 2135 N GLY 263 152.120 162.077 170.612 1.00 0.00
ATOM 2136 CA GLY 263 151.374 163.231 171.086 1.00 0.00
ATOM 2137 C GLY 263 152.264 164.355 171.582 1.00 0.00
ATOM 2138 O GLY 263 151.772 165.399 172.014 1.00 0.00
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ATOM 2148 N ARG 265 154.794 167.424 171.322 1.00 0.00
ATOM 2149 CA ARG 265 155.099 168.478 170.361 1.00 0.00
ATOM 2150 C ARG 265 156.586 168.816 170.372 1.00 0.00
ATOM 2151 CB ARG 265 154.274 169.732 170.658 1.00 0.00
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ATOM 2435 N VAL 300 161.043 186.617 187.640 1.00 0.00
ATOM 2436 CA VAL 300 161.065 185.880 188.899 1.00 0.00
ATOM 2437 C VAL 300 159.653 185.419 189.254 1.00 0.00
ATOM 2438 CB VAL 300 161.651 186.734 190.047 1.00 0.00
ATOM 2439 O VAL 300 158.703 186.200 189.184 1.00 0.00
ATOM 2440 CG1 VAL 300 161.761 185.912 191.330 1.00 0.00
ATOM 2441 CG2 VAL 300 163.015 187.296 189.650 1.00 0.00
TER
END