PFRMAT AL 
TARGET T0068 
AUTHOR 4438-1214-3249 
METHOD H3P2 method (Rice and Eisenberg) and SDP method (Fischer & Eisenberg) 
METHOD both gave a strong match to 1rmg.  Inspection of gaps and  
METHOD insertions in the alignment showed they were in reasonable places. 
MODEL 1 
PARENT 1rmg 
T 16 G 27 
T 17 A 28 
L 18 V 29 
K 19 A 30 
A 20 D 31 
D 21 N 32 
S 22 S 33 
S 23 T 34 
T 24 D 35 
A 25 V 36 
T 26 G 37 
S 27 P 38 
T 28 A 39 
I 29 I 40 
Q 30 T 41 
K 31 S 42 
A 32 A 43 
L 33 W 44 
N 34 A 45 
N 35 A 46 
C 36 C 47 
D 37 K 48 
Q 38 S 49 
G 39 G 50 
K 40 G 51 
A 41 L 52 
V 42 V 53 
R 43 Y 54 
L 44 I 55 
S 45 P 56 
S 54 S 57 
G 55 G 58 
P 56 N 59 
L 57 Y 60 
S 58 A 61 
L 59 L 62 
P 60 N 63 
S 61 T 64 
G 62 W 65 
V 63 V 66 
S 64 T 67 
L 65 L 68 
L 66 T 69 
I 67 G 70 
D 68 G 71 
K 69 S 72 
G 70 A 73 
V 71 T 74 
T 72 A 75 
L 73 I 76 
R 74 Q 77 
A 75 L 78 
V 76 D 79 
G 90 G 80 
V 91 I 81 
V 92 I 82 
D 93 Y 83 
K 94 R 84 
N 95 T 85 
G 96 G 86 
K 97 T 87 
G 98 A 88 
C 99 S 89 
D 100 G 90 
A 101 N 91 
F 102 M 92 
I 103 I 93 
T 104 A 94 
A 105 V 95 
V 106 T 96 
S 107 D 97 
T 108 T 98 
T 109 T 99 
N 110 D 100 
S 111 F 101 
G 112 E 102 
I 113 L 103 
Y 114 F 104 
G 115 S 108 
P 116 K 109 
G 117 G 110 
T 118 A 111 
I 119 V 112 
D 120 Q 113 
G 121 G 114 
Q 122 F 115 
G 123 G 116 
G 124 Y 117 
V 125 V 118 
K 126 Y 119 
L 127 H 120 
Q 128 A 121 
D 129 E 122 
K 147 G 123 
Q 148 T 124 
N 149 Y 125 
T 150 G 126 
P 151 A 127 
R 152 R 128 
L 153 I 129 
I 154 L 130 
Q 155 R 131 
I 156 L 132 
N 157 T 133 
K 158 D 134 
S 159 V 135 
K 160 T 136 
N 161 H 137 
F 162 F 138 
T 163 S 139 
L 164 V 140 
Y 165 H 141 
N 166 D 142 
V 167 I 143 
S 168 I 144 
L 169 L 145 
I 170 V 146 
N 171 D 147 
S 172 A 148 
P 173 P 149 
N 174 A 150 
F 175 F 151 
H 176 H 152 
V 177 F 153 
V 178 T 154 
F 179 M 155 
S 180 D 156 
D 181 T 157 
G 182 C 158 
D 183 S 159 
G 184 D 160 
F 185 G 161 
T 186 E 162 
A 187 V 163 
W 188 Y 164 
K 189 N 165 
T 190 M 166 
T 191 A 167 
I 192 I 168 
K 193 R 169 
T 194 G 170 
S 196 G 171 
T 197 N 172 
A 198 E 173 
R 199 G 174 
N 200 G 175 
T 201 L 176 
D 202 D 177 
G 203 G 178 
I 204 I 179 
D 205 D 180 
P 206 V 181 
M 207 W 182 
S 208 G 183 
S 209 S 184 
N 211 N 185 
I 212 I 186 
T 213 W 187 
I 214 V 188 
A 215 H 189 
Y 216 D 190 
S 217 V 191 
N 218 E 192 
I 219 V 193 
A 220 T 194 
T 221 N 195 
G 222 K 196 
D 223 D 197 
D 224 E 198 
N 225 C 199 
V 226 V 200 
A 227 T 201 
I 228 V 202 
K 229 K 203 
A 230 S 204 
R 234 P 205 
A 235 A 206 
E 236 N 207 
T 237 N 208 
R 238 I 209 
N 239 L 210 
I 240 V 211 
S 241 E 212 
I 242 S 213 
L 243 I 214 
H 244 Y 215 
N 245 C 216 
D 246 N 217 
F 247 W 218 
G 248 S 219 
T 249 G 220 
G 250 G 221 
H 251 C 222 
G 252 A 223 
M 253 M 224 
S 254 G 225 
I 255 S 226 
G 256 L 227 
S 257 G 228 
E 258 A 229 
T 259 D 230 
M 260 T 231 
G 261 D 232 
V 262 V 233 
Y 263 T 234 
N 264 D 235 
V 265 I 236 
T 266 V 237 
V 267 Y 238 
D 268 R 239 
D 269 N 240 
L 270 V 241 
M 272 Y 242 
N 273 T 243 
G 274 W 244 
T 275 S 245 
T 276 S 246 
N 277 N 247 
G 278 Q 248 
L 279 M 249 
R 280 Y 250 
I 281 M 251 
K 282 I 252 
S 283 K 253 
D 284 S 254 
K 285 N 255 
S 286 G 256 
A 287 G 257 
A 288 S 258 
G 289 G 259 
V 290 T 260 
V 291 V 261 
N 292 S 262 
G 293 N 263 
V 294 V 264 
R 295 L 265 
Y 296 L 266 
S 297 E 267 
N 298 N 268 
V 299 F 269 
V 300 I 270 
M 301 G 271 
K 302 H 272 
N 303 G 273 
V 304 N 274 
A 305 A 275 
K 306 Y 276 
P 307 S 277 
I 308 L 278 
V 309 D 279 
I 310 I 280 
D 311 D 281 
T 312 G 282 
V 313 Y 283 
Y 314 W 284 
E 315 S 285 
K 316 S 286 
K 317 G 292 
E 318 D 293 
G 319 G 294 
S 320 V 295 
N 321 Q 296 
V 322 L 297 
P 323 N 298 
D 324 N 299 
W 325 I 300 
S 326 T 301 
D 327 V 302 
I 328 K 303 
T 329 N 304 
F 330 W 305 
K 331 K 306 
D 332 E 309 
V 333 A 310 
T 334 N 311 
S 335 G 312 
E 336 A 313 
T 337 T 314 
K 338 R 315 
G 339 P 316 
V 340 P 317 
V 341 I 318 
V 342 R 319 
L 343 V 320 
N 344 V 321 
G 345 C 322 
E 346 S 323 
N 347 D 324 
A 348 T 325 
K 349 A 326 
K 350 P 327 
P 351 C 328 
I 352 T 329 
E 353 D 330 
V 354 L 331 
T 355 T 332 
M 356 L 333 
K 357 E 334 
N 358 D 335 
V 359 I 336 
K 360 A 337 
L 361 I 338 
T 362 W 339 
S 363 T 340 
D 364 E 341 
S 365 S 342 
TER 
END 
